Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr3 10191625 . T A CCDS2597.1:NM_000551.3:c.618atT>atA_NP_000542.1:p.206I>I Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4wqo 1 P40337 100.0 4e-156 X-RAY
2015-03-04 ILE A:226 A:206 123.0 0.703 H -55.5 -65.6 123.0 0.703 0.0
7q2j 3 P40337 94.25 1e-118 X-RAY
2021-11-24 ILE C:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4b9k 3 P40337 95.32 3e-118 X-RAY
2012-10-24 ILE C:164 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:164 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:164 I:206 103.0 NA S 64.3 -27.3 NA NA NA
ILE L:164 L:206 104.0 NA -119.9 99.9 NA NA NA
1lqb 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2002-07-03 ILE C:155 C:206 106.0 0.606 H -64.0 -38.6 106.0 0.606 0.0 HOH
7.567
CD1
O
3ztd 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4b95 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-10-24 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bks 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bkt 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9c 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9d 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9e 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9f 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9g 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9h 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9i 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9j 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9k 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9l 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5lli 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2016-11-09 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvv 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvw 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw0 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw1 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw2 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5t35 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-03-08 ILE D:155 D:206 104.0 0.594 H -77.1 -52.5 104.0 0.594 0.0
ILE H:155 H:206 128.0 0.731 H -69.2 -43.8 NA NA NA
6bvb 1 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-01 ILE A:155 V:206 105.0 0.6 H -61.9 -37.2 105.0 0.6 0.0 HOH
5.199
HD11
O
6gfy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 5 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ILE I:155 I:206 170.0 0.971 -121.6 360.0 NA NA NA
6gmq 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-22 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hax 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 ILE B:155 B:206 82.0 NA H -65.1 -35.1 82.0 NA NA HOH
8.726
N
O
ILE F:155 F:206 101.0 0.577 H -64.3 -36.2 NA NA NA
6hay 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 ILE B:155 B:206 94.0 0.537 H -59.5 -46.6 94.0 0.537 0.0 HOH
6.485
CD1
O
ILE F:155 F:206 113.0 0.646 H -71.9 -31.1 NA NA NA
6sis 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-12-04 ILE D:155 D:206 104.0 0.594 H -70.9 -39.2 104.0 0.594 0.0
ILE H:155 H:206 106.0 0.606 H -70.9 -39.0 NA NA NA
7jto 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 ILE D:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7jtp 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 ILE C:155 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 ILE C:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:156 I:206 139.0 NA -126.5 360.0 NA NA NA
ILE L:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrf 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 ILE C:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:156 I:206 138.0 NA -149.5 360.0 NA NA NA
ILE L:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3ztc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ILE C:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:156 I:206 141.0 NA -62.4 360.0 NA NA NA
ILE L:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zun 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ILE C:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ajy 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 ILE D:156 V:206 122.0 0.697 H -41.6 -42.5 122.0 0.697 0.0 HOH
6.447
CD1
O
4awj 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 ILE C:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:156 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmr 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ILE D:156 V:206 120.0 0.686 H -55.4 -41.0 120.0 0.686 0.0 HOH
4.639
CD1
O
1lm8 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2002-06-12 ILE C:153 V:206 95.0 0.543 H -57.7 -66.2 95.0 0.543 0.0 HOH
4.510
O
O
1vcb 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
1999-04-21 ILE C:153 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE F:153 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE I:153 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ILE L:153 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5n4w 2 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2017-06-07 ILE B:153 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfx 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2018-07-11 ILE C:153 C:206 127.0 0.726 H -64.8 -38.6 127.0 0.726 0.0 HOH
2.719
O
O
6i7q 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 ILE D:153 V:206 100.0 0.571 H -67.9 -32.2 100.0 0.571 0.0 HOH
6.185
HG21
O
6i7r 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 ILE D:153 V:206 122.0 0.697 H -61.4 -54.6 122.0 0.697 0.0 HOH
5.301
O
O
6r7f 9 P40337 100.0 6e-117 EM
2019-08-28 ILE I:153 V:206 101.0 0.577 H -61.9 -39.5 98.0 0.56 0.017 L:Q13617:0.017
7khh 3 P40337 100.0 6e-116 X-RAY
2021-02-24 ILE C:168 C:206 129.0 0.737 H -64.1 -43.5 129.0 0.737 0.0 HOH
3.637
O
O
7cjb 1 P40337 100.0 8e-116 X-RAY
2021-07-14 ILE A:156 A:206 171.0 0.977 -92.6 360.0 171.0 0.977 0.0
ILE E:156 E:206 132.0 0.754 -134.1 121.9 NA NA NA
ILE I:156 I:206 98.0 0.56 -90.8 112.0 NA NA NA
ILE M:156 M:206 137.0 0.783 -52.9 123.7 NA NA NA
6zhc 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2020-08-05 ILE A:148 AAA:206 77.0 0.44 H -65.4 -42.9 77.0 0.44 0.0 HOH
5.404
CD1
O
7pi4 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2021-09-29 ILE A:148 AAA:206 81.0 0.463 H -59.0 -47.2 81.0 0.463 0.0 CA
HOH
8.109
2.942
O
O
CA
O
6hr2 2 P40337 100.0 3e-108 X-RAY
2019-06-12 ILE B:146 B:206 107.0 0.611 H -67.2 -39.8 107.0 0.611 0.0 HOH
4.754
HD11
O
ILE F:146 F:206 101.0 0.577 H -67.0 -40.2 NA NA NA
6r6h 12 P40337 100.0 3e-107 EM
2019-08-28 ILE L:147 V:206 113.0 0.646 H -122.3 7.8 113.0 0.646 0.0

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p40337-f1 1 P40337 100.0 2e-156 ILE A:206 A:206 54.0 0.309 H -64.2 -42.1