Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr3 3194248 . G A CCDS2562.1:NM_016302.3:c.1040gCa>gTa_NP_057386.2:p.347A>V Homo sapiens cereblon (CRBN), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6bn7 2 Q96SW2 97.06 0.0 X-RAY
2018-05-30 ALA B:368 B:347 9.0 0.078 E -148.6 157.7 9.0 0.078 0.0 RN3
9.971
O
O4
6bn8 2 Q96SW2 97.06 0.0 X-RAY
2018-06-06 ALA B:368 B:347 9.0 0.078 E -140.8 156.9 9.0 0.078 0.0
6bn9 2 Q96SW2 97.06 0.0 X-RAY
2018-05-30 ALA B:368 B:347 13.0 0.113 E -136.6 162.0 13.0 0.113 0.0
6bnb 2 Q96SW2 97.06 0.0 X-RAY
2018-05-30 ALA B:368 B:347 18.0 0.157 -147.1 -175.9 18.0 0.157 0.0
6boy 2 Q96SW2 97.06 0.0 X-RAY
2018-05-30 ALA B:368 B:347 11.0 0.096 E -151.0 155.8 11.0 0.096 0.0
5hxb 3 Q96SW2 99.75 0.0 X-RAY
2016-06-29 ALA C:311 Z:347 7.0 0.061 E -140.1 174.1 7.0 0.061 0.0
ALA E:311 C:347 7.0 0.061 E -139.7 172.6 NA NA NA
5v3o 2 Q96SW2 99.75 0.0 X-RAY
2017-05-03 ALA B:311 C:347 10.0 0.087 E -165.0 156.4 10.0 0.087 0.0
6uml 2 Q96SW2 99.75 0.0 X-RAY
2020-04-15 ALA B:311 C:347 4.0 0.035 E -144.7 169.4 4.0 0.035 0.0
6xk9 3 Q96SW2 99.75 0.0 X-RAY
2020-12-02 ALA C:311 Z:347 7.0 0.061 E -150.2 161.3 7.0 0.061 0.0
ALA F:311 C:347 7.0 0.061 E -149.9 161.1 NA NA NA
5fqd 2 Q96SW2 99.02 0.0 X-RAY
2016-02-24 ALA B:331 B:347 13.0 0.113 E -149.8 160.8 13.0 0.113 0.0 HOH
3.637
N
O
ALA E:331 E:347 13.0 0.113 E -148.9 160.3 NA NA NA
6h0f 2 Q96SW2 99.02 0.0 X-RAY
2018-11-07 ALA B:331 B:347 18.0 0.157 E -155.6 150.5 18.0 0.157 0.0 Y70
9.701
O
H182
ALA E:331 E:347 18.0 0.157 E -156.1 150.8 NA NA NA
ALA H:331 H:347 18.0 0.157 E -155.4 150.5 NA NA NA
ALA K:331 K:347 18.0 0.157 E -155.7 150.5 NA NA NA
6h0g 2 Q96SW2 99.02 0.0 X-RAY
2018-11-07 ALA B:331 B:347 16.0 0.139 E -166.8 160.2 16.0 0.139 0.0 Y70
9.886
O
O20
ALA E:331 E:347 17.0 0.148 E -160.2 165.0 NA NA NA
7lps 2 Q96SW2 100.0 0.0 X-RAY
2021-06-02 ALA B:301 B:347 11.0 0.096 E -152.4 157.3 11.0 0.096 0.0
ALA E:301 E:347 11.0 0.096 E -151.4 157.9 NA NA NA
ALA H:301 H:347 11.0 0.096 E -150.9 155.2 NA NA NA
ALA K:301 K:347 9.0 0.078 E -151.1 155.5 NA NA NA
4tz4 2 Q96SW2 100.0 0.0 X-RAY
2014-08-06 ALA B:300 C:347 10.0 0.087 E -145.3 168.5 10.0 0.087 0.0
4ci1 2 P0CF65 84.08 0.0 X-RAY
2014-07-16 ALA B:373 B:349 17.0 0.148 E -157.4 158.8 17.0 0.148 0.0 HOH
7.052
O
O
4ci2 2 P0CF65 84.08 0.0 X-RAY
2014-07-16 ALA B:373 B:349 12.0 0.104 E -155.6 155.1 12.0 0.104 0.0 HOH
5.512
N
O
4ci3 2 P0CF65 84.08 0.0 X-RAY
2014-07-16 ALA B:373 B:349 15.0 0.13 E -156.2 157.3 15.0 0.13 0.0
7bqu 1 Q96SW2 96.43 3e-76 X-RAY
2020-08-26 ALA A:35 A:347 21.0 0.183 E -150.4 162.6 21.0 0.183 0.0 HOH
3.575
N
O
7bqv 1 Q96SW2 99.08 6e-76 X-RAY
2020-08-26 ALA A:30 A:347 13.0 0.113 E -113.1 163.7 13.0 0.113 0.0 HOH
3.224
N
O
3wx1 1 Q8C7D2 97.25 2e-74 X-RAY
2014-08-06 ALA A:31 A:350 68.0 0.591 G 52.1 47.7 68.0 0.591 0.0 HOH
7.399
CB
O
ALA B:31 B:350 120.0 1.0 138.9 360.0 NA NA NA
3wx2 1 Q8C7D2 97.25 2e-74 X-RAY
2014-08-06 ALA A:31 A:350 69.0 0.6 G 61.7 49.5 69.0 0.6 0.0 HOH
4.456
C
O
ALA B:31 B:350 118.0 1.0 -161.5 360.0 NA NA NA
5yiz 1 Q8C7D2 97.25 2e-74 X-RAY
2018-02-07 ALA A:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA E:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA F:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA G:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA H:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA I:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA J:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA K:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA L:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA M:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA N:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA O:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA P:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5yj0 1 Q8C7D2 97.25 2e-74 X-RAY
2018-02-07 ALA A:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA E:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA F:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA G:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA H:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA I:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA J:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA K:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA L:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA M:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA N:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA O:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA P:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5yj1 1 Q8C7D2 97.25 2e-74 X-RAY
2018-02-07 ALA A:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA E:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA F:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA G:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA H:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA I:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA J:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA K:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA L:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA M:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA N:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA O:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA P:31 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4tzu 1 Q8C7D2 97.22 9e-74 X-RAY
2014-08-06 ALA A:29 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:29 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:29 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:29 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4tzc 1 Q8C7D2 97.2 4e-73 X-RAY
2014-08-06 ALA A:30 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:30 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:30 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:30 D:349 32.0 0.278 H -50.9 -36.8 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q96sw2-f1 1 Q96SW2 100.0 0.0 ALA A:347 A:347 11.0 0.096 E -147.7 159.5