Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr21 | 33039648 | . | C | A | CCDS33536.1:NM_000454.4:c.317tCa>tAa_NP_000445.1:p.106S>* | Homo sapiens superoxide dismutase 1, soluble (SOD1), mRNA. |
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PDB
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O |
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SER | D:105 | D:106 | 20.0 | 0.174 | -112.4 | 157.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
SER | E:105 | E:106 | 12.0 | 0.104 | B | -153.8 | 155.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:105 | F:106 | 13.0 | 0.113 | B | -152.1 | 156.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | G:105 | G:106 | 12.0 | 0.104 | B | -154.0 | 156.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
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3kh4 | 1 | P00441 | 100.0 | 7e-109 |
X-RAY |
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3re0 | 1 | P00441 | 100.0 | 7e-109 |
X-RAY |
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N1 O |
||
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O CB |
PT1 O |
|||||||||
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X-RAY |
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||
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OG |
O |
||||||||||
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X-RAY |
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O O |
C O |
||
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X-RAY |
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9JK 9JK HOH |
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O O OG |
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||
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9JK 9JK HOH |
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|||||||||
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X-RAY |
2018-06-13 | SER | A:105 | A:105 | 7.0 | 0.061 | B | -145.0 | 165.2 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
9JT 9JT HOH |
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O O OG |
SE1 C05 O |
||
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O O OG |
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|||||||||
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X-RAY |
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D7Z D7Z |
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O O |
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||
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D7Z |
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O |
CL1 |
|||||||||
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1hl4 | 1 | P00441 | 100.0 | 7e-109 |
X-RAY |
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O |
||
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O |
|||||||||
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X-RAY |
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X-RAY |
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O |
|||||||||
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X-RAY |
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O |
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||
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O |
||
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|||||||||
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X-RAY |
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OG |
O |
||
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|||||||||
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X-RAY |
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N |
O |
|||
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HOH |
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OG |
O |
|||||||||
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X-RAY |
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HOH |
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O |
||
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O |
|||||||||
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X-RAY |
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OG |
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||
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OG |
O |
||
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X-RAY |
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OAB O |
||
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5FW HOH |
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OAB O |
|||||||||
4a7u | 1 | P00441 | 99.35 | 3e-108 |
X-RAY |
2012-11-28 | SER | A:105 | A:105 | 7.0 | 0.061 | B | -145.5 | 165.0 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
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C9 O1 O |
||
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HOH |
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X-RAY |
2012-11-28 | SER | A:105 | A:105 | 7.0 | 0.061 | B | -144.4 | 165.7 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
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||
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HOH |
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|||||||||
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X-RAY |
2010-12-08 | SER | A:105 | A:105 | 14.0 | 0.122 | B | -149.9 | 162.9 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
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O |
||
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|||||||||
3gzp | 1 | P00441 | 99.35 | 3e-108 |
X-RAY |
2009-10-13 | SER | A:105 | A:105 | 12.0 | 0.104 | B | -156.4 | 144.9 | 12.0 | 0.104 | 0.0 | ||||||
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