Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 41739493 | . | G | A | CCDS3937.1:NM_000436.3:c.1520gCa>gTa_NP_000427.1:p.507A>V | Homo sapiens 3-oxoacid CoA-transferase 1 (OXCT1), mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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X-RAY |
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O |
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HOH |
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N |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2002-12-23 | ALA | A:468 | A:507 | 54.0 | 0.47 | E | -82.4 | 173.6 | 54.0 | 0.47 | 0.0 |
HOH |
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N |
O |
||
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X-RAY |
2004-04-27 | ALA | A:468 | A:468 | 54.0 | 0.47 | E | -83.2 | 156.9 | 54.0 | 0.47 | 0.0 |
HOH |
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CA |
O |
||
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HOH |
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CA |
O |
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X-RAY |
2010-07-07 | ALA | A:468 | A:468 | 55.0 | 0.478 | E | -82.5 | 153.5 | 55.0 | 0.478 | 0.0 |
HOH |
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O |
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HOH |
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CB |
O |
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X-RAY |
2010-11-10 | ALA | A:468 | A:468 | 57.0 | 0.496 | E | -74.5 | 154.2 | 57.0 | 0.496 | 0.0 |
HOH |
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N |
O |
||
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X-RAY |
2007-09-18 | ALA | A:468 | A:468 | 54.0 | 0.47 | E | -86.0 | 162.4 | 54.0 | 0.47 | 0.0 |
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N |
O |
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X-RAY |
2007-09-18 | ALA | A:468 | A:468 | 53.0 | 0.461 | E | -85.5 | 159.6 | 53.0 | 0.461 | 0.0 |
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O |
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O |
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X-RAY |
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X-RAY |
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AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p55809-f1 | 1 | P55809 | 100.0 | 0.0 | ALA | A:507 | A:507 | 53.0 | 0.461 | E | -78.1 | 156.2 |