Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 88100573 | . | C | A | CCDS47244.1:NM_001131005.2:c.100Gag>Tag_NP_001124477.1:p.34E>* | Homo sapiens myocyte enhancer factor 2C (MEF2C), transcript variant 1, mRNA. |
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|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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O |
O |
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CG |
O |
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DT DT DA DT DA DA DA DA DT DA |
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OE2 OE1 OE1 OE1 O OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 OP1 OP1 O3' O3' OP1 OP1 OP1 |
||||||||
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DT DT DA DA DT DA HOH |
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OE2 OE2 OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 |
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|
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DA DT DA DA DA DA HOH |
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OE1 OE1 OE1 OE2 OE2 OE2 OE1 |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 O |
||||||||
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DA DT DA DA DA DA HOH |
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OE1 OE1 OE1 OE1 OE2 OE2 OE2 |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 O |
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C:Q02078:0.226 |
DT DT DA DA DT DA HOH |
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OE2 OE2 OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
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DA DT DA DA DA DA HOH |
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OE1 OE1 OE1 OE2 OE2 OE2 CB |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 O |
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OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 CB |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
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DT DT DA DA DT DA HOH |
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OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
||||||||
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DA DA DA DT DA DA HOH |
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OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 OE2 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
|
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DA DT DA DT DT DT HOH |
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OE1 OE1 OE1 OE2 OE1 OE1 OE1 |
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||||||||
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DT DT DA DA DT DA |
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OE2 OE2 OE2 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 |
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DA DT DA DA DA DA |
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O |
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CB |
O |
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DT DT DA DA DT DA |
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OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 |
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OE1 OE1 OE1 OE2 OE2 OE2 OE1 |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 O |
|
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OE2 OE2 OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
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DA DA DA DT DT DA DA HOH |
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OE2 OE2 OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 |
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|
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DA DT DA DT DT DT DA |
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OE1 OE1 OE1 OE2 OE2 OE2 OE1 |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 OP2 |
||||||||
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DT DA DT DT DA DT DA DA DT DA HOH |
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OE2 OE1 OE2 OE1 OE1 OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 OP1 OP1 O3' O3' OP1 OP1 OP1 O |
|
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OE2 OE1 OE1 OE1 OE1 OE2 OE1 OE2 OE1 OE1 OE1 |
O3' O3' OP1 OP1 OP1 O3' O3' OP1 OP1 OP1 O |
||||||||
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X-RAY |
2011-11-02 | GLU | A:33 | A:34 | 71.0 | 0.374 | H | -62.2 | -37.9 | 27.0 | 0.142 | 0.232 |
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|
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