Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr21 | 27269931 | . | G | A | CCDS13576.1:NM_000484.3:c.2018gCa>gTa_NP_000475.1:p.673A>V | Homo sapiens amyloid beta precursor protein (APP), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5buo | 1 | P05067 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-07-13 | ALA | A:305 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:305 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2lp1 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-62 |
NMR |
2012-06-06 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7b3j | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-30 |
NMR |
2021-01-13 | ALA | A:2 | A:2 | 80.0 | 0.696 | 48.0 | 41.4 | 80.0 | 0.696 | 0.0 |
DAR |
7.905 |
H |
HH22 |
|||
7b3k | 1 | P05067 | 98.18 | 1e-29 |
NMR |
2021-01-13 | ALA | A:2 | A:2 | 33.0 | 0.287 | -159.8 | -5.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
DAR |
6.333 |
HB3 |
HH11 |
|||
2mxu | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
SOLID-STATE NMR |
2015-05-06 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2nao | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
NMR |
2016-07-27 | ALA | A:2 | A:2 | 83.0 | 0.722 | -102.3 | 102.2 | 33.0 | 0.287 | 0.435 |
B:P05067:0.435 |
||||||
ALA | B:2 | B:2 | 83.0 | 0.722 | -102.4 | 102.2 | 28.0 | 0.243 | 0.479 |
A:P05067:0.052 C:P05067:0.417 |
|||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 83.0 | 0.722 | -102.3 | 102.2 | 77.0 | 0.67 | 0.052 |
B:P05067:0.052 |
|||||||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 85.0 | 0.739 | -102.4 | 102.2 | 35.0 | 0.304 | 0.435 |
E:P05067:0.435 |
|||||||||||||
ALA | E:2 | E:2 | 84.0 | 0.73 | -102.4 | 102.2 | 28.0 | 0.243 | 0.487 |
D:P05067:0.07 F:P05067:0.426 |
|||||||||||||
ALA | F:2 | F:2 | 83.0 | 0.722 | -102.4 | 102.2 | 75.0 | 0.652 | 0.07 |
E:P05067:0.07 |
|||||||||||||
2wk3 | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
X-RAY |
2009-11-03 | ALA | C:2 | C:2 | 99.0 | 0.861 | -63.8 | 135.6 | NA | NA | NA | |||||||
ALA | D:2 | D:2 | 94.0 | 0.817 | -69.5 | 141.9 | 33.0 | 0.287 | 0.53 |
B:P14735:0.53 |
HOH |
4.791 |
N |
O |
|||||||||
5kk3 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
SOLID-STATE NMR |
2016-07-13 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | Q:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | R:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5oqv | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
EM |
2017-09-13 | ALA | A:2 | A:2 | 98.0 | 0.852 | -160.4 | 110.9 | 4.0 | 0.035 | 0.817 |
F:P05067:0.209 H:P05067:0.443 C:P05067:0.409 |
||||||
ALA | B:2 | B:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 111.0 | 5.0 | 0.043 | 0.818 |
G:P05067:0.217 I:P05067:0.435 D:P05067:0.4 |
|||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 100.0 | 0.87 | -160.4 | 111.0 | 4.0 | 0.035 | 0.835 |
H:P05067:0.209 A:P05067:0.452 E:P05067:0.417 |
|||||||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 111.0 | 46.0 | 0.4 | 0.461 |
I:P05067:0.209 B:P05067:0.435 |
|||||||||||||
ALA | E:2 | E:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 111.0 | 44.0 | 0.383 | 0.478 |
C:P05067:0.443 A:P05067:0.209 |
|||||||||||||
ALA | F:2 | F:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 110.9 | 51.0 | 0.443 | 0.418 |
H:P05067:0.417 |
|||||||||||||
ALA | G:2 | G:2 | 98.0 | 0.852 | -160.4 | 111.0 | 52.0 | 0.452 | 0.4 |
I:P05067:0.4 |
|||||||||||||
ALA | H:2 | H:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 111.0 | 8.0 | 0.07 | 0.791 |
F:P05067:0.435 A:P05067:0.417 |
|||||||||||||
ALA | I:2 | I:2 | 99.0 | 0.861 | -160.4 | 111.0 | 9.0 | 0.078 | 0.783 |
G:P05067:0.435 B:P05067:0.409 |
|||||||||||||
6rhy | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
NMR |
2019-09-25 | ALA | A:2 | A:2 | 65.0 | 0.565 | -123.9 | 88.4 | 65.0 | 0.565 | 0.0 | |||||||
ALA | B:2 | B:2 | 87.0 | 0.757 | -131.1 | 32.7 | 87.0 | 0.757 | 0.0 | ||||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 65.0 | 0.565 | -124.4 | 88.0 | 65.0 | 0.565 | 0.0 | ||||||||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 87.0 | 0.757 | -130.3 | 32.7 | 87.0 | 0.757 | 0.0 | ||||||||||||||
6szf | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
NMR |
2020-10-14 | ALA | A:2 | A:2 | 68.0 | 0.591 | -107.8 | -40.3 | 68.0 | 0.591 | 0.0 | |||||||
6ti6 | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
SOLID-STATE NMR |
2020-07-22 | ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6ti7 | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
SOLID-STATE NMR |
2020-07-22 | ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7q4b | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
EM |
2021-11-24 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7q4m | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-22 |
EM |
2021-11-24 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2g47 | 2 | ? | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2006-10-24 | ALA | C:2 | C:2 | 93.0 | 0.809 | -82.7 | 130.3 | 43.0 | 0.374 | 0.435 |
A:P14735:0.435 |
HOH |
3.333 |
CB |
O |
||
ALA | D:2 | D:2 | 91.0 | 0.791 | -81.1 | 139.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2lfm | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
NMR |
2011-07-20 | ALA | A:2 | A:2 | 73.0 | 0.635 | -113.7 | 135.2 | 73.0 | 0.635 | 0.0 | |||||||
2lmn | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2011-12-28 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2lmo | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2011-12-28 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2lmp | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2011-12-28 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | Q:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | R:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2lmq | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2011-12-28 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | Q:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | R:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2m4j | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2013-09-25 | ALA | A:2 | A:2 | 85.0 | 0.739 | -76.9 | 129.4 | 57.0 | 0.496 | 0.243 |
D:P05067:0.243 |
||||||
ALA | B:2 | B:2 | 87.0 | 0.757 | -76.4 | 128.7 | 58.0 | 0.504 | 0.253 |
E:P05067:0.252 |
|||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 87.0 | 0.757 | -76.9 | 128.7 | 58.0 | 0.504 | 0.253 |
F:P05067:0.252 |
|||||||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 86.0 | 0.748 | -77.3 | 129.8 | 39.0 | 0.339 | 0.409 |
G:P05067:0.235 A:P05067:0.174 |
|||||||||||||
ALA | E:2 | E:2 | 89.0 | 0.774 | -77.2 | 128.2 | 40.0 | 0.348 | 0.426 |
H:P05067:0.235 B:P05067:0.2 |
|||||||||||||
ALA | F:2 | F:2 | 87.0 | 0.757 | -76.6 | 129.0 | 40.0 | 0.348 | 0.409 |
C:P05067:0.174 I:P05067:0.235 |
|||||||||||||
ALA | G:2 | G:2 | 86.0 | 0.748 | -76.5 | 130.3 | 65.0 | 0.565 | 0.183 |
D:P05067:0.183 |
|||||||||||||
ALA | H:2 | H:2 | 89.0 | 0.774 | -76.8 | 129.5 | 66.0 | 0.574 | 0.2 |
E:P05067:0.2 |
|||||||||||||
ALA | I:2 | I:2 | 87.0 | 0.757 | -76.2 | 129.8 | 65.0 | 0.565 | 0.192 |
F:P05067:0.191 |
|||||||||||||
2m9r | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
NMR |
2013-09-11 | ALA | A:2 | A:2 | 75.0 | 0.652 | -86.3 | 130.3 | 75.0 | 0.652 | 0.0 | |||||||
2m9s | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
NMR |
2013-09-11 | ALA | A:2 | A:2 | 84.0 | 0.73 | -85.6 | 131.0 | 84.0 | 0.73 | 0.0 | |||||||
2otk | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
NMR |
2008-02-12 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3ifn | 3 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2009-11-17 | ALA | C:2 | P:2 | 161.0 | 1.0 | 360.0 | 122.0 | 105.0 | 0.913 | 0.087 |
B:None:0.487 |
HOH |
3.402 |
CA |
O |
||
4m1c | 4 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2014-08-06 | ALA | G:2 | G:2 | 78.0 | 0.678 | -69.5 | 157.4 | 10.0 | 0.087 | 0.591 |
A:P14735:0.591 |
||||||
ALA | H:2 | H:2 | 107.0 | 0.93 | 54.9 | 54.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
4mvi | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2015-08-12 | ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
4mvl | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2015-08-12 | ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4nge | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2014-05-14 | ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ong | 3 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
X-RAY |
2014-06-11 | ALA | C:2 | P:2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
ZN ZN ZN ZN HOH |
3.709 8.602 6.969 6.280 1.821 |
C O CB O N |
ZN ZN ZN ZN O |
||
6oc9 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2019-06-05 | ALA | A:2 | A:2 | 52.0 | 0.452 | -46.8 | 158.6 | 30.0 | 0.261 | 0.191 |
B:P05067:0.191 |
2PO |
6.430 |
HB2 |
O1P |
||
ALA | B:2 | B:2 | 66.0 | 0.574 | -169.7 | 88.5 | 26.0 | 0.226 | 0.348 |
A:P05067:0.035 C:P05067:0.322 |
2PO 2PO 2PO |
3.912 7.114 9.808 |
HA C O |
O1P O3P O3P |
|||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 51.0 | 0.443 | -51.7 | -173.3 | 38.0 | 0.33 | 0.113 |
B:P05067:0.113 |
2PO 2PO 2PO |
7.543 8.511 6.851 |
HA O C |
O1P O1P O3P |
|||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 65.0 | 0.565 | T | -94.0 | 80.3 | 47.0 | 0.409 | 0.156 |
C:P05067:0.157 |
2PO |
5.331 |
O |
O1P |
||||||||
ALA | E:2 | E:2 | 109.0 | 0.948 | T | -75.6 | 71.4 | 40.0 | 0.348 | 0.6 |
D:P05067:0.53 C:P05067:0.061 |
2PO 2PO |
5.573 5.297 |
HB1 C |
O1P O1P |
||||||||
ALA | F:2 | F:2 | 98.0 | 0.852 | -98.8 | -75.0 | 63.0 | 0.548 | 0.304 |
G:P05067:0.304 |
2PO 2PO |
7.173 6.356 |
H HB2 |
O3P O2P |
|||||||||
ALA | G:2 | G:2 | 65.0 | 0.565 | -84.6 | -79.7 | 54.0 | 0.47 | 0.095 |
F:P05067:0.078 H:P05067:0.009 |
2PO 2PO 2PO |
8.388 4.661 5.703 |
O O HB1 |
O2P O2P O1P |
|||||||||
ALA | H:2 | H:2 | 55.0 | 0.478 | 56.9 | 177.6 | 47.0 | 0.409 | 0.069 |
I:P05067:0.07 |
2PO 2PO |
6.372 6.653 |
C O |
O1P O1P |
|||||||||
ALA | I:2 | I:2 | 72.0 | 0.626 | -174.6 | -20.3 | 28.0 | 0.243 | 0.383 |
H:P05067:0.374 |
2PO 2PO 2PO |
8.723 6.060 7.664 |
O O H |
O2P O1P O1P |
|||||||||
ALA | J:2 | J:2 | 52.0 | 0.452 | -87.8 | 121.5 | 18.0 | 0.157 | 0.295 |
I:P05067:0.296 |
2PO 2PO |
7.910 3.404 |
HB1 O |
O3P O1P |
|||||||||
6shs | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
EM |
2019-11-06 | ALA | A:2 | A:2 | 74.0 | 0.643 | -168.9 | 149.8 | 15.0 | 0.13 | 0.513 |
C:P05067:0.078 G:P05067:0.435 |
||||||
ALA | B:2 | B:2 | 74.0 | 0.643 | -168.9 | 149.8 | 14.0 | 0.122 | 0.521 |
H:P05067:0.435 D:P05067:0.078 |
|||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 75.0 | 0.652 | -168.9 | 149.9 | 14.0 | 0.122 | 0.53 |
A:P05067:0.443 E:P05067:0.087 |
|||||||||||||
ALA | D:2 | H:2 | 74.0 | 0.643 | -168.9 | 149.7 | 14.0 | 0.122 | 0.521 |
F:P05067:0.078 B:P05067:0.443 |
|||||||||||||
ALA | E:2 | D:2 | 75.0 | 0.652 | -168.9 | 149.8 | 24.0 | 0.209 | 0.443 |
C:P05067:0.443 |
|||||||||||||
ALA | F:2 | I:2 | 75.0 | 0.652 | -168.9 | 149.8 | 24.0 | 0.209 | 0.443 |
D:P05067:0.443 |
|||||||||||||
ALA | G:2 | E:2 | 75.0 | 0.652 | -168.9 | 149.9 | 14.0 | 0.122 | 0.53 |
I:P05067:0.452 A:P05067:0.087 |
|||||||||||||
ALA | H:2 | J:2 | 76.0 | 0.661 | -168.9 | 149.8 | 15.0 | 0.13 | 0.531 |
J:P05067:0.443 B:P05067:0.078 |
|||||||||||||
ALA | I:2 | F:2 | 75.0 | 0.652 | -168.9 | 149.8 | 15.0 | 0.13 | 0.522 |
G:P05067:0.087 K:P05067:0.435 |
|||||||||||||
ALA | J:2 | K:2 | 77.0 | 0.67 | -168.9 | 149.8 | 15.0 | 0.13 | 0.54 |
H:P05067:0.087 L:P05067:0.443 |
|||||||||||||
ALA | K:2 | G:2 | 74.0 | 0.643 | -169.0 | 149.8 | 65.0 | 0.565 | 0.078 |
I:P05067:0.078 |
|||||||||||||
ALA | L:2 | L:2 | 76.0 | 0.661 | -168.9 | 149.8 | 67.0 | 0.583 | 0.078 |
J:P05067:0.078 |
|||||||||||||
6ti5 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2020-07-22 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6ti6 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2020-07-22 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | I:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | K:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | M:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | O:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6ti7 | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2020-07-22 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | J:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | L:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | N:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | P:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6w0o | 1 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
EM SOLID-STATE NMR |
2021-01-13 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6xov | 2 | P05067 | 100.0 | 1e-21 |
EM |
2021-07-07 | ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2lnq | 1 | P05067 | 97.5 | 6e-21 |
SOLID-STATE NMR |
2012-02-08 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ALA | B:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | C:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | D:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | E:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | F:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | G:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ALA | H:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7o1q | 1 | P09616,P05067 | 97.73 | 1e-20 |
EM |
2021-04-14 | ALA | A:107 | A:107 | 98.0 | 0.852 | -72.0 | 117.6 | 56.0 | 0.487 | 0.365 |
B:P09616+P05067:0.365 |
||||||
ALA | B:107 | B:107 | 99.0 | 0.861 | -72.0 | 117.6 | 57.0 | 0.496 | 0.365 |
C:P09616+P05067:0.365 |
|||||||||||||
ALA | C:107 | C:107 | 100.0 | 0.87 | -72.0 | 117.6 | 55.0 | 0.478 | 0.392 |
D:P09616+P05067:0.391 |
|||||||||||||
ALA | D:107 | D:107 | 101.0 | 0.878 | -72.0 | 117.6 | 56.0 | 0.487 | 0.391 |
E:P09616+P05067:0.391 |
|||||||||||||
ALA | E:107 | E:107 | 101.0 | 0.878 | -72.0 | 117.6 | 56.0 | 0.487 | 0.391 |
F:P09616+P05067:0.391 |
|||||||||||||
ALA | F:107 | F:107 | 101.0 | 0.878 | -72.0 | 117.6 | 56.0 | 0.487 | 0.391 |
G:P09616+P05067:0.391 |
|||||||||||||
ALA | G:107 | G:107 | 99.0 | 0.861 | -72.0 | 117.6 | 56.0 | 0.487 | 0.374 |
A:P09616+P05067:0.374 |
|||||||||||||
2mvx | 1 | P05067 | 97.5 | 3e-19 |
SOLID-STATE NMR |
2014-11-26 | ALA | A:2 | A:2 | 81.0 | 0.704 | -96.0 | 77.4 | 75.0 | 0.652 | 0.052 |
B:P05067:0.052 |
||||||
ALA | B:2 | B:2 | 75.0 | 0.652 | -94.9 | 80.0 | 20.0 | 0.174 | 0.478 |
C:P05067:0.061 A:P05067:0.417 |
|||||||||||||
ALA | C:2 | C:2 | 75.0 | 0.652 | -95.2 | 78.9 | 16.0 | 0.139 | 0.513 |
D:P05067:0.061 B:P05067:0.452 |
|||||||||||||
ALA | D:2 | D:2 | 74.0 | 0.643 | -96.0 | 81.1 | 17.0 | 0.148 | 0.495 |
C:P05067:0.435 E:P05067:0.061 |
|||||||||||||
ALA | E:2 | E:2 | 80.0 | 0.696 | -95.5 | 80.1 | 28.0 | 0.243 | 0.453 |
D:P05067:0.452 |
|||||||||||||
ALA | F:2 | F:2 | 86.0 | 0.748 | -89.6 | 72.1 | 78.0 | 0.678 | 0.07 |
G:P05067:0.07 |
|||||||||||||
ALA | G:2 | G:2 | 81.0 | 0.704 | -88.3 | 72.3 | 19.0 | 0.165 | 0.539 |
F:P05067:0.478 H:P05067:0.061 |
|||||||||||||
ALA | H:2 | H:2 | 83.0 | 0.722 | -87.8 | 71.6 | 18.0 | 0.157 | 0.565 |
G:P05067:0.513 I:P05067:0.061 |
|||||||||||||
ALA | I:2 | I:2 | 84.0 | 0.73 | -90.1 | 72.5 | 18.0 | 0.157 | 0.573 |
H:P05067:0.522 J:P05067:0.061 |
|||||||||||||
ALA | J:2 | J:2 | 80.0 | 0.696 | -90.7 | 77.0 | 27.0 | 0.235 | 0.461 |
I:P05067:0.461 |
|||||||||||||
3bae | 3 | ? | 100.0 | 7e-12 |
X-RAY |
2008-04-15 | ALA | C:2 | A:2 | 157.0 | 1.0 | 360.0 | 138.1 | 107.0 | 0.93 | 0.07 |
A:None:0.435 |
HOH |
3.840 |
CA |
O |
||
4hix | 3 | P05067 | 100.0 | 7e-12 |
X-RAY |
2013-03-13 | ALA | C:2 | A:2 | 41.0 | 0.357 | G | -62.8 | -23.6 | 0.0 | 0.0 | 0.357 |
B:None:0.357 |
HOH |
3.306 |
N |
O |
|
1ze7 | 1 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
NMR |
2005-05-03 | ALA | A:3 | A:2 | 67.0 | 0.583 | -73.1 | -39.3 | 67.0 | 0.583 | 0.0 | |||||||
1ze9 | 1 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
NMR |
2005-05-03 | ALA | A:3 | A:2 | 113.0 | 0.983 | -50.0 | -53.4 | 113.0 | 0.983 | 0.0 |
ZN |
9.319 |
O |
ZN |
|||
2mgt | 1 | P05067 | 93.75 | 1.0 |
NMR |
2014-11-12 | ALA | A:3 | A:2 | 62.0 | 0.539 | T | -58.0 | -39.3 | 62.0 | 0.539 | 0.0 | ||||||
ALA | B:3 | B:2 | 60.0 | 0.522 | T | -52.8 | -33.7 | 60.0 | 0.522 | 0.0 | |||||||||||||
2r0w | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2007-10-16 | ALA | C:2 | Q:2 | 164.0 | 1.0 | 360.0 | -30.2 | 113.0 | 0.983 | 0.017 |
A:A2NHM3:0.443 |
||||||
3ifl | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | ALA | C:2 | P:2 | 107.0 | 0.93 | -58.9 | 122.8 | 61.0 | 0.53 | 0.4 |
A:None:0.4 |
HOH |
3.188 |
N |
O |
||
3ifo | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | ALA | C:2 | P:2 | 161.0 | 1.0 | 360.0 | 127.2 | 117.0 | 1.0 | 0.0 |
B:None:0.383 |
HOH |
3.298 |
C |
O |
||
ALA | F:2 | Q:2 | 162.0 | 1.0 | 360.0 | -2.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3ifp | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2009-11-17 | ALA | C:2 | P:2 | 161.0 | 1.0 | 360.0 | -179.5 | 115.0 | 1.0 | 0.0 |
B:None:0.252 A:None:0.2 |
||||||
ALA | F:2 | Q:2 | 161.0 | 1.0 | 360.0 | -179.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | I:2 | R:2 | 160.0 | 1.0 | 360.0 | 179.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | L:2 | S:2 | 161.0 | 1.0 | 360.0 | 179.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
4ojf | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2015-01-28 | ALA | C:2 | A:2 | 42.0 | 0.365 | G | -55.5 | -32.7 | 0.0 | 0.0 | 0.365 |
B:None:0.365 |
HOH |
2.321 |
H |
O |
|
4onf | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2014-06-11 | ALA | C:2 | P:2 | 60.0 | 0.522 | G | -50.3 | -34.5 | 13.0 | 0.113 | 0.409 |
B:None:0.409 |
HOH |
3.062 |
O |
O |
|
5csz | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2015-08-12 | ALA | E:2 | D:2 | 103.0 | 0.896 | -102.2 | -25.7 | 48.0 | 0.417 | 0.479 |
A:None:0.478 |
NAG HOH |
3.443 6.825 |
CB CB |
C6 O |
||
ALA | F:2 | E:2 | 102.0 | 0.887 | -103.6 | -23.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
5w3p | 3 | P05067 | 100.0 | 1.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | ALA | C:3 | P:2 | 59.0 | 0.513 | -102.0 | 21.5 | 8.0 | 0.07 | 0.443 |
B:None:0.165 A:None:0.339 |
GOL SO4 HOH |
3.889 9.104 2.807 |
C O O |
O1 O3 O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p05067-f1 | 1 | P05067 | 100.0 | 0.0 | ALA | A:673 | A:673 | 103.0 | 0.896 | -120.2 | 65.8 |