Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr21 | 42647372 | . | G | A | CCDS13668.1:NM_012105.4:c.1378Gct>Act_NP_036237.2:p.460A>T | Homo sapiens beta-site APP-cleaving enzyme 2 (BACE2), transcript variant a, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6uj0 | 1 | Q9Y5Z0 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ALA | A:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:460 | B:398 | 153.0 | 1.0 | -88.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6uj1 | 1 | Q9Y5Z0 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-07 | ALA | A:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:460 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zkm | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zkn | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zkq | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | A:398 | 147.0 | 1.0 | -118.2 | 360.0 | 147.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.621 |
N |
O |
|||
| 3zks | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4bel | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4bfb | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6jsz | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-08-28 | ALA | A:386 | A:398 | 144.0 | 1.0 | -162.5 | 360.0 | 144.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.853 |
O |
O |
|||
| 7d5b | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-31 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7d5u | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-31 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7n4n | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-10-06 | ALA | A:386 | A:398 | 135.0 | 1.0 | -150.3 | 360.0 | 135.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
7.008 |
HB1 |
O |
|||
| 3zkg | 1 | Q9Y5Z0 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zki | 1 | Q9Y5Z0 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zkx | 1 | Q9Y5Z0 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3zl7 | 1 | Q9Y5Z0 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-29 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3zlq | 1 | Q9Y5Z0 | 99.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-01 | ALA | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2ewy | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-11-07 | ALA | A:383 | A:398 | 175.0 | NA | -107.9 | 360.0 | 175.0 | NA | NA |
HOH |
9.574 |
CB |
O |
|||
| ALA | B:383 | B:398 | 173.0 | NA | -107.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ALA | C:383 | C:398 | 174.0 | NA | -107.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ALA | D:383 | D:398 | 174.0 | NA | -107.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q9y5z0-f1 | 1 | Q9Y5Z0 | 100.0 | 0.0 | ALA | A:460 | A:460 | 94.0 | 0.817 | -57.9 | 127.5 | ||