Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr3 | 195778980 | . | A | C | CCDS3312.1:NM_001128148.1:c.2116Tct>Gct_NP_001121620.1:p.706S>A | Homo sapiens transferrin receptor (TFRC), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3s9l | 1 | P02786 | 99.69 | 0.0 |
X-RAY |
2011-08-10 | SER | A:600 | A:706 | 58.0 | 0.504 | T | -61.8 | -36.7 | 58.0 | 0.504 | 0.0 | ||||||
SER | B:600 | B:706 | 64.0 | 0.557 | T | -70.0 | -10.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3s9m | 1 | P02786 | 99.69 | 0.0 |
X-RAY |
2011-08-10 | SER | A:600 | A:706 | 60.0 | 0.522 | S | -63.3 | -39.2 | 60.0 | 0.522 | 0.0 | ||||||
SER | B:600 | B:706 | 62.0 | 0.539 | T | -67.8 | -16.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3s9n | 1 | P02786 | 99.69 | 0.0 |
X-RAY |
2011-08-10 | SER | A:600 | A:706 | 67.0 | 0.583 | T | -74.9 | -15.3 | 67.0 | 0.583 | 0.0 | ||||||
SER | B:600 | B:706 | 61.0 | 0.53 | T | -73.1 | -15.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1de4 | 3 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2000-01-19 | SER | C:586 | C:706 | 67.0 | 0.583 | T | -58.4 | -16.4 | 67.0 | 0.583 | 0.0 | ||||||
SER | F:586 | F:706 | 68.0 | 0.591 | T | -56.5 | -18.2 | 68.0 | 0.591 | 0.0 | |||||||||||||
SER | I:586 | I:706 | 65.0 | 0.565 | T | -57.9 | -16.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kas | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2010-03-09 | SER | A:586 | A:706 | 70.0 | 0.609 | T | -80.3 | -3.0 | 70.0 | 0.609 | 0.0 |
NAG HOH |
7.529 2.701 |
OG O |
O6 O |
||
6gsr | 2 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
EM |
2019-03-27 | SER | B:586 | Ab:706 | 70.0 | 0.609 | T | -80.3 | -3.0 | 70.0 | 0.609 | 0.0 | ||||||
SER | Q:586 | Aq:706 | 71.0 | 0.617 | T | -80.3 | -3.1 | 71.0 | 0.617 | 0.0 | |||||||||||||
6h5i | 2 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
EM |
2019-03-27 | SER | B:586 | Ab:706 | 62.0 | 0.539 | T | -68.7 | -34.2 | 62.0 | 0.539 | 0.0 | ||||||
SER | Q:586 | Aq:706 | 74.0 | 0.643 | T | -73.3 | -23.7 | 74.0 | 0.643 | 0.0 | |||||||||||||
6wrw | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-04-28 | SER | A:586 | A:706 | 70.0 | 0.609 | T | -70.1 | -6.0 | 70.0 | 0.609 | 0.0 |
NAG |
6.943 |
OG |
O6 |
||
SER | B:586 | B:706 | 68.0 | 0.591 | T | -69.8 | -5.2 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG NAG |
6.784 9.441 |
OG OG |
O6 C8 |
|||||||||
6wrx | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-04-28 | SER | A:586 | A:706 | 71.0 | 0.617 | T | -67.9 | -11.6 | 71.0 | 0.617 | 0.0 |
NAG NAG |
7.388 8.438 |
OG OG |
O6 C8 |
||
SER | B:586 | B:706 | 70.0 | 0.609 | T | -67.5 | -11.6 | 70.0 | 0.609 | 0.0 |
NAG NAG |
6.986 9.645 |
OG OG |
O6 C8 |
|||||||||
6okd | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2020-04-15 | SER | A:588 | A:588 | 69.0 | 0.6 | T | -72.1 | -7.2 | 69.0 | 0.6 | 0.0 |
NAG HOH |
6.914 2.764 |
OG O |
O6 O |
||
SER | B:588 | B:588 | 68.0 | 0.591 | T | -74.2 | -4.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6d03 | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
EM |
2018-06-20 | SER | A:605 | A:706 | 71.0 | 0.617 | S | -109.9 | 12.1 | 71.0 | 0.617 | 0.0 |
NAG |
8.819 |
OG |
O6 |
||
SER | B:605 | B:706 | 67.0 | 0.583 | S | -107.6 | -0.7 | 67.0 | 0.583 | 0.0 |
NAG NAG |
9.086 9.704 |
OG OG |
O5 C6 |
|||||||||
6d04 | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
EM |
2018-06-20 | SER | A:605 | A:706 | 65.0 | 0.565 | S | -100.9 | -9.2 | 65.0 | 0.565 | 0.0 |
NAG NAG |
7.793 9.151 |
OG OG |
O6 O6 |
||
SER | B:605 | B:706 | 65.0 | 0.565 | S | -100.9 | -9.1 | 65.0 | 0.565 | 0.0 |
NAG NAG |
7.502 9.220 |
OG OG |
C6 C6 |
|||||||||
6d05 | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
EM |
2018-06-20 | SER | A:605 | A:706 | 67.0 | 0.583 | S | -112.9 | -8.4 | 67.0 | 0.583 | 0.0 |
NAG NAG |
7.820 9.840 |
OG OG |
O6 O6 |
||
SER | B:605 | B:706 | 67.0 | 0.583 | S | -112.9 | -8.4 | 67.0 | 0.583 | 0.0 |
NAG NAG |
7.674 9.504 |
OG OG |
C6 O6 |
|||||||||
6wrv | 1 | P02786 | 99.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-04-28 | SER | A:586 | A:706 | 68.0 | 0.591 | T | -69.1 | -5.1 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG |
6.894 |
OG |
O6 |
||
SER | B:586 | B:706 | 68.0 | 0.591 | T | -69.6 | -5.1 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG NAG |
6.773 8.572 |
OG OG |
O6 C8 |
|||||||||
SER | C:586 | E:706 | 68.0 | 0.591 | T | -69.7 | -4.9 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG NAG |
6.565 8.340 |
OG OG |
O6 C8 |
|||||||||
1cx8 | 1 | P02786 | 99.53 | 0.0 |
X-RAY |
1999-09-09 | SER | A:585 | A:706 | 68.0 | 0.591 | T | -73.6 | -16.3 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG |
6.240 |
OG |
O6 |
||
SER | B:585 | B:706 | 68.0 | 0.591 | T | -78.5 | -14.0 | 68.0 | 0.591 | 0.0 |
NAG |
6.243 |
OG |
O6 |
|||||||||
SER | C:585 | C:706 | 68.0 | 0.591 | T | -77.8 | -14.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:585 | D:706 | 67.0 | 0.583 | T | -73.6 | -16.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:585 | E:706 | 68.0 | 0.591 | T | -72.2 | -14.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:585 | F:706 | 68.0 | 0.591 | T | -72.3 | -15.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | G:585 | G:706 | 67.0 | 0.583 | T | -71.4 | -13.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | H:585 | H:706 | 67.0 | 0.583 | T | -73.3 | -15.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1suv | 1 | P02786 | 99.53 | 0.0 |
EM |
2004-04-13 | SER | A:585 | A:706 | 71.0 | 0.617 | T | -73.5 | -16.3 | 71.0 | 0.617 | 0.0 | ||||||
SER | B:585 | B:706 | 69.0 | 0.6 | T | -78.5 | -13.9 | 69.0 | 0.6 | 0.0 | |||||||||||||
2nsu | 1 | P02786 | 99.53 | 0.0 |
EM |
2007-03-27 | SER | A:585 | A:706 | 68.0 | 0.591 | T | -73.5 | -16.3 | 68.0 | 0.591 | 0.0 | ||||||
SER | B:585 | B:706 | 69.0 | 0.6 | T | -78.5 | -14.0 | 69.0 | 0.6 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p02786-f1 | 1 | P02786 | 100.0 | 0.0 | SER | A:706 | A:706 | 54.0 | 0.47 | T | -61.2 | -32.1 |