Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr3 10191635 . C A CCDS2597.1:NM_000551.3:c.628Cgg>Agg_NP_000542.1:p.210R>R Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4wqo 1 P40337 100.0 4e-156 X-RAY
2015-03-04 ARG A:230 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7q2j 3 P40337 94.25 1e-118 X-RAY
2021-11-24 ARG C:194 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4b9k 3 P40337 95.32 3e-118 X-RAY
2012-10-24 ARG C:168 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:168 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:168 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:168 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1lqb 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2002-07-03 ARG C:159 C:210 282.0 1.0 -0.7 360.0 282.0 1.0 0.0
3ztd 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4b95 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-10-24 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bks 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bkt 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9c 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9d 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9e 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9f 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9g 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9h 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9i 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9j 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9k 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9l 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5lli 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2016-11-09 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvv 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvw 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw0 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw1 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw2 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5t35 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-03-08 ARG D:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6bvb 1 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-01 ARG A:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 5 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmq 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-22 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hax 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 ARG B:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hay 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 ARG B:159 B:210 242.0 1.0 42.0 360.0 242.0 1.0 0.0 FMT
2.790
NH2
O2
ARG F:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6sis 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-12-04 ARG D:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7jto 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 ARG D:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7jtp 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 ARG C:159 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 ARG C:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrf 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 ARG C:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3ztc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ARG C:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zun 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 ARG C:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ajy 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 ARG D:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4awj 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 ARG C:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmr 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2018-08-08 ARG D:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1lm8 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2002-06-12 ARG C:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1vcb 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
1999-04-21 ARG C:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG L:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5n4w 2 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2017-06-07 ARG B:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfx 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2018-07-11 ARG C:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6i7q 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 ARG D:157 V:210 123.0 NA -97.0 360.0 123.0 NA NA
6i7r 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 ARG D:157 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6r7f 9 P40337 100.0 6e-117 EM
2019-08-28 ARG I:157 V:210 205.0 0.911 -151.5 171.3 171.0 0.76 0.151 L:Q13617:0.151
7khh 3 P40337 100.0 6e-116 X-RAY
2021-02-24 ARG C:172 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7cjb 1 P40337 100.0 8e-116 X-RAY
2021-07-14 ARG A:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG I:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG M:160 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6zhc 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2020-08-05 ARG A:152 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7pi4 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2021-09-29 ARG A:152 AAA:210 199.0 0.884 H -95.2 -7.9 199.0 0.884 0.0 CA
HOH
2.242
2.979
O
NH2
CA
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p40337-f1 1 P40337 100.0 2e-156 ARG A:210 A:210 194.0 0.862 H -69.7 -22.2