Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 88119584 | . | T | A | CCDS47244.1:NM_001131005.2:c.22Att>Ttt_NP_001124477.1:p.8I>F | Homo sapiens myocyte enhancer factor 2C (MEF2C), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5f28 | 1 | Q8CFN5 | 97.8 | 5e-59 |
X-RAY |
2016-07-13 | ILE | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | B:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | C:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3kov | 1 | Q02078 | 96.67 | 1e-57 |
X-RAY |
2010-02-16 | ILE | A:7 | A:8 | 146.0 | 0.834 | S | -59.9 | 113.8 | 39.0 | 0.223 | 0.611 |
B:Q02078:0.611 |
DT DT DA DT DA DA DA DA DA DA DG |
9.576 7.888 8.773 8.262 7.902 9.692 8.536 6.171 6.102 7.755 9.871 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 OP2 O3' OP1 OP1 OP1 OP1 |
|
| ILE | B:7 | B:8 | 147.0 | 0.84 | S | -59.2 | 113.4 | 38.0 | 0.217 | 0.623 |
A:Q02078:0.623 |
DT DA DT DA DA DA DA DA DA |
7.927 9.375 8.433 6.922 9.710 8.408 6.364 6.877 8.455 |
CD1 CD1 CD1 CD1 N CD1 CD1 CD1 CD1 |
OP1 OP1 OP1 OP1 OP1 O3' OP1 OP1 OP1 |
||||||||
| ILE | C:7 | I:8 | 146.0 | 0.834 | S | -60.7 | 113.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:7 | J:8 | 146.0 | 0.834 | S | -61.5 | 113.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3p57 | 1 | Q02078 | 96.67 | 1e-57 |
X-RAY |
2011-08-10 | ILE | A:7 | A:8 | 146.0 | 0.834 | S | -86.8 | 88.3 | 39.0 | 0.223 | 0.611 |
B:Q02078:0.611 |
DT DA DA DA DA HOH |
9.011 6.945 8.638 6.556 7.845 2.909 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 O |
|
| ILE | B:7 | B:8 | 146.0 | 0.834 | S | -80.0 | 85.6 | 42.0 | 0.24 | 0.594 |
A:Q02078:0.594 |
DT DT DA DT DA HOH |
8.768 6.660 8.104 9.262 6.983 3.006 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
||||||||
| ILE | C:7 | C:8 | 146.0 | 0.834 | S | -74.9 | 89.8 | 40.0 | 0.229 | 0.605 |
D:Q02078:0.606 |
DT DT DA DT DA HOH |
8.681 6.587 8.228 9.150 6.928 5.366 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
||||||||
| ILE | D:7 | D:8 | 144.0 | 0.823 | S | -90.6 | 86.7 | 48.0 | 0.274 | 0.549 |
C:Q02078:0.549 |
DT DA DA DA DA HOH |
9.085 6.798 8.607 6.594 8.071 3.733 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CG1 |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 O |
||||||||
| ILE | E:7 | I:8 | 145.0 | 0.829 | S | -80.4 | 87.9 | 41.0 | 0.234 | 0.595 |
F:Q02078:0.594 |
DT DT DA DT DA HOH |
8.736 6.614 7.852 8.888 6.973 5.342 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 O |
O3' OP1 OP1 O3' OP1 O |
||||||||
| ILE | F:7 | J:8 | 141.0 | 0.806 | S | -86.3 | 87.4 | 42.0 | 0.24 | 0.566 |
E:Q02078:0.566 |
DT DA DA DA DA HOH |
9.160 7.347 8.489 6.483 8.137 3.739 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 O |
||||||||
| 6byy | 1 | Q02078,Q02080 | 89.47 | 3e-57 |
X-RAY |
2018-01-31 | ILE | A:8 | A:8 | 151.0 | 0.863 | S | -84.2 | 82.9 | 43.0 | 0.246 | 0.617 |
B:Q02078+Q02080:0.617 |
DT DT DA DT DA HOH |
8.805 6.750 8.021 8.902 6.766 3.122 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 O |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
|
| ILE | B:8 | B:8 | 146.0 | 0.834 | S | -80.8 | 88.6 | 45.0 | 0.257 | 0.577 |
A:Q02078+Q02080:0.577 |
DT DA DA DA DA HOH |
8.951 6.910 8.266 6.300 8.058 3.115 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 O |
||||||||
| ILE | C:8 | C:8 | 157.0 | 0.897 | S | -73.4 | 76.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:8 | D:8 | 160.0 | 0.914 | S | -93.6 | 69.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6wc2 | 1 | Q02078,Q02080 | 89.47 | 3e-57 |
X-RAY |
2020-07-22 | ILE | A:8 | A:8 | 147.0 | 0.84 | S | -84.8 | 89.9 | 43.0 | 0.246 | 0.594 |
B:Q02078+Q02080:0.594 |
DT DA DT DT DT HOH |
8.959 6.666 8.830 6.724 8.011 4.130 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 O |
|
| ILE | B:8 | B:8 | 147.0 | 0.84 | -87.7 | 89.4 | 39.0 | 0.223 | 0.617 |
A:Q02078+Q02080:0.617 |
DA DA DA DA DA HOH |
8.901 6.958 7.865 9.139 7.484 2.963 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 O |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
|||||||||
| ILE | C:8 | C:8 | 150.0 | 0.857 | S | -83.4 | 87.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:8 | D:8 | 144.0 | 0.823 | S | -85.0 | 88.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | I:8 | I:8 | 146.0 | 0.834 | S | -86.1 | 87.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | J:8 | J:8 | 151.0 | 0.863 | S | -84.7 | 86.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1tqe | 3 | Q02080 | 86.02 | 8e-56 |
X-RAY |
2004-12-21 | ILE | E:8 | P:8 | 160.0 | 0.914 | -106.9 | 101.3 | 59.0 | 0.337 | 0.577 |
F:Q02080:0.577 |
DA DA DA DA |
8.310 7.892 5.918 8.274 |
CG1 CD1 CD1 CD1 |
OP1 O3' OP1 OP1 |
||
| ILE | F:8 | Q:8 | 159.0 | 0.909 | S | -104.9 | 102.6 | 55.0 | 0.314 | 0.595 |
E:Q02080:0.594 |
DT DT DA DA |
8.232 5.807 8.640 8.299 |
CD1 CD1 CD1 CG1 |
O3' OP1 OP1 OP1 |
||||||||
| ILE | H:8 | R:8 | 161.0 | 0.92 | -107.6 | 101.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | I:8 | S:8 | 158.0 | 0.903 | S | -105.0 | 101.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6c9l | 1 | Q02080 | 86.02 | 8e-56 |
X-RAY |
2018-02-07 | ILE | A:8 | A:8 | 154.0 | 0.88 | -100.1 | 138.5 | 55.0 | 0.314 | 0.566 |
B:Q02080:0.566 |
HOH |
7.418 |
CD1 |
O |
||
| ILE | B:8 | B:8 | 128.0 | 0.731 | G | -64.1 | -33.9 | 68.0 | 0.389 | 0.342 |
A:Q02080:0.343 |
HOH |
2.627 |
O |
O |
||||||||
| ILE | C:8 | C:8 | 125.0 | 0.714 | G | -54.9 | -35.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:8 | D:8 | 153.0 | 0.874 | -99.6 | 139.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | E:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:8 | F:8 | 213.0 | 1.0 | 360.0 | 137.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6bz1 | 1 | Q02078,Q02080 | 88.42 | 9e-56 |
X-RAY |
2018-02-07 | ILE | A:8 | C:8 | 145.0 | 0.829 | S | -98.9 | 80.5 | 40.0 | 0.229 | 0.6 |
B:Q02078+Q02080:0.6 |
DT DA DA DA DA |
8.793 6.420 9.222 7.138 7.813 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
O3' OP1 O3' OP1 OP1 |
|
| ILE | B:8 | D:8 | 149.0 | 0.851 | S | -98.7 | 78.5 | 47.0 | 0.269 | 0.582 |
A:Q02078+Q02080:0.583 |
DT DT DA DT DA |
9.137 6.945 8.116 8.991 6.477 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
O3' OP1 OP1 O3' OP1 |
||||||||
| ILE | E:8 | A:8 | 144.0 | 0.823 | S | -98.2 | 76.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:8 | B:8 | 157.0 | 0.897 | S | -100.1 | 77.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1n6j | 3 | Q02080 | 85.87 | 6e-55 |
X-RAY |
2003-11-11 | ILE | C:7 | A:8 | 151.0 | 0.863 | S | -90.9 | 89.8 | 49.0 | 0.28 | 0.583 |
D:Q02080:0.583 |
DT DT DA DT DA HOH |
8.472 6.566 8.227 9.163 6.988 2.810 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
|
| ILE | D:7 | B:8 | 150.0 | 0.857 | S | -90.6 | 88.5 | 49.0 | 0.28 | 0.577 |
C:Q02080:0.577 |
DT DA DA DA DA HOH |
9.141 6.823 8.453 6.475 8.194 2.965 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
||||||||
| 6wc5 | 1 | Q02080 | 86.67 | 8e-54 |
X-RAY |
2020-07-22 | ILE | A:7 | A:8 | 153.0 | 0.874 | S | -86.1 | 87.2 | 55.0 | 0.314 | 0.56 |
B:Q02080:0.56 |
DT DA DT DT DT |
9.139 6.869 8.647 6.649 7.961 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
O3' OP1 O3' OP1 OP1 |
|
| ILE | B:7 | B:8 | 169.0 | 0.966 | S | -87.8 | 86.2 | 60.0 | 0.343 | 0.623 |
A:Q02080:0.623 |
DA DA DA DA |
8.768 6.450 8.194 8.835 |
CD1 CD1 CD1 CG1 |
O3' OP1 OP1 OP1 |
||||||||
| ILE | C:7 | C:8 | 144.0 | 0.823 | S | -87.7 | 85.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:7 | D:8 | 144.0 | 0.823 | S | -86.7 | 86.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1egw | 3 | Q02078 | 98.7 | 9e-50 |
X-RAY |
2000-03-20 | ILE | E:7 | A:8 | 142.0 | 0.811 | S | -93.3 | 91.7 | 49.0 | 0.28 | 0.531 |
F:Q02078:0.531 |
DT DA DT DT DA DT DA DA DT DA HOH |
9.090 7.288 8.155 8.657 6.236 8.798 6.675 8.051 8.702 6.622 2.902 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 OP1 O3' OP1 O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
|
| ILE | F:7 | B:8 | 144.0 | 0.823 | S | -90.6 | 90.3 | 48.0 | 0.274 | 0.549 |
E:Q02078:0.549 |
DT DA DT DT DA DT DA DA DT DA HOH |
8.687 6.544 8.203 8.624 6.228 8.939 7.118 8.247 8.789 6.582 2.941 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 N |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 O3' OP1 OP1 C5' OP1 O |
||||||||
| ILE | G:7 | C:8 | 145.0 | 0.829 | S | -92.1 | 89.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | H:7 | D:8 | 143.0 | 0.817 | S | -91.4 | 91.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3mu6 | 1 | Q02078 | 97.18 | 2e-43 |
X-RAY |
2011-11-02 | ILE | A:7 | A:8 | 138.0 | 0.789 | S | -81.2 | 86.1 | 41.0 | 0.234 | 0.555 |
B:Q02078:0.554 |
DT DA DT DA DA |
9.012 6.588 9.113 7.054 8.251 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
C5' OP1 O3' OP1 OP1 |
|
| ILE | B:7 | B:8 | 138.0 | 0.789 | S | -81.3 | 86.1 | 42.0 | 0.24 | 0.549 |
A:Q02078:0.549 |
DT DA DT DT DA |
9.219 7.145 8.439 8.984 6.685 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CD1 |
O3' OP1 OP1 C5' OP1 |
||||||||
| ILE | E:7 | C:8 | 139.0 | 0.794 | S | -81.5 | 86.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:7 | D:8 | 137.0 | 0.783 | S | -81.7 | 86.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q06413-f1 | 1 | Q06413 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:8 | A:8 | 146.0 | 0.834 | S | -90.9 | 75.1 | |