Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr5 | 88119589 | . | A | C | CCDS47244.1:NM_001131005.2:c.17aTt>aGt_NP_001124477.1:p.6I>S | Homo sapiens myocyte enhancer factor 2C (MEF2C), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5f28 | 1 | Q8CFN5 | 97.8 | 5e-59 |
X-RAY |
2016-07-13 | ILE | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | B:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | C:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3kov | 1 | Q02078 | 96.67 | 1e-57 |
X-RAY |
2010-02-16 | ILE | A:5 | A:6 | 103.0 | 0.589 | -133.1 | 147.1 | 93.0 | 0.531 | 0.058 |
B:Q02078:0.057 |
DT DT DT DA DT DA DA DA DT DA DA DA DT DA DG DT |
8.690 6.049 5.555 8.376 4.775 3.274 4.333 9.977 9.023 4.292 3.541 7.884 6.402 3.363 3.208 9.719 |
N CD1 N CD1 CD1 CG2 CG2 CD1 CD1 N N CD1 CD1 CG2 CG2 CG2 |
O3' O3' OP1 N3 O3' C4' OP2 C2 O2 O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 OP2 |
||
| ILE | B:5 | B:6 | 101.0 | 0.577 | -131.4 | 149.0 | 91.0 | 0.52 | 0.057 |
A:Q02078:0.057 |
DT DT DA DT DA DA DT DA DA DA DT DA DG |
6.570 5.247 8.216 5.186 3.131 3.936 8.386 4.562 4.246 8.592 7.058 4.496 3.715 |
CD1 CD1 CD1 CD1 CG2 CG2 N N O CD1 CD1 CD1 CG2 |
O3' OP1 N3 O3' C4' OP1 O3' O3' OP1 OP1 O3' C5' OP1 |
|||||||||
| ILE | C:5 | I:6 | 102.0 | 0.583 | -131.7 | 147.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | D:5 | J:6 | 103.0 | 0.589 | -131.2 | 147.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3p57 | 1 | Q02078 | 96.67 | 1e-57 |
X-RAY |
2011-08-10 | ILE | A:5 | A:6 | 95.0 | 0.543 | -115.9 | 153.2 | 87.0 | 0.497 | 0.046 |
B:Q02078:0.046 |
DT DA DA DT DA DA DA HOH |
5.846 3.360 3.971 8.850 5.152 4.364 9.945 2.779 |
CD1 CG2 CG2 N N O O O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 OP2 O |
||
| ILE | B:5 | B:6 | 95.0 | 0.543 | -119.6 | 156.3 | 86.0 | 0.491 | 0.052 |
A:Q02078:0.051 |
DT DT DT DT DA DG HOH |
8.970 5.242 4.639 5.963 3.481 4.040 3.025 |
N N O CD1 CG2 CG2 N |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
|||||||||
| ILE | C:5 | C:6 | 92.0 | 0.526 | -112.0 | 159.6 | 85.0 | 0.486 | 0.04 |
D:Q02078:0.04 |
DT DT DT DT DA DG HOH |
8.904 5.260 4.515 5.943 3.147 3.916 3.884 |
N N O CD1 CG2 CG2 CD1 |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
|||||||||
| ILE | D:5 | D:6 | 94.0 | 0.537 | -110.0 | 139.6 | 86.0 | 0.491 | 0.046 |
C:Q02078:0.046 |
DT DA DA DT DA DA DA HOH |
5.380 3.158 3.842 8.924 5.225 4.734 9.973 3.119 |
CD1 CG2 CG2 N N O O N |
O3' O3' P O3' O3' OP1 OP1 O |
|||||||||
| ILE | E:5 | I:6 | 93.0 | 0.531 | -113.4 | 152.9 | 84.0 | 0.48 | 0.051 |
F:Q02078:0.051 |
DT DT DT DA DT DA DG HOH |
8.923 5.401 4.526 9.914 5.154 3.330 4.065 3.999 |
N N O O CD1 CD1 CG2 CG2 |
O3' O3' OP1 OP1 O3' OP1 OP1 O |
|||||||||
| ILE | F:5 | J:6 | 91.0 | 0.52 | -111.5 | 151.7 | 83.0 | 0.474 | 0.046 |
E:Q02078:0.046 |
DT DA DA DT DA DA DA HOH |
6.039 3.354 3.793 8.965 5.174 4.627 9.985 3.098 |
CD1 CG2 CG2 N N O O N |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 OP2 O |
|||||||||
| 6byy | 1 | Q02078,Q02080 | 89.47 | 3e-57 |
X-RAY |
2018-01-31 | ILE | A:6 | A:6 | 95.0 | 0.543 | -113.7 | 143.2 | 86.0 | 0.491 | 0.052 |
B:Q02078+Q02080:0.051 |
DT DT DT DT DA DG HOH |
9.032 5.473 4.712 5.847 3.213 3.963 2.886 |
N N O CD1 CG2 CG2 N |
O3' O3' OP1 O3' O3' P O |
||
| ILE | B:6 | B:6 | 89.0 | 0.509 | -121.0 | 141.6 | 82.0 | 0.469 | 0.04 |
A:Q02078+Q02080:0.04 |
DT DA DA DT DA DA HOH |
5.787 3.628 3.600 8.764 5.304 4.772 2.990 |
CD1 CG2 CG2 N N O N |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
|||||||||
| ILE | C:6 | C:6 | 79.0 | 0.451 | -93.3 | 145.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | D:6 | D:6 | 92.0 | 0.526 | -110.6 | 154.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6wc2 | 1 | Q02078,Q02080 | 89.47 | 3e-57 |
X-RAY |
2020-07-22 | ILE | A:6 | A:6 | 92.0 | 0.526 | -112.2 | 151.0 | 84.0 | 0.48 | 0.046 |
B:Q02078+Q02080:0.046 |
DT DA DG DT DT DT HOH |
5.928 3.384 4.058 8.900 5.378 4.668 2.733 |
CD1 CG2 CG2 N N O O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
||
| ILE | B:6 | B:6 | 110.0 | 0.629 | 66.1 | 93.5 | 98.0 | 0.56 | 0.069 |
A:Q02078+Q02080:0.069 |
DA DA DA DA DT DA DA DG HOH |
8.616 4.261 2.967 8.007 9.591 5.940 3.975 6.729 4.272 |
N CG2 CG2 CG2 CG2 CD1 CD1 N CG2 |
O3' O3' OP1 P O2 O3' C5' OP1 O |
|||||||||
| ILE | C:6 | C:6 | 97.0 | 0.554 | -111.8 | 153.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | D:6 | D:6 | 99.0 | 0.566 | -113.1 | 150.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | I:6 | I:6 | 92.0 | 0.526 | -108.0 | 152.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | J:6 | J:6 | 93.0 | 0.531 | -113.7 | 155.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 1tqe | 3 | Q02080 | 86.02 | 8e-56 |
X-RAY |
2004-12-21 | ILE | E:6 | P:6 | 105.0 | 0.6 | -125.3 | 132.9 | 95.0 | 0.543 | 0.057 |
F:Q02080:0.057 |
DA DT DA DA DT DA DA DA |
9.880 5.766 3.480 3.261 8.708 5.131 4.820 9.913 |
CD1 CD1 CD1 CG2 N N O O |
O3' O3' C5' OP2 O3' O3' OP1 OP1 |
||
| ILE | F:6 | Q:6 | 105.0 | 0.6 | -124.5 | 132.3 | 94.0 | 0.537 | 0.063 |
E:Q02080:0.063 |
DT DT DT DA DT DA DG |
8.737 5.531 4.552 9.909 5.833 3.134 4.154 |
N N O CD1 CD1 CG2 CG2 |
O3' O3' OP1 O3' O3' O3' P |
|||||||||
| ILE | H:6 | R:6 | 104.0 | 0.594 | -125.2 | 132.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | I:6 | S:6 | 102.0 | 0.583 | -124.4 | 132.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6c9l | 1 | Q02080 | 86.02 | 8e-56 |
X-RAY |
2018-02-07 | ILE | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | B:6 | B:6 | 192.0 | 1.0 | 360.0 | -16.4 | 192.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
8.061 |
O |
O |
||||||||||
| ILE | C:6 | C:6 | 132.0 | 0.754 | -68.9 | 123.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | D:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | E:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | F:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6bz1 | 1 | Q02078,Q02080 | 88.42 | 9e-56 |
X-RAY |
2018-02-07 | ILE | A:6 | C:6 | 99.0 | 0.566 | -125.8 | 149.3 | 93.0 | 0.531 | 0.035 |
B:Q02078+Q02080:0.034 |
DT DA DA DT DA DA DA |
5.529 3.251 3.477 8.570 5.563 4.348 9.608 |
CD1 CG2 CG2 N N N O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 OP1 |
||
| ILE | B:6 | D:6 | 97.0 | 0.554 | -124.9 | 149.1 | 90.0 | 0.514 | 0.04 |
A:Q02078+Q02080:0.04 |
DT DT DT DT DA DG |
8.774 5.443 4.702 5.633 3.476 3.521 |
N N N CD1 CG2 CG2 |
O3' O3' OP1 O3' C3' OP1 |
|||||||||
| ILE | E:6 | A:6 | 95.0 | 0.543 | -124.7 | 146.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | F:6 | B:6 | 95.0 | 0.543 | -123.5 | 148.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 1n6j | 3 | Q02080 | 85.87 | 6e-55 |
X-RAY |
2003-11-11 | ILE | C:5 | A:6 | 92.0 | 0.526 | -106.2 | 142.2 | 84.0 | 0.48 | 0.046 |
D:Q02080:0.046 |
DT DT DT DT DA DG HOH |
8.954 5.605 4.714 5.660 3.277 3.878 3.029 |
N N O CD1 CG2 CG2 O |
O3' O3' OP1 O3' C3' OP1 O |
||
| ILE | D:5 | B:6 | 92.0 | 0.526 | -107.2 | 141.8 | 84.0 | 0.48 | 0.046 |
C:Q02080:0.046 |
DT DA DA DT DA DA HOH |
5.492 3.111 3.460 8.775 5.473 4.621 2.887 |
CD1 CG2 CG2 N N O O |
O3' C3' OP1 O3' O3' OP1 O |
|||||||||
| 6wc5 | 1 | Q02080 | 86.67 | 8e-54 |
X-RAY |
2020-07-22 | ILE | A:5 | A:6 | 95.0 | 0.543 | -106.5 | 137.6 | 86.0 | 0.491 | 0.052 |
B:Q02080:0.051 |
DT DA DG DT DT DT |
5.499 3.364 3.985 8.680 5.394 4.693 |
CD1 CD1 CG2 N N O |
O3' OP1 OP1 O3' O3' OP1 |
||
| ILE | B:5 | B:6 | 101.0 | 0.577 | -103.3 | 136.4 | 90.0 | 0.514 | 0.063 |
A:Q02080:0.063 |
DA DA DA DA DA DG HOH |
8.997 5.385 4.772 5.866 3.830 4.235 9.903 |
N N O CD1 CD1 CG2 CD1 |
O3' O3' OP1 O3' OP1 OP1 O |
|||||||||
| ILE | C:5 | C:6 | 96.0 | 0.549 | -109.1 | 141.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | D:5 | D:6 | 95.0 | 0.543 | -105.6 | 139.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 1egw | 3 | Q02078 | 98.7 | 9e-50 |
X-RAY |
2000-03-20 | ILE | E:5 | A:6 | 100.0 | 0.571 | -116.8 | 158.6 | 90.0 | 0.514 | 0.057 |
F:Q02078:0.057 |
DT DT DA DT DA DG DA DT DA DT DA DG HOH |
9.220 5.534 5.191 5.671 3.099 3.712 8.660 5.380 4.601 6.118 3.342 3.666 2.722 |
N N O CD1 CG2 CG2 N N O CD1 CG2 CG2 O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
||
| ILE | F:5 | B:6 | 96.0 | 0.549 | -119.8 | 155.4 | 88.0 | 0.503 | 0.046 |
E:Q02078:0.046 |
DT DT DA DT DA DG DA DT DA DT DA DG HOH |
8.588 5.372 4.620 5.617 3.309 3.675 9.119 5.517 5.179 5.828 3.113 3.792 2.790 |
N N O CD1 CG2 CG2 N N O CD1 CG2 CG2 O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 O |
|||||||||
| ILE | G:5 | C:6 | 94.0 | 0.537 | -120.1 | 155.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | H:5 | D:6 | 100.0 | 0.571 | -115.9 | 157.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3mu6 | 1 | Q02078 | 97.18 | 2e-43 |
X-RAY |
2011-11-02 | ILE | A:5 | A:6 | 100.0 | 0.571 | -112.5 | 172.4 | 91.0 | 0.52 | 0.051 |
B:Q02078:0.051 |
DT DA DG DA DT DA |
6.058 3.174 3.915 8.885 5.374 4.993 |
CD1 CG2 CG2 N N O |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 |
||
| ILE | B:5 | B:6 | 102.0 | 0.583 | -112.3 | 172.6 | 92.0 | 0.526 | 0.057 |
A:Q02078:0.057 |
DT DT DA DT DA DG |
8.966 5.474 4.947 6.117 3.234 3.956 |
N N O CD1 CG2 CG2 |
O3' O3' OP1 O3' O3' OP1 |
|||||||||
| ILE | E:5 | C:6 | 102.0 | 0.583 | -113.0 | 172.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | F:5 | D:6 | 101.0 | 0.577 | -112.6 | 173.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q06413-f1 | 1 | Q06413 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:6 | A:6 | 93.0 | 0.531 | -125.5 | 153.5 | ||