Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr5 88100539 . A C CCDS47244.1:NM_001131005.2:c.134cTg>cGg_NP_001124477.1:p.45L>R Homo sapiens myocyte enhancer factor 2C (MEF2C), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5f28 1 Q8CFN5 97.8 5e-59 X-RAY
 2016-07-13 LEU A:45 A:45 36.0 0.212 E -137.6 123.3 0.0 0.0 0.212 B:Q8CFN5:0.212
LEU B:45 B:45 38.0 0.224 E -136.7 123.7 1.0 0.006 0.218 A:Q8CFN5:0.218
LEU C:45 C:45 40.0 0.235 E -139.7 120.5 NA NA NA
LEU D:45 D:45 34.0 0.2 E -141.7 114.7 NA NA NA
3kov 1 Q02078 96.67 1e-57 X-RAY
 2010-02-16 LEU A:44 A:45 38.0 0.224 E -128.4 126.5 2.0 0.012 0.212 B:Q02078:0.212
LEU B:44 B:45 40.0 0.235 E -132.5 124.1 2.0 0.012 0.223 A:Q02078:0.224
LEU C:44 I:45 39.0 0.229 E -129.5 126.5 NA NA NA
LEU D:44 J:45 37.0 0.218 E -127.8 128.3 NA NA NA
3p57 1 Q02078 96.67 1e-57 X-RAY
 2011-08-10 LEU A:44 A:45 38.0 0.224 E -130.3 127.0 0.0 0.0 0.224 B:Q02078:0.224
 HOH
 6.773
 O
 O
LEU B:44 B:45 35.0 0.206 E -135.7 119.5 0.0 0.0 0.206 A:Q02078:0.206
 HOH
 6.590
 O
 O
LEU C:44 C:45 36.0 0.212 E -133.1 126.9 0.0 0.0 0.212 D:Q02078:0.212
 HOH
 8.788
 CD2
 O
LEU D:44 D:45 33.0 0.194 E -131.5 121.3 0.0 0.0 0.194 C:Q02078:0.194
 HOH
 6.893
 O
 O
LEU E:44 I:45 38.0 0.224 E -134.7 127.7 0.0 0.0 0.224 F:Q02078:0.224
 HOH
 8.766
 CD2
 O
LEU F:44 J:45 37.0 0.218 E -132.3 124.9 0.0 0.0 0.218 E:Q02078:0.218
 HOH
 7.215
 O
 O
6byy 1 Q02078,Q02080 89.47 3e-57 X-RAY
 2018-01-31 LEU A:45 A:45 37.0 0.218 E -136.8 116.8 1.0 0.006 0.212 B:Q02078+Q02080:0.212
 HOH
 6.749
 O
 O
LEU B:45 B:45 36.0 0.212 E -131.6 127.4 2.0 0.012 0.2 A:Q02078+Q02080:0.2
 HOH
 6.977
 O
 O
LEU C:45 C:45 35.0 0.206 E -141.8 120.1 NA NA NA
LEU D:45 D:45 38.0 0.224 E -125.5 126.9 NA NA NA
6wc2 1 Q02078,Q02080 89.47 3e-57 X-RAY
 2020-07-22 LEU A:45 A:45 38.0 0.224 E -133.3 120.3 1.0 0.006 0.218 B:Q02078+Q02080:0.218
 HOH
 6.921
 O
 O
LEU B:45 B:45 36.0 0.212 E -131.5 119.1 1.0 0.006 0.206 A:Q02078+Q02080:0.206
 HOH
 6.878
 O
 O
LEU C:45 C:45 39.0 0.229 E -132.7 124.2 NA NA NA
LEU D:45 D:45 37.0 0.218 E -133.7 120.8 NA NA NA
LEU I:45 I:45 40.0 0.235 E -138.7 125.3 NA NA NA
LEU J:45 J:45 38.0 0.224 E -133.3 123.9 NA NA NA
1tqe 3 Q02080 86.02 8e-56 X-RAY
 2004-12-21 LEU E:45 P:45 38.0 0.224 E -130.1 117.2 1.0 0.006 0.218 F:Q02080:0.218
LEU F:45 Q:45 37.0 0.218 E -129.9 119.8 1.0 0.006 0.212 E:Q02080:0.212
LEU H:45 R:45 37.0 0.218 E -131.7 116.4 NA NA NA
LEU I:45 S:45 36.0 0.212 E -130.5 118.9 NA NA NA
6c9l 1 Q02080 86.02 8e-56 X-RAY
 2018-02-07 LEU A:45 A:45 34.0 0.2 E -135.5 125.3 1.0 0.006 0.194 B:Q02080:0.194
 HOH
 6.486
 O
 O
LEU B:45 B:45 38.0 0.224 E -136.2 125.7 2.0 0.012 0.212 A:Q02080:0.212
 HOH
 6.529
 O
 O
LEU C:45 C:45 37.0 0.218 E -136.4 125.6 NA NA NA
LEU D:45 D:45 37.0 0.218 E -135.7 124.5 NA NA NA
LEU E:45 E:45 36.0 0.212 E -135.0 125.6 NA NA NA
LEU F:45 F:45 35.0 0.206 E -134.2 125.5 NA NA NA
6bz1 1 Q02078,Q02080 88.42 9e-56 X-RAY
 2018-02-07 LEU A:45 C:45 36.0 0.212 E -134.9 107.8 1.0 0.006 0.206 B:Q02078+Q02080:0.206
LEU B:45 D:45 39.0 0.229 E -138.4 108.5 2.0 0.012 0.217 A:Q02078+Q02080:0.218
LEU E:45 A:45 37.0 0.218 E -136.8 106.4 NA NA NA
LEU F:45 B:45 37.0 0.218 E -137.7 107.7 NA NA NA
1n6j 3 Q02080 85.87 6e-55 X-RAY
 2003-11-11 LEU C:44 A:45 38.0 0.224 E -131.5 126.1 1.0 0.006 0.218 D:Q02080:0.218
 HOH
 6.706
 O
 O
LEU D:44 B:45 38.0 0.224 E -130.1 128.8 1.0 0.006 0.218 C:Q02080:0.218
 HOH
 6.495
 O
 O
6wc5 1 Q02080 86.67 8e-54 X-RAY
 2020-07-22 LEU A:44 A:45 35.0 0.206 E -130.8 118.1 0.0 0.0 0.206 B:Q02080:0.206
LEU B:44 B:45 36.0 0.212 E -130.4 118.5 0.0 0.0 0.212 A:Q02080:0.212
 HOH
 8.540
 CD2
 O
LEU C:44 C:45 35.0 0.206 E -131.1 118.6 NA NA NA
LEU D:44 D:45 35.0 0.206 E -129.9 118.1 NA NA NA
1egw 3 Q02078 98.7 9e-50 X-RAY
 2000-03-20 LEU E:44 A:45 36.0 0.212 E -133.3 122.2 0.0 0.0 0.212 F:Q02078:0.212
 HOH
 6.871
 O
 O
LEU F:44 B:45 36.0 0.212 E -134.9 122.3 1.0 0.006 0.206 E:Q02078:0.206
 HOH
 6.396
 O
 O
LEU G:44 C:45 36.0 0.212 E -134.8 120.7 NA NA NA
LEU H:44 D:45 35.0 0.206 E -133.1 121.2 NA NA NA
3mu6 1 Q02078 97.18 2e-43 X-RAY
 2011-11-02 LEU A:44 A:45 35.0 0.206 E -135.5 113.4 0.0 0.0 0.206 B:Q02078:0.206
 BXL
 9.546
 O
 C16
LEU B:44 B:45 35.0 0.206 E -135.9 112.2 0.0 0.0 0.206 A:Q02078:0.206
LEU E:44 C:45 35.0 0.206 E -135.3 114.0 NA NA NA
LEU F:44 D:45 34.0 0.2 E -135.5 114.2 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q06413-f1 1 Q06413 100.0 0.0 LEU A:45 A:45 36.0 0.212 E -139.6 118.0