Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr3 20189904 . A C CCDS2634.1:NM_003884.4:c.2230Agc>Cgc_NP_003875.3:p.744S>R Homo sapiens lysine acetyltransferase 2B (KAT2B), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6j3o 1 Q92831 92.91 2e-77 X-RAY
 2019-05-01 SER A:53 A:744 17.0 0.148 G -89.9 5.3 17.0 0.148 0.0 B4L
HOH
 8.811
6.799
 O
OG
 C12
O
SER B:53 B:744 9.0 0.078 G -91.0 9.1 NA NA NA
3gg3 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2009-03-17 SER A:32 A:744 10.0 0.087 T -108.8 8.7 10.0 0.087 0.0 HOH
 3.921
 N
 O
SER B:32 B:744 14.0 0.122 T -94.6 6.7 NA NA NA
5fdz 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 13.0 0.113 T -113.7 8.2 13.0 0.113 0.0 5X0
HOH
 8.556
2.623
 O
OG
 CAA
O
SER B:32 B:744 12.0 0.104 T -113.9 8.7 NA NA NA
5fe0 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 15.0 0.13 G -85.9 5.5 15.0 0.13 0.0 ALY
HOH
 8.533
4.684
 O
OG
 CH3
O
SER B:32 B:744 14.0 0.122 G -88.0 6.4 NA NA NA
5fe1 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 13.0 0.113 T -95.3 5.2 13.0 0.113 0.0 12Q
HOH
 8.611
2.691
 O
OG
 CAH
O
SER B:32 B:744 14.0 0.122 T -95.2 4.5 NA NA NA
5fe2 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 13.0 0.113 T -94.9 7.5 13.0 0.113 0.0 5WV
HOH
 8.241
4.066
 O
N
 CAA
O
SER B:32 B:744 10.0 0.087 T -93.7 7.3 NA NA NA
5fe3 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 12.0 0.104 T -96.9 4.4 12.0 0.104 0.0 5WX
HOH
 8.385
2.533
 O
OG
 NAB
O
SER B:32 B:744 12.0 0.104 T -94.9 3.6 NA NA NA
5fe4 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 10.0 0.087 T -94.5 2.6 10.0 0.087 0.0 5WY
HOH
 8.531
2.274
 O
OG
 NAA
O
SER B:32 B:744 10.0 0.087 T -99.2 3.2 NA NA NA
5fe5 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 8.0 0.07 T -84.6 3.3 8.0 0.07 0.0 DMS
HOH
 9.179
2.544
 O
OG
 C2
O
SER B:32 B:744 12.0 0.104 T -84.0 4.4 NA NA NA
5fe6 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 17.0 0.148 T -92.5 2.6 17.0 0.148 0.0 EDO
EDO
5WZ
HOH
 4.125
8.967
8.240
2.436
 N
O
O
OG
 O1
C1
C7
O
SER B:32 B:744 11.0 0.096 T -96.1 9.4 NA NA NA
5fe7 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 11.0 0.096 T -97.6 6.7 11.0 0.096 0.0 5WU
HOH
 8.389
2.283
 O
OG
 C8
O
SER B:32 B:744 10.0 0.087 T -97.2 5.9 NA NA NA
5fe8 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 13.0 0.113 G -87.6 5.2 13.0 0.113 0.0 5WT
HOH
 8.757
2.368
 O
OG
 CAC
O
SER B:32 B:744 10.0 0.087 G -88.5 4.5 NA NA NA
5fe9 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-01-13 SER A:32 A:744 15.0 0.13 G -86.7 2.6 15.0 0.13 0.0 5WS
HOH
 8.737
2.551
 O
OG
 CAB
O
SER B:32 B:744 13.0 0.113 G -86.8 1.7 NA NA NA
5lvq 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-10-26 SER A:32 A:744 11.0 0.096 T -97.7 7.8 11.0 0.096 0.0 2LX
HOH
 8.503
2.445
 O
OG
 C01
O
SER B:32 B:744 10.0 0.087 T -97.5 6.9 NA NA NA
5lvr 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2016-10-26 SER A:32 A:744 12.0 0.104 T -95.7 7.3 12.0 0.104 0.0 EDO
78Y
HOH
 4.212
8.702
3.837
 OG
O
N
 C2
N
O
SER B:32 B:744 11.0 0.096 G -91.6 5.8 11.0 0.096 0.0 EDO
EDO
DMS
HOH
 4.470
9.410
8.901
2.443
 N
O
O
OG
 O2
C1
C2
O
5mkx 1 Q92831 100.0 3e-77 X-RAY
 2017-12-20 SER A:32 A:744 16.0 0.139 T -92.0 5.4 16.0 0.139 0.0 82I
HOH
 8.354
2.576
 O
OG
 CL1
O
SER B:32 B:744 13.0 0.113 T -103.8 7.3 NA NA NA
5ml0 1 Q9JHD1 93.58 6e-67 X-RAY
 2017-12-20 ASN A:22 A:743 31.0 0.194 T -93.9 8.5 31.0 0.194 0.0 P2L
HOH
 8.066
2.574
 O
OD1
 CL1
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q92831-f1 1 Q92831 100.0 0.0 SER A:744 A:744 8.0 0.07 G -85.4 10.5