Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 41805776 | . | G | A | CCDS3937.1:NM_000436.3:c.848tCa>tTa_NP_000427.1:p.283S>L | Homo sapiens 3-oxoacid CoA-transferase 1 (OXCT1), mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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2008-08-12 | SER | A:245 | A:283 | 20.0 | 0.174 | -106.1 | 107.8 | 20.0 | 0.174 | 0.0 |
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O |
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O |
O |
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1m3e | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
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O |
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O |
||||||||||
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1o9l | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2002-12-23 | SER | A:244 | A:283 | 19.0 | 0.165 | -117.6 | 103.8 | 19.0 | 0.165 | 0.0 |
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C |
O |
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O |
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X-RAY |
2004-04-27 | SER | A:244 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
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O |
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X-RAY |
2010-07-07 | SER | A:244 | A:244 | 19.0 | 0.165 | -121.3 | 104.6 | 19.0 | 0.165 | 0.0 |
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O |
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HOH |
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O |
||||||||||
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X-RAY |
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N |
O |
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HOH |
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O |
||||||||||
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O |
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O |
O |
||||||||||
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HOH |
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O |
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O |
||||||||||
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X-RAY |
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O |
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O |
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1ope | 1 | Q29551 | 91.86 | 0.0 |
X-RAY |
2004-04-27 | SER | A:244 | A:244 | 20.0 | 0.174 | -125.6 | 110.2 | 20.0 | 0.174 | 0.0 |
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O |
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5.789 |
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AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p55809-f1 | 1 | P55809 | 100.0 | 0.0 | SER | A:283 | A:283 | 22.0 | 0.191 | -116.0 | 119.2 |