Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr20 | 36766724 | . | T | A | CCDS13302.1:NM_004613.2:c.1406gAg>gTg_NP_004604.2:p.469E>V | Homo sapiens transglutaminase 2 (TGM2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 4pyg | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-02-11 | GLU | A:469 | A:469 | 93.0 | 0.489 | -113.1 | -10.6 | 93.0 | 0.489 | 0.0 |
HOH |
3.052 |
OE1 |
O |
|||
| GLU | B:469 | B:469 | 105.0 | 0.553 | -62.2 | -24.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | C:469 | E:469 | 111.0 | 0.584 | -73.5 | -31.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6a8p | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-09-26 | GLU | A:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | C:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6kzb | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-12-09 | GLU | A:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | C:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3s3j | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-06-06 | GLU | A:476 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3s3p | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-06-06 | GLU | A:476 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3s3s | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-06-06 | GLU | A:476 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3ly6 | 1 | P21980 | 99.85 | 0.0 |
X-RAY |
2010-08-18 | GLU | A:469 | A:469 | 115.0 | 0.605 | T | -99.3 | -42.4 | 115.0 | 0.605 | 0.0 | ||||||
| GLU | B:469 | B:469 | 116.0 | 0.611 | T | -99.1 | -43.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | C:469 | C:469 | 116.0 | 0.611 | T | -99.3 | -42.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1kv3 | 1 | P21980 | 99.27 | 0.0 |
X-RAY |
2002-03-13 | GLU | A:469 | A:469 | 98.0 | 0.516 | -29.7 | -45.3 | 98.0 | 0.516 | 0.0 | |||||||
| GLU | B:469 | B:469 | 95.0 | 0.5 | -30.9 | -45.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | C:469 | C:469 | 98.0 | 0.516 | -30.1 | -45.3 | 98.0 | 0.516 | 0.0 |
HOH |
2.374 |
OE1 |
O |
||||||||||
| GLU | D:469 | D:469 | 96.0 | 0.505 | -29.9 | -44.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | E:469 | E:469 | 97.0 | 0.511 | -30.5 | -45.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| GLU | F:469 | F:469 | 98.0 | 0.516 | -29.8 | -45.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2q3z | 1 | P21980 | 99.27 | 0.0 |
X-RAY |
2007-10-23 | GLU | A:469 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p21980-f1 | 1 | P21980 | 100.0 | 0.0 | GLU | A:469 | A:469 | 155.0 | 0.816 | -62.0 | 106.5 | ||