Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 41807470 | . | C | A | CCDS3937.1:NM_000436.3:c.803cGc>cTc_NP_000427.1:p.268R>L | Homo sapiens 3-oxoacid CoA-transferase 1 (OXCT1), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3dlx | 1 | P55809 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-08-12 | ARG | A:230 | A:268 | 36.0 | 0.16 | E | -134.4 | 132.6 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
3.072 |
NE |
O |
||
ARG | B:230 | B:268 | 38.0 | 0.169 | E | -128.1 | 137.9 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
HOH |
3.050 |
NE |
O |
|||||||||
ARG | C:230 | C:268 | 32.0 | 0.142 | E | -133.3 | 135.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:230 | D:268 | 33.0 | 0.147 | E | -144.2 | 139.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1m3e | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-07 | ARG | A:229 | A:229 | 38.0 | 0.169 | E | -127.7 | 130.4 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
HOH |
2.719 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 37.0 | 0.164 | E | -127.9 | 129.2 | 37.0 | 0.164 | 0.0 |
HOH |
3.039 |
NH2 |
O |
|||||||||
ARG | C:229 | C:229 | 37.0 | 0.164 | E | -127.2 | 130.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | D:229 | 38.0 | 0.169 | E | -127.4 | 131.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1o9l | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2002-12-23 | ARG | A:229 | A:268 | 34.0 | 0.151 | E | -129.9 | 133.6 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
3.288 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:268 | 34.0 | 0.151 | E | -126.8 | 134.5 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.880 |
NE |
O |
|||||||||
ARG | C:229 | C:268 | 33.0 | 0.147 | E | -128.7 | 131.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | D:268 | 35.0 | 0.156 | E | -131.0 | 136.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ooy | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2004-04-27 | ARG | A:229 | A:229 | 34.0 | 0.151 | E | -128.6 | 137.5 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.863 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 36.0 | 0.16 | E | -127.6 | 137.5 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
2.793 |
NE |
O |
|||||||||
3k6m | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2010-07-07 | ARG | A:229 | A:229 | 35.0 | 0.156 | E | -134.1 | 133.4 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
HOH |
3.044 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | D:229 | 37.0 | 0.164 | E | -132.4 | 135.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | C:229 | C:229 | 31.0 | 0.138 | E | -137.2 | 134.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | B:229 | 36.0 | 0.16 | E | -136.5 | 137.1 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
2.991 |
NE |
O |
|||||||||
3oxo | 1 | Q29551 | 92.07 | 0.0 |
X-RAY |
2010-11-10 | ARG | A:229 | A:229 | 38.0 | 0.169 | E | -132.7 | 133.4 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
HOH |
6.398 |
N |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 38.0 | 0.169 | E | -132.2 | 131.7 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
HOH |
6.689 |
N |
O |
|||||||||
ARG | C:229 | C:229 | 38.0 | 0.169 | E | -132.6 | 133.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | D:229 | 39.0 | 0.173 | E | -131.6 | 132.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | E:229 | E:229 | 39.0 | 0.173 | E | -131.1 | 132.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | F:229 | F:229 | 39.0 | 0.173 | E | -132.5 | 133.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | G:229 | G:229 | 38.0 | 0.169 | E | -132.3 | 133.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | H:229 | H:229 | 39.0 | 0.173 | E | -132.2 | 132.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2nrc | 1 | Q29551 | 91.86 | 0.0 |
X-RAY |
2007-09-18 | ARG | A:229 | A:229 | 37.0 | 0.164 | E | -128.5 | 136.4 | 37.0 | 0.164 | 0.0 |
HOH |
8.233 |
CA |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 38.0 | 0.169 | E | -128.4 | 132.9 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
HOH |
3.047 |
NE |
O |
|||||||||
ARG | C:229 | C:229 | 37.0 | 0.164 | E | -128.4 | 125.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | D:229 | 38.0 | 0.169 | E | -129.3 | 139.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2nrb | 1 | Q29551 | 91.86 | 0.0 |
X-RAY |
2007-09-18 | ARG | A:229 | A:229 | 34.0 | 0.151 | E | -128.2 | 135.9 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
3.097 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 34.0 | 0.151 | E | -129.8 | 134.6 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
3.880 |
NH1 |
O |
|||||||||
ARG | C:229 | C:229 | 35.0 | 0.156 | E | -133.8 | 132.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:229 | D:229 | 32.0 | 0.142 | E | -121.4 | 129.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ooz | 1 | Q29551 | 91.86 | 0.0 |
X-RAY |
2004-04-27 | ARG | A:229 | A:229 | 35.0 | 0.156 | E | -131.5 | 135.1 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
HOH |
2.874 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 34.0 | 0.151 | E | -132.8 | 136.4 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.971 |
NE |
O |
|||||||||
1ope | 1 | Q29551 | 91.86 | 0.0 |
X-RAY |
2004-04-27 | ARG | A:229 | A:229 | 33.0 | 0.147 | E | -135.3 | 134.7 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
HOH |
3.257 |
NE |
O |
||
ARG | B:229 | B:229 | 34.0 | 0.151 | E | -136.5 | 137.0 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.997 |
NE |
O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p55809-f1 | 1 | P55809 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:268 | A:268 | 31.0 | 0.138 | E | -128.3 | 137.2 |