Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr4 149076050 . G A CCDS3772.1:NM_000901.4:c.2017Cga>Tga_NP_000892.2:p.673R>* Homo sapiens nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 (NR3C2), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4oor 1 ? 91.46 8e-51 X-RAY
 2014-10-29 ARG A:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ov7 1 ? 91.46 8e-51 X-RAY
 2014-10-29 ARG A:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cbz 1 ? 91.67 9e-51 X-RAY
 2015-12-23 ARG A:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:101 B:491 298.0 1.0 -62.5 360.0 298.0 1.0 0.0
ARG E:101 E:491 287.0 1.0 33.7 360.0 NA NA NA
ARG F:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cc0 1 ? 88.24 1e-50 X-RAY
 2015-12-23 ARG A:80 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:80 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cc1 1 P04150 84.62 7e-50 X-RAY
 2015-12-23 ARG A:99 A:491 277.0 1.0 49.4 360.0 277.0 1.0 0.0 DC
DA
DG
 7.051
6.339
9.800
 N
N
N
 O3'
OP1
OP1
ARG B:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:99 W:491 265.0 1.0 59.2 360.0 NA NA NA
ARG F:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6bse 1 P79269 86.05 4e-49 X-RAY
 2018-12-05 ARG A:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6bsf 1 P79269 86.05 4e-49 X-RAY
 2018-12-05 ARG A:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3fyl 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 293.0 1.0 -54.7 360.0 293.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.182
3.676
7.535
2.730
 NH2
CG
NH1
NH2
 O4'
OP1
C5'
O
ARG B:75 B:510 246.0 1.0 T -69.1 -58.9 246.0 1.0 0.0 DG
DT
DC
DG
HOH
 8.752
3.485
3.286
6.935
3.652
 NH1
NH2
NH1
NH1
N
 N2
O4'
C5'
OP1
O
3g6p 3 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG C:75 A:510 291.0 1.0 -166.5 360.0 291.0 1.0 0.0 DC
DC
DA
DG
DT
DG
 5.913
3.598
3.361
6.736
9.934
4.710
 NH2
NH2
NH2
NH1
NH2
NH2
 O2
O2
O4'
P
N3
N2
ARG D:75 B:510 217.0 0.964 H -64.0 -39.2 217.0 0.964 0.0 DT
DG
DC
DC
DA
DG
HOH
 9.685
4.499
3.089
3.122
3.163
7.608
2.889
 NH1
NH1
NH2
NH2
NH1
NH1
NH1
 O2
N2
O2
O4'
O4'
P
O
3g6q 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 B:510 297.0 1.0 -90.6 360.0 297.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
 3.664
3.185
7.400
 NH2
NH1
NH1
 O4'
C5'
P
ARG B:75 A:510 230.0 1.0 S -94.8 -53.4 230.0 1.0 0.0 DT
DA
DG
DT
DA
DG
DA
DA
DC
DT
DC
DT
HOH
 3.558
3.210
6.423
9.672
5.627
3.172
3.527
5.618
9.455
8.624
5.042
8.987
9.334
 NH2
NH1
NH1
NH1
NH2
NH2
NH2
O
O
NH2
NH2
NE
N
 O2
O4'
P
O2
C2
N2
O4'
OP1
OP1
N3
O2
OP2
O
3g6r 3 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG C:75 B:510 149.0 NA -35.9 360.0 149.0 NA NA DC
DA
HOH
 8.605
7.931
2.631
 O
N
N
 O3'
OP1
O
ARG D:75 A:510 215.0 0.956 H -71.1 -46.1 215.0 0.956 0.0 DT
DG
DC
DC
DA
DG
HOH
 9.286
4.216
3.672
2.734
3.139
7.547
2.580
 NH2
NH2
NH2
NH2
NH1
NH1
NH1
 N3
N2
O2
O2
O4'
P
O
3g6u 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 234.0 1.0 T -66.1 -57.3 234.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.667
3.488
7.090
6.073
 NH2
NH1
NH1
N
 C1'
C5'
P
O
ARG B:75 B:510 240.0 1.0 S -66.5 -40.7 240.0 1.0 0.0 DT
DA
DG
HOH
 3.894
3.347
7.429
4.783
 NH2
NH1
NH1
N
 O4'
C5'
P
O
3g8u 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 232.0 1.0 H -55.6 -61.5 232.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.666
3.473
6.683
2.887
 NH2
NE
NH1
N
 C2'
C5'
P
O
ARG B:75 B:510 146.0 NA -74.9 360.0 146.0 NA NA DT
DG
HOH
 8.721
7.071
9.404
 N
N
N
 O3'
OP1
O
3g8x 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 216.0 0.96 H -75.4 -73.9 216.0 0.96 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.944
2.898
6.032
6.086
 NE
NE
CD
NH1
 O3'
C5'
OP1
O
ARG B:75 B:510 190.0 0.844 G -71.6 14.9 190.0 0.844 0.0 DT
DG
HOH
 9.172
7.453
9.946
 N
N
CG
 O3'
OP1
O
3g97 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:75 A:510 144.0 NA -96.6 360.0 144.0 NA NA DT
DG
DG
HOH
 6.076
5.310
9.284
3.781
 CB
N
N
O
 O3'
OP1
OP2
O
3g99 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 219.0 0.973 H -53.1 -62.8 219.0 0.973 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.461
3.249
7.150
2.908
 NH1
NE
NE
NH1
 O4'
C5'
P
O
ARG B:75 B:510 152.0 NA -109.9 360.0 152.0 NA NA DT
DA
DG
 6.221
5.795
9.460
 CB
N
N
 O3'
OP1
OP2
3g9i 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 231.0 1.0 S -70.3 -47.2 231.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.138
3.391
7.331
3.045
 NH2
NH1
NH1
O
 O4'
C5'
P
O
ARG B:75 B:510 228.0 1.0 H -56.9 -57.1 228.0 1.0 0.0 DT
DA
DG
DT
DA
DG
DA
DA
DC
DT
DC
DT
HOH
 3.444
3.578
6.722
9.795
5.752
3.692
4.207
5.408
8.888
8.752
5.369
8.644
2.755
 NH2
CZ
NH1
NH2
NH2
NH2
NH2
CG
O
NH2
NH2
NH2
O
 O2
C5'
P
N3
C2
N2
O4'
OP1
OP1
O2
O2
OP1
O
3g9j 3 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG C:75 A:510 286.0 1.0 -99.8 360.0 286.0 1.0 0.0 DC
DC
DA
DG
DG
HOH
 5.460
3.267
3.892
8.084
6.769
5.684
 NH2
NH2
NH1
NH1
NH1
NH2
 O2
C4'
C5'
P
N2
O
ARG D:75 B:510 215.0 0.956 H -65.5 -33.6 215.0 0.956 0.0 DT
DG
DC
DC
DA
DG
HOH
 9.390
4.376
3.118
2.664
2.872
7.590
4.286
 NH2
NH1
NH2
NH2
NH1
NH1
CB
 O4
N2
O2
O4'
O4'
P
O
3g9m 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 A:510 171.0 0.76 H -74.4 -31.4 171.0 0.76 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.423
3.467
8.900
3.363
 CD
CD
CB
CB
 O3'
OP1
OP1
O
ARG B:75 B:510 230.0 1.0 H -74.0 -31.5 230.0 1.0 0.0 DT
DC
DG
DG
HOH
 3.654
3.582
8.611
9.288
2.495
 NH1
CB
NH1
NH1
NH1
 O4'
OP1
P
N2
O
3g9o 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:75 B:510 256.0 1.0 T -76.5 5.5 256.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.297
3.475
7.245
7.577
 NH2
NH1
NH1
NH1
 O4'
C5'
P
O
ARG B:75 A:510 222.0 0.987 -53.8 -72.1 222.0 0.987 0.0 DT
DC
DG
HOH
 3.845
3.402
7.036
5.525
 NH1
CG
NH2
CG
 C1'
OP1
P
O
3g9p 1 P06536 85.06 8e-49 X-RAY
 2009-04-14 ARG A:75 B:510 256.0 1.0 T -76.5 5.5 256.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.297
3.475
7.245
7.577
 NH2
NH1
NH1
NH1
 O4'
C5'
P
O
ARG B:75 A:510 222.0 0.987 -53.8 -72.1 222.0 0.987 0.0 DT
DC
DG
HOH
 3.845
3.402
7.036
5.525
 NH1
CG
NH2
CG
 C1'
OP1
P
O
1r4o 2 P06536 83.15 8e-49 X-RAY
 2003-10-21 ARG C:77 A:510 202.0 0.898 -85.8 -171.9 202.0 0.898 0.0 DC
DC
DA
DG
HOH
 7.949
4.328
4.280
9.268
5.345
 O
O
O
N
O
 O3'
O3'
OP1
OP2
O
ARG D:77 B:510 168.0 0.747 S 65.6 23.7 168.0 0.747 0.0 DG
DC
DC
DA
DG
HOH
 8.570
7.801
4.353
3.687
8.728
3.273
 O
CG
CB
CB
O
O
 N2
O3'
O3'
OP1
P
O
1r4r 3 P06536 83.15 8e-49 X-RAY
 2003-10-28 ARG C:77 A:510 299.0 1.0 48.7 360.0 299.0 1.0 0.0 DA
DG
 9.621
7.828
 O
O
 O3'
OP1
ARG D:77 B:510 298.0 1.0 -117.3 360.0 298.0 1.0 0.0 DG
 8.729
 CG
 OP1
4ond 1 ? 87.8 1e-48 X-RAY
 2014-10-29 ARG A:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:77 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5e69 1 P04150 83.52 1e-48 X-RAY
 2017-02-08 ARG A:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5e6a 1 P04150 83.52 1e-48 X-RAY
 2017-02-08 ARG A:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5e6b 1 P04150 83.52 1e-48 X-RAY
 2017-02-08 ARG A:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5e6c 1 P04150 83.52 1e-48 X-RAY
 2017-02-08 ARG A:99 A:491 231.0 1.0 T -60.2 -37.1 231.0 1.0 0.0 DG
DT
DG
DG
DA
DC
DC
DA
DC
DT
HOH
 5.687
3.027
3.213
3.422
8.103
9.478
6.368
3.894
5.317
7.208
4.796
 NH2
NH2
NH1
NH1
NH1
NH1
NH1
NH2
NH2
NH2
CB
 N2
O2
N3
O4'
P
N3
O2
C2
O2
O4'
O
ARG B:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5e6d 3 P04150 83.52 1e-48 X-RAY
 2017-02-08 ARG C:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cbx 1 ? 92.41 2e-48 X-RAY
 2015-12-23 ARG A:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG F:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6cfn 1 P04150 86.05 2e-48 X-RAY
 2018-09-26 ARG A:75 A:491 48.0 0.213 H -70.1 -41.2 48.0 0.213 0.0 HOH
 6.301
 NE
 O
ARG B:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:75 C:491 77.0 0.342 H -74.3 -29.9 NA NA NA
ARG D:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG E:75 E:491 70.0 0.311 H -99.4 4.2 NA NA NA
ARG F:75 F:491 86.0 0.382 H -81.3 -15.5 NA NA NA
ARG G:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG H:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5emc 2 P04150 87.21 4e-48 X-RAY
 2016-06-29 ARG B:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG C:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5emp 1 P04150 87.21 4e-48 X-RAY
 2016-06-29 ARG A:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5emq 3 P04150 87.21 4e-48 X-RAY
 2016-06-29 ARG C:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:85 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2c7a 1 P06401 87.18 9e-48 X-RAY
 2006-08-30 ARG A:75 A:637 204.0 0.907 -76.6 104.7 204.0 0.907 0.0 DC
DC
DA
DG
DT
DG
HOH
 3.371
2.740
3.486
4.548
8.581
4.196
7.388
 NH2
NH2
CG
N
CG
NE
NH1
 O2
O4'
O4'
OP1
O2
N2
O
ARG B:75 B:637 231.0 1.0 68.6 78.5 231.0 1.0 0.0 DT
DG
DC
DC
DA
DG
HOH
 8.795
3.902
4.012
3.276
3.057
4.818
6.900
 NE
NE
NH2
NE
CD
N
NH1
 O2
N2
O2
O2
O4'
OP1
O
1glu 2 P06536 87.5 3e-47 X-RAY
 1994-01-31 ARG C:77 A:510 227.0 1.0 -52.6 105.7 227.0 1.0 0.0 DC
DC
DA
 9.576
6.489
5.781
 O
O
O
 O3'
O3'
OP1
ARG D:77 B:510 154.0 0.684 H -72.1 -3.5 154.0 0.684 0.0 DC
DC
DA
DG
DG
HOH
 5.766
3.677
4.259
8.273
9.268
9.060
 NH1
CZ
CG
N
CB
NH2
 O3'
C5'
OP1
OP1
N2
O
3g6t 1 P06536 84.09 3e-47 X-RAY
 2009-04-21 ARG A:76 A:511 233.0 1.0 T -73.1 -58.6 233.0 1.0 0.0 DA
DA
DG
HOH
 3.905
3.222
7.116
5.172
 NH2
CD
NH1
N
 O4'
C5'
P
O
ARG B:76 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cby 1 ? 91.14 4e-47 X-RAY
 2015-12-23 ARG A:101 A:491 148.0 0.658 -66.4 130.8 148.0 0.658 0.0 DC
DA
HOH
 9.206
7.375
5.864
 N
N
N
 O3'
OP1
O
ARG B:101 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4hn6 1 P04150 81.32 1e-46 X-RAY
 2012-12-12 ARG A:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:99 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6x6e 1 P04150 90.67 9e-46 X-RAY
 2021-06-02 ARG A:75 A:491 279.0 1.0 62.7 360.0 279.0 1.0 0.0 DC
DC
DA
DG
 9.378
7.918
7.030
9.028
 NH2
C
C
O
 O3'
O3'
C5'
OP1
ARG B:75 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p08235-f1 1 P08235 100.0 0.0 ARG A:673 A:673 176.0 0.782 G -64.0 -11.0