Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr3 | 38022341 | . | A | C | CCDS33734.1:NM_001008392.1:c.814Aga>Cga_NP_001008393.1:p.272R>R | Homo sapiens CTD small phosphatase like (CTDSPL), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1ta0 | 1 | Q9GZU7 | 81.67 | 4e-109 |
X-RAY |
2004-08-31 | GLN | A:181 | A:256 | 121.0 | 0.672 | -149.8 | 360.0 | 121.0 | 0.672 | 0.0 |
HOH |
2.565 |
NE2 |
O |
|||
3pgl | 1 | Q9GZU7 | 81.67 | 4e-109 |
X-RAY |
2011-03-09 | GLN | A:180 | A:256 | 150.0 | NA | -115.3 | 360.0 | 150.0 | NA | NA |
HOH |
3.087 |
OE1 |
O |
|||
GLN | B:180 | B:256 | 166.0 | NA | -129.0 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
1t9z | 1 | Q9GZU7 | 81.11 | 7e-109 |
X-RAY |
2004-08-31 | GLN | A:181 | A:256 | 134.0 | 0.744 | 143.3 | 360.0 | 134.0 | 0.744 | 0.0 |
HOH |
2.780 |
NE2 |
O |
|||
2ghq | 1 | Q9GZU7 | 81.11 | 1e-108 |
X-RAY |
2006-12-05 | GLN | A:181 | A:256 | 146.0 | NA | -169.2 | 360.0 | 146.0 | NA | NA |
HOH |
2.697 |
O |
O |
|||
GLN | B:181 | B:256 | 157.0 | NA | 177.2 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2ght | 1 | Q9GZU7 | 81.11 | 1e-108 |
X-RAY |
2006-12-05 | GLN | A:181 | A:256 | 161.0 | NA | 179.3 | 360.0 | 161.0 | NA | NA |
HOH |
2.552 |
O |
O |
|||
GLN | B:181 | B:256 | 142.0 | NA | 177.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6du2 | 1 | A0A1S2ZIN9 | 81.11 | 1e-108 |
X-RAY |
2018-09-26 | GLN | A:180 | A:256 | 99.0 | NA | -31.5 | 360.0 | 99.0 | NA | NA | |||||||
GLN | B:180 | B:256 | 121.0 | NA | -90.4 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6du3 | 1 | Q9GZU7 | 81.11 | 1e-108 |
X-RAY |
2018-09-26 | GLN | A:180 | A:256 | 135.0 | 0.75 | -157.8 | 360.0 | 135.0 | 0.75 | 0.0 |
HOH |
4.303 |
O |
O |
|||
GLN | B:180 | B:256 | 167.0 | 0.928 | -36.0 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
4ygy | 1 | Q9GZU7 | 80.66 | 3e-108 |
X-RAY |
2015-09-16 | GLN | A:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4yh1 | 1 | Q9GZU7 | 80.66 | 3e-108 |
X-RAY |
2015-09-16 | GLN | A:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3l0y | 1 | Q9GZU7 | 80.66 | 4e-108 |
X-RAY |
2010-03-23 | GLN | A:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3l0b | 1 | Q9GZU7 | 80.66 | 4e-108 |
X-RAY |
2010-03-23 | GLN | A:184 | A:256 | 150.0 | NA | -159.4 | 360.0 | 150.0 | NA | NA |
HOH |
2.971 |
NE2 |
O |
|||
GLN | B:184 | B:256 | 177.0 | NA | 127.1 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3l0c | 1 | Q9GZU7 | 80.66 | 4e-108 |
X-RAY |
2010-03-23 | GLN | A:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:184 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2q5e | 1 | O14595 | 82.12 | 3e-104 |
X-RAY |
2007-06-19 | GLN | A:183 | A:267 | 126.0 | 0.7 | H | -72.2 | -28.2 | 126.0 | 0.7 | 0.0 |
HOH |
2.794 |
O |
O |
||
GLN | B:183 | B:267 | 154.0 | 0.856 | T | -72.8 | 17.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:183 | C:267 | 143.0 | 0.794 | H | -59.5 | -60.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:183 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | E:183 | E:267 | 186.0 | 1.0 | -90.4 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
GLN | F:183 | F:267 | 160.0 | 0.889 | H | -54.4 | -47.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | G:183 | G:267 | 136.0 | 0.756 | H | -70.0 | -31.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | H:183 | H:267 | 149.0 | 0.828 | T | -88.7 | 20.5 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-o15194-f1 | 1 | O15194 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:272 | A:272 | 140.0 | 0.622 | H | -76.5 | -25.5 |