Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr22 | 37622747 | . | G | A | CCDS13945.1:NM_002872.4:c.545aCg>aTg_NP_002863.1:p.182T>M | Homo sapiens ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) (RAC2), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1ds6 | 1 | P15153 | 100.0 | 2e-143 |
X-RAY |
2000-07-12 | THR | A:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1i4d | 2 | P63000 | 92.19 | 3e-133 |
X-RAY |
2001-05-16 | VAL | C:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1i4l | 2 | P63000 | 92.19 | 3e-133 |
X-RAY |
2001-05-16 | VAL | C:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6tgc | 3 | P63000 | 92.19 | 3e-133 |
EM |
2020-07-29 | VAL | C:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | F:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5fi0 | 2 | P63000 | 92.19 | 4e-133 |
X-RAY |
2016-04-20 | VAL | B:185 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | D:185 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | F:185 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | H:185 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1i4t | 2 | P63000 | 91.67 | 5e-132 |
X-RAY |
2001-05-16 | VAL | C:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1e96 | 1 | P15154 | 91.62 | 5e-131 |
X-RAY |
2000-11-17 | VAL | A:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1hh4 | 1 | P15154 | 91.62 | 8e-131 |
X-RAY |
2001-08-28 | VAL | A:182 | A:182 | 105.0 | 0.677 | -56.7 | 164.4 | 105.0 | 0.677 | 0.0 |
HOH |
8.118 |
CG2 |
O |
|||
| VAL | B:182 | B:182 | 58.0 | 0.374 | -155.0 | 157.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2vrw | 1 | P63000 | 93.48 | 1e-129 |
X-RAY |
2008-06-17 | VAL | A:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2h7v | 1 | P63000 | 92.93 | 2e-128 |
X-RAY |
2006-09-19 | VAL | A:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | B:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2p2l | 1 | P63000 | 92.93 | 2e-128 |
X-RAY |
2007-05-01 | VAL | A:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | B:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | C:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1g4u | 2 | P63000 | 92.93 | 3e-128 |
X-RAY |
2001-01-24 | VAL | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1mh1 | 1 | P63000 | 92.9 | 3e-127 |
X-RAY |
1998-01-21 | VAL | A:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6tm1 | 2 | P60763 | 88.54 | 2e-126 |
X-RAY |
2020-01-22 | VAL | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2c2h | 1 | P60763 | 88.02 | 6e-125 |
X-RAY |
2005-10-13 | VAL | A:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p15153-f1 | 1 | P15153 | 100.0 | 7e-144 | THR | A:182 | A:182 | 122.0 | 0.871 | -52.5 | 128.0 | ||
| af-p63000-f1 | 1 | P63000 | 92.19 | 1e-133 | VAL | A:182 | A:182 | 133.0 | 0.858 | -57.2 | 117.5 | ||
| af-p60763-f1 | 1 | P60763 | 88.54 | 1e-126 | VAL | A:182 | A:182 | 133.0 | 0.858 | -56.6 | 119.0 | ||