Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr22 37622840 . G A CCDS13945.1:NM_002872.4:c.452tCg>tTg_NP_002863.1:p.151S>L Homo sapiens ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) (RAC2), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1ds6 1 P15153 100.0 2e-143 X-RAY
 2000-07-12 SER A:151 A:151 23.0 0.2 -72.0 155.1 23.0 0.2 0.0 HOH
 3.643
 CA
 O
1i4d 2 P63000 92.19 3e-133 X-RAY
 2001-05-16 ALA C:151 D:151 19.0 0.165 -96.0 137.3 19.0 0.165 0.0 HOH
 3.615
 CA
 O
1i4l 2 P63000 92.19 3e-133 X-RAY
 2001-05-16 ALA C:151 D:151 21.0 0.183 -63.1 135.0 21.0 0.183 0.0
6tgc 3 P63000 92.19 3e-133 EM
 2020-07-29 ALA C:151 C:151 11.0 0.096 -97.0 103.5 11.0 0.096 0.0
ALA F:151 F:151 11.0 0.096 -97.0 103.5 11.0 0.096 0.0
5fi0 2 P63000 92.19 4e-133 X-RAY
 2016-04-20 ALA B:154 B:151 20.0 0.174 -80.1 143.6 20.0 0.174 0.0
ALA D:154 D:151 20.0 0.174 -79.3 143.7 NA NA NA
ALA F:154 F:151 21.0 0.183 -79.1 143.1 NA NA NA
ALA H:154 H:151 23.0 0.2 -78.5 144.2 NA NA NA
1i4t 2 P63000 91.67 5e-132 X-RAY
 2001-05-16 ALA C:151 D:151 19.0 0.165 -44.2 128.2 19.0 0.165 0.0 HOH
 4.793
 N
 O
1e96 1 P15154 91.62 5e-131 X-RAY
 2000-11-17 ALA A:151 A:151 18.0 0.157 -71.1 151.4 18.0 0.157 0.0 HOH
 6.999
 O
 O
1hh4 1 P15154 91.62 8e-131 X-RAY
 2001-08-28 ALA A:151 A:151 21.0 0.183 -90.7 151.8 21.0 0.183 0.0 HOH
 8.208
 C
 O
ALA B:151 B:151 22.0 0.191 -85.3 156.1 NA NA NA
2w2t 1 P15153 99.44 2e-130 X-RAY
 2009-05-05 SER A:157 A:151 16.0 0.139 -81.3 148.6 16.0 0.139 0.0 HOH
 3.831
 CA
 O
2w2x 1 P15153 99.44 2e-130 X-RAY
 2009-05-05 SER A:157 A:151 15.0 0.13 -71.1 143.0 15.0 0.13 0.0 HOH
 3.306
 CA
 O
SER B:157 B:151 15.0 0.13 -71.8 143.1 NA NA NA
2w2v 1 P15153 99.44 9e-130 X-RAY
 2009-05-05 SER A:158 A:151 16.0 0.139 -72.5 149.9 16.0 0.139 0.0 HOH
 3.866
 CA
 O
SER B:158 B:151 17.0 0.148 -62.5 168.3 NA NA NA
SER C:158 C:151 18.0 0.157 -69.4 150.6 NA NA NA
SER D:158 D:151 17.0 0.148 -62.0 -179.2 NA NA NA
2vrw 1 P63000 93.48 1e-129 X-RAY
 2008-06-17 ALA A:151 A:151 17.0 0.148 -66.3 149.6 17.0 0.148 0.0 HOH
 4.036
 CA
 O
2h7v 1 P63000 92.93 2e-128 X-RAY
 2006-09-19 ALA A:155 A:151 18.0 0.157 -72.4 140.1 18.0 0.157 0.0 HOH
 2.709
 O
 O
ALA B:155 B:151 19.0 0.165 -63.6 157.7 NA NA NA
2p2l 1 P63000 92.93 2e-128 X-RAY
 2007-05-01 ALA A:155 A:151 17.0 0.148 -66.0 141.8 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.846
 CA
 O
ALA B:155 B:151 16.0 0.139 -69.5 143.7 16.0 0.139 0.0 HOH
 3.827
 CA
 O
ALA C:155 C:151 16.0 0.139 -68.1 143.9 16.0 0.139 0.0 HOH
 3.849
 CA
 O
1g4u 2 P63000 92.93 3e-128 X-RAY
 2001-01-24 ALA B:151 R:151 17.0 0.148 -67.7 143.7 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.517
 O
 O
1mh1 1 P63000 92.9 3e-127 X-RAY
 1998-01-21 ALA A:153 A:151 16.0 0.139 -65.2 147.3 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.740
 O
 O
2yin 2 P63000 95.48 7e-127 X-RAY
 2011-05-25 ALA C:170 C:151 16.0 0.139 -89.1 130.6 NA NA NA
ALA D:170 D:151 15.0 0.13 -86.7 135.0 15.0 0.13 0.0 HOH
 6.791
 O
 O
2fju 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2006-11-21 ALA A:151 A:151 18.0 0.157 -69.9 145.1 18.0 0.157 0.0 HOH
 4.121
 CA
 O
5qqd 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -60.2 144.8 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.419
 O
 O
5qqe 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 16.0 0.139 -59.1 141.3 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.665
 O
 O
5qqf 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -70.9 143.7 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.770
 O
 O
5qqg 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -76.2 145.7 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.106
 O
 O
5qqh 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -70.2 142.5 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.671
 O
 O
5qqi 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 16.0 0.139 -71.3 139.9 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.757
 O
 O
5qqj 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 16.0 0.139 -66.3 138.3 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.744
 O
 O
5qqk 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 16.0 0.139 -80.3 144.0 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.657
 O
 O
5qql 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 18.0 0.157 -72.6 139.8 18.0 0.157 0.0 HOH
 2.641
 O
 O
5qqm 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -77.4 141.6 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.642
 O
 O
5qqn 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2019-12-18 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -69.1 136.4 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.707
 O
 O
5qu9 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2020-01-29 ALA A:152 A:151 17.0 0.148 -66.7 143.2 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.856
 O
 O
1foe 2 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2001-01-17 ALA B:151 B:151 20.0 0.174 -72.5 153.0 20.0 0.174 0.0
ALA D:151 D:151 20.0 0.174 -68.1 152.2 NA NA NA
ALA F:151 F:151 20.0 0.174 -70.8 153.4 NA NA NA
ALA H:151 H:151 20.0 0.174 -72.1 155.8 NA NA NA
2nz8 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2007-04-10 ALA A:151 A:151 17.0 0.148 -61.8 144.5 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.872
 CA
 O
3bji 2 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2008-07-15 ALA C:151 C:151 19.0 0.165 -72.4 141.7 NA NA NA
ALA D:151 D:151 27.0 0.235 -61.2 161.9 27.0 0.235 0.0
5o33 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2017-05-31 ALA A:151 A:151 17.0 0.148 -66.7 141.9 17.0 0.148 0.0 EDO
HOH
 5.848
2.778
 O
O
 O1
O
3su8 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2011-09-28 ALA A:151 A:151 19.0 0.165 -78.9 140.1 19.0 0.165 0.0
3sua 1 P63000 95.48 1e-126 X-RAY
 2011-09-07 ALA A:151 A:151 18.0 0.157 -74.0 134.4 18.0 0.157 0.0
ALA B:151 B:151 18.0 0.157 -74.3 135.0 NA NA NA
ALA C:151 C:151 18.0 0.157 -74.2 134.7 NA NA NA
6x1g 2 P63000 95.48 2e-126 X-RAY
 2020-11-25 ALA C:151 B:151 18.0 0.157 -62.3 141.7 18.0 0.157 0.0 HOH
 3.994
 CA
 O
ALA D:151 D:151 18.0 0.157 -65.4 143.6 NA NA NA
6tm1 2 P60763 88.54 2e-126 X-RAY
 2020-01-22 SER B:151 A:151 30.0 0.261 -80.9 -176.0 30.0 0.261 0.0
3b13 2 P63000 94.92 4e-126 X-RAY
 2012-03-14 ALA B:158 B:151 16.0 0.139 -74.2 133.4 16.0 0.139 0.0
ALA D:158 D:151 15.0 0.13 -67.3 131.7 15.0 0.13 0.0
7dpa 2 P63000 94.92 5e-126 EM
 2021-08-04 ALA B:158 B:151 19.0 0.165 -74.0 148.7 19.0 0.165 0.0
ALA E:158 E:151 18.0 0.157 -74.0 148.8 18.0 0.157 0.0
5n6o 1 P63000 95.45 2e-125 X-RAY
 2017-12-27 ALA A:150 A:151 16.0 0.139 -63.2 140.6 16.0 0.139 0.0
ALA B:150 B:151 14.0 0.122 -69.5 144.1 NA NA NA
3th5 1 P63000 95.45 2e-125 X-RAY
 2012-07-18 ALA A:178 A:151 17.0 0.148 -65.6 146.7 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.868
 CA
 O
ALA B:178 B:151 16.0 0.139 -65.6 149.1 NA NA NA
2g0n 1 P60763 93.79 2e-125 X-RAY
 2006-05-30 SER A:152 A:151 19.0 0.165 -68.3 145.9 19.0 0.165 0.0 CL
HOH
 3.679
2.668
 O
O
 CL
O
SER B:152 B:151 20.0 0.174 -71.0 150.1 NA NA NA
2ov2 1 P60763 93.79 2e-125 X-RAY
 2007-03-13 SER A:152 A:151 21.0 0.183 -71.3 151.6 21.0 0.183 0.0 CL
HOH
 3.590
4.060
 O
O
 CL
O
SER B:152 F:151 22.0 0.191 -76.8 146.7 NA NA NA
SER C:152 B:151 21.0 0.183 -79.7 149.9 NA NA NA
SER D:152 C:151 23.0 0.2 -75.5 147.6 NA NA NA
SER E:152 G:151 22.0 0.191 -80.0 149.1 NA NA NA
SER F:152 D:151 20.0 0.174 -65.2 144.4 NA NA NA
SER G:152 E:151 24.0 0.209 -76.8 149.0 NA NA NA
SER H:152 H:151 25.0 0.217 -71.1 149.3 NA NA NA
2qme 1 P60763 93.79 2e-125 X-RAY
 2007-08-28 SER A:152 A:151 19.0 0.165 -70.3 144.3 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.671
 O
 O
6bc1 1 P63000 95.45 3e-125 X-RAY
 2017-12-13 ALA A:151 A:151 13.0 0.113 -82.6 150.7 13.0 0.113 0.0 HOH
 4.760
 N
 O
ALA C:151 B:151 12.0 0.104 -83.6 151.1 NA NA NA
2ic5 1 P60763 93.79 3e-125 X-RAY
 2006-10-10 SER A:152 A:151 17.0 0.148 -68.8 146.8 17.0 0.148 0.0 CL
HOH
 3.546
2.640
 O
O
 CL
O
SER B:152 B:151 21.0 0.183 -70.4 149.2 NA NA NA
3ryt 2 P63000 94.92 3e-125 X-RAY
 2012-01-18 ALA C:154 C:151 13.0 0.113 -85.0 125.4 13.0 0.113 0.0
4yon 2 P63000 94.92 4e-125 X-RAY
 2015-07-01 ALA B:153 B:151 18.0 0.157 -67.7 145.7 18.0 0.157 0.0 HOH
 2.682
 O
 O
2c2h 1 P60763 88.02 6e-125 X-RAY
 2005-10-13 SER A:151 A:151 19.0 0.165 -63.7 145.9 19.0 0.165 0.0 HOH
 4.223
 CA
 O
SER B:151 B:151 17.0 0.148 -75.0 153.4 NA NA NA
1he1 2 P15154 95.43 9e-125 X-RAY
 2001-01-02 ALA C:151 C:151 17.0 0.148 -66.6 143.4 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.174
 O
 O
ALA D:151 D:151 16.0 0.139 -67.6 147.9 NA NA NA
3sbd 1 P63000 94.89 9e-125 X-RAY
 2012-07-18 ALA A:161 A:151 20.0 0.174 -63.9 146.4 20.0 0.174 0.0 HOH
 3.784
 CA
 O
ALA B:161 B:151 18.0 0.157 -55.1 145.2 NA NA NA
3sbe 1 P63000 94.89 9e-125 X-RAY
 2012-07-18 ALA A:161 A:151 15.0 0.13 -47.3 138.8 15.0 0.13 0.0 HOH
 3.645
 O
 O
7ajk 1 P63000 94.89 2e-124 X-RAY
 2020-11-18 ALA A:154 BBB:151 16.0 0.139 -68.8 138.1 16.0 0.139 0.0
4gzm 1 P63000 94.89 2e-124 X-RAY
 2012-12-12 ALA A:178 A:151 20.0 0.174 -65.9 149.5 20.0 0.174 0.0
ALA B:178 B:151 19.0 0.165 -66.6 150.0 NA NA NA
1ryf 1 P63000 86.0 2e-124 X-RAY
 2004-01-27 ALA A:172 A:170 17.0 0.148 -68.1 142.9 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.666
 O
 O
ALA B:172 B:170 16.0 0.139 -64.6 144.5 NA NA NA
1ryh 1 P63000 86.0 2e-124 X-RAY
 2004-01-27 ALA A:172 A:170 17.0 0.148 -62.1 137.6 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.597
 O
 O
ALA B:172 B:170 17.0 0.148 -61.4 141.5 NA NA NA
4gzl 1 P63000 94.89 4e-124 X-RAY
 2012-12-12 ALA A:178 A:151 17.0 0.148 -63.1 144.9 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.851
 CA
 O
ALA B:178 B:151 19.0 0.165 -65.6 148.2 NA NA NA
6agp 1 P63000 92.82 1e-123 NMR
 2019-03-20 ALA A:151 A:151 22.0 0.191 -67.2 148.0 22.0 0.191 0.0
2wkq 1 O49003,P63000 92.7 2e-122 X-RAY
 2009-08-18 ALA A:303 A:694 17.0 0.148 -67.3 143.7 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.791
 O
 O
2wkr 1 O49003,P63000 92.7 2e-122 X-RAY
 2009-08-18 ALA A:303 A:694 17.0 0.148 -68.4 141.6 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.369
 O
 O
2wkp 1 O49003,P63000 92.7 3e-122 X-RAY
 2009-08-18 ALA A:303 A:694 17.0 0.148 -71.1 142.2 17.0 0.148 0.0 HOH
 3.254
 O
 O
5hzh 1 P63000,O49003 86.71 3e-88 X-RAY
 2016-12-21 ALA A:303 A:300 17.0 0.148 -71.0 137.1 17.0 0.148 0.0 HOH
 4.130
 CA
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p15153-f1 1 P15153 100.0 7e-144 SER A:151 A:151 17.0 0.148 -75.0 147.7
af-p63000-f1 1 P63000 92.19 1e-133 ALA A:151 A:151 18.0 0.157 -65.3 144.0
af-p60763-f1 1 P60763 88.54 1e-126 SER A:151 A:151 18.0 0.157 -67.0 150.5