wupsivus

Variant

Genome	Chromosome	Position	VCF ID	Ref	Alt	mRNA Change	mRNA Info
GRCh37	chr5	88119597	.	T	A	CCDS47244.1:NM_001131005.2:c.9agA>agT_NP_001124477.1:p.3R>S	Homo sapiens myocyte enhancer factor 2C (MEF2C), transcript variant 1, mRNA.

pdb_id	:
label_asym_id	:
label_seq_id	:
label_comp_id	:
auth_asym_id	:
auth_seq_id	:

alphafold_id	:
label_asym_id	:
label_seq_id	:
label_comp_id	:
auth_asym_id	:
auth_seq_id	:

PDB

Entity							Residue			Monomer					BioUnit				Ligand				View
PDB	Entity	Uniprot	Identity	Evalue	ExpMethod	Date	Name	Label	Auth	ASA	rASA	SS	φ	ψ	ASA	rASA	ΔASA	Interaction	Name	Distance	Atom(p)	Atom(l)	View
5f28	1	Q8CFN5	97.8	5e-59	X-RAY	2016-07-13	ARG	A:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	B:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	C:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	D:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
3kov	1	Q02078	96.67	1e-57	X-RAY	2010-02-16	ARG	A:2	A:3	263.0	1.0		-49.7	-46.0	263.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DT DA DA DG DC DT DT DA DT DA DA DA DT DA DG DT	8.284 5.727 5.206 5.237 3.560 3.864 9.187 5.562 3.842 3.221 4.233 6.444 9.397 5.468 2.471 2.850 3.873 4.798 8.694 7.623 5.201 3.183 3.180 3.497	NH2 NH2 NE NH2 O O N N N CD CD CD NE NH2 NE N N O C N N N CD NE	N1 O2 O2 O4' O3' OP1 P C2 O2 C2 N3 O4' N3 O2 O2 N3 O2 C5' P C2 O2 N3 O4' O4'
							ARG	B:2	B:3	269.0	1.0		-48.3	-46.6	269.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DT DA DA DG DC DT DT DA DT DA DA DA DT DA DG DT	9.218 6.749 7.465 5.804 5.579 5.973 8.874 5.855 3.799 3.235 3.401 4.827 9.207 4.190 2.716 2.862 2.860 4.655 8.798 8.971 6.337 3.464 3.433 3.972	NH2 NH2 NH2 NH2 N O C N N N CD NH1 NH2 NH2 NE N O O N N N N CD NE	N1 O2 O2 O4' O2 C5' OP1 C2 O2 N3 N3 O4' O2 O2 O2 C2 C4' C5' C5' C2 O2 O4' C1' O4'
							ARG	C:2	I:3	247.0	1.0		-44.9	-51.8	NA	NA	NA
							ARG	D:2	J:3	260.0	1.0		-48.6	-46.2	NA	NA	NA
3p57	1	Q02078	96.67	1e-57	X-RAY	2011-08-10	ARG	A:2	A:3	255.0	1.0		-58.9	-29.4	255.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DA DC DT DT DA DT DA DA HOH	7.210 4.908 3.224 3.735 6.077 8.201 8.108 3.959 2.798 2.979 3.487 5.015 9.295 3.062	N N N CB NH1 NH2 NH2 NH2 NE NE O O N NH1	C2 O2 N3 O4' O4' O4' O2 O2 O2 O4' C4' C5' P O
							ARG	B:2	B:3	252.0	1.0		-56.4	-24.1	252.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DT DA DG DT DT HOH	7.872 4.504 2.766 2.993 3.371 4.958 9.202 7.148 4.887 3.159 3.297 4.398 6.750 3.111	NH2 NH2 NE NE O C C N N N NH2 NH1 NH1 O	C2 O2 O2 O4' C4' C5' P C2 O2 N3 N2 C4' OP1 O
							ARG	C:2	C:3	258.0	1.0		-48.6	-39.2	258.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DA DT DA DG DT DT HOH	7.574 4.139 2.846 3.145 3.879 4.831 9.205 9.908 7.048 4.796 3.252 3.086 5.625 7.075 4.837	NH2 NH2 NE NE O O N N N N N NH2 NH1 NH1 O	C2 O2 O2 O4' C4' C5' P N1 C2 O2 N3 N2 C4' C5' O
							ARG	D:2	D:3	252.0	1.0		-66.9	-1.2	252.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DA DC DT DT DA DT DA DA HOH	7.105 4.910 3.413 3.647 5.091 7.436 8.333 4.517 2.791 3.086 3.860 5.033 9.173 7.623	N N CG CB NH1 NH2 NH2 NH2 NH2 NE CA C N N	C2 O2 N3 O4' O4' O4' O2 O2 O4' O4' C4' C5' P O
							ARG	E:2	I:3	253.0	1.0		-45.5	-31.6	253.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DT DA DG DT DT HOH	7.925 4.301 2.711 3.112 3.886 5.169 9.383 7.399 4.883 3.048 3.014 6.167 8.932 4.486	NH2 NH2 NE NE O O C N N N NH2 CG NH2 CB	C2 O2 O2 O4' C4' C5' P C2 O2 N3 N2 O4' O4' O
							ARG	F:2	J:3	263.0	1.0		-44.5	-40.4	263.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DA DC DT DT DA DT DA DA HOH	7.100 4.764 3.179 3.250 3.450 4.743 8.557 4.663 3.011 3.158 3.635 4.819 8.957 6.990	N N N CG NH1 NH2 NH2 NH2 NE CD O O N C	C2 O2 N3 O4' C4' C5' O2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' O
6byy	1	Q02078,Q02080	89.47	3e-57	X-RAY	2018-01-31	ARG	A:3	A:3	252.0	1.0		-57.2	-37.4	252.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DT DA DG DT DT HOH	7.520 4.440 2.763 3.011 3.860 4.963 9.243 7.134 4.858 3.219 3.240 3.706 5.953 3.113	NH2 NH2 NE NE O O N N N N CB NH1 NH2 NH2	C2 O2 O2 O4' C4' C5' P C2 O2 N3 O4' C4' C5' O
							ARG	B:3	B:3	254.0	1.0		-54.6	-27.6	254.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DA DC DT DT DA DT DA DA HOH	6.856 4.810 3.136 3.315 3.550 5.810 8.471 4.613 2.744 2.968 3.315 4.915 9.295 4.929	N N N CG NH1 NH2 NH2 NH2 NE NE O C C N	C2 O2 N3 O4' C4' C5' O2 O2 O2 O4' C4' C5' P O
							ARG	C:3	C:3	250.0	1.0		-57.0	-39.5	NA	NA	NA
							ARG	D:3	D:3	269.0	1.0		56.9	-57.4	NA	NA	NA
6wc2	1	Q02078,Q02080	89.47	3e-57	X-RAY	2020-07-22	ARG	A:3	A:3	248.0	1.0		-55.6	-34.6	248.0	1.0	0.0		DA DT DA DG DT DG DA DC DT DA DT DT DT HOH	7.130 4.841 3.204 3.478 4.778 7.095 8.207 4.607 2.957 2.862 3.326 4.994 9.168 6.249	N N N CB NH1 NH1 NH2 NH2 NE NE O O N N	C2 O2 N3 O4' C5' OP1 C2 O2 O2 O4' C4' C5' P O
							ARG	B:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	C:3	C:3	246.0	1.0		-57.5	-34.0	NA	NA	NA
							ARG	D:3	D:3	259.0	1.0		-59.9	-30.7	NA	NA	NA
							ARG	I:3	I:3	261.0	1.0		-61.0	-30.5	NA	NA	NA
							ARG	J:3	J:3	228.0	1.0		-56.6	-36.9	NA	NA	NA
1tqe	3	Q02080	86.02	8e-56	X-RAY	2004-12-21	ARG	E:3	P:3	265.0	1.0		-56.9	-8.3	265.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DC DA DC DT DT DA DT DA DA	6.212 4.405 3.273 3.918 3.292 5.831 9.316 9.479 5.164 3.171 3.251 3.572 4.852 8.834	N N N CD NH1 NH1 NH2 NH2 NH2 NH2 CG CA C N	C2 O2 N3 N3 O4' P OP1 O2 O2 O4' N3 O4' C5' C5'
							ARG	F:3	Q:3	267.0	1.0		-57.0	-8.7	267.0	1.0	0.0		DG DC DT DA DT DT DT DA DA DT DA DG DC DT	6.480 4.352 2.927 3.222 3.672 4.965 8.950 9.711 6.766 4.236 3.036 3.427 4.022 6.982	NH2 NH2 NE NE CA C N N N N N NE NH1 NH1	N2 O2 O2 O4' O4' C5' P N1 C2 O2 N3 N2 O4' P
							ARG	H:3	R:3	267.0	1.0		-57.1	-8.2	NA	NA	NA
							ARG	I:3	S:3	266.0	1.0		-56.7	-9.0	NA	NA	NA
6c9l	1	Q02080	86.02	8e-56	X-RAY	2018-02-07	ARG	A:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	B:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	C:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	D:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	E:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
							ARG	F:3	NA:NA	DO	NA	DO	DO	DO	NA	NA	NA
6bz1	1	Q02078,Q02080	88.42	9e-56	X-RAY	2018-02-07	ARG	A:3	C:3	235.0	1.0		-60.4	-23.3	235.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DA DC DT DT DA DT DA DA	6.245 4.226 3.021 3.541 3.553 6.772 7.978 3.877 2.670 3.273 3.107 4.884 8.783	N N N CG NH2 NH2 NH1 NH1 NH1 CD O C N	C2 O2 N3 N3 O4' O4' O2 O2 O2 O4' C4' C5' C5'
							ARG	B:3	D:3	237.0	1.0		-59.3	-23.7	237.0	1.0	0.0		DA DC DT DA DT DT DT DA DA DT DA DG DT	8.492 5.674 3.445 2.719 3.327 4.890 8.372 9.689 6.588 4.353 3.293 4.237 4.141	NH2 NH2 NE NE O C N N N N N CB NH1	C2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' N1 C2 O2 N3 O4' C5'
							ARG	E:3	A:3	250.0	1.0		-60.4	-22.3	NA	NA	NA
							ARG	F:3	B:3	251.0	1.0		-58.3	-25.5	NA	NA	NA
1n6j	3	Q02080	85.87	6e-55	X-RAY	2003-11-11	ARG	C:2	A:3	258.0	1.0		-52.2	-34.5	258.0	1.0	0.0		DG DC DT DA DT DT DT DA DT DA DG DC DT HOH	7.313 4.254 2.640 3.136 3.797 5.018 9.522 7.380 5.207 2.885 2.968 5.753 8.189 4.366	NH2 NH2 NE NE O O C N N N NH2 NH1 NH2 N	N2 O2 O2 O4' C4' C5' P C2 O2 N3 N2 O4' C5' O
1n6j	3	Q02080	85.87	6e-55	X-RAY	2003-11-11	ARG	D:2	B:3	258.0	1.0		-53.3	-34.2	258.0	1.0	0.0		DA DT DA DA DG DC DC DT DT DA DT DA DA HOH	7.300 4.829 3.036 3.703 5.039 8.171 9.662 4.681 2.635 2.570 3.387 4.637 9.274 2.600	N N N CG NH1 NH2 NH2 NH2 NE NE O O C NH2	C2 O2 N3 O4' C5' C5' O2 O2 O2 O4' C4' C5' P O
6wc5	1	Q02080	86.67	8e-54	X-RAY	2020-07-22	ARG	A:2	A:3	265.0	1.0		-61.5	-27.5	265.0	1.0	0.0		DA DT DA DG DT DG DA DC DT DA DT DT DT	7.236 4.891 3.513 3.264 5.765 9.989 7.893 4.144 2.855 2.910 3.289 5.218 9.266	N N N NE CD NE NH2 NH2 NH2 NH1 O C N	C2 O2 N3 N2 O4' P C2 O2 O4' O4' C5' C5' C5'
							ARG	B:2	B:3	241.0	1.0		64.5	92.0	223.0	0.991	0.009	I:P52952:0.08	DT DC DT DT DA DA DA DT DA DA DG DA DA	9.649 6.234 2.954 3.147 3.453 4.205 8.462 7.785 6.162 3.760 2.983 4.349 8.422	NH2 NH2 NH2 NH2 N N N N N NH1 O CD NE	O2 O2 O2 O4' O4' C5' P O2 C2 N3 C5' C5' P
							ARG	C:2	C:3	264.0	1.0		-62.0	-28.2	NA	NA	NA
							ARG	D:2	D:3	255.0	1.0		-60.2	-29.9	NA	NA	NA
1egw	3	Q02078	98.7	9e-50	X-RAY	2000-03-20	ARG	E:2	A:3	264.0	1.0		-60.6	-32.8	264.0	1.0	0.0		DG DC DT DA DT DT DA DT DT DA DG DC DT DG DC DT DA DA DT DA DA DT DA DG DC DT DT HOH	6.735 4.312 2.768 2.932 3.402 4.860 8.948 7.849 4.809 3.088 3.239 4.461 5.501 6.913 4.411 2.750 2.930 3.234 4.859 9.043 7.221 4.893 3.142 3.481 3.777 6.315 9.722 2.748	NH2 NH2 NE CZ O O N N N N CB NH1 NH1 NH2 NH2 NE CZ O O N N N N NH2 NH1 NH2 NH2 O	N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' O2 O2 N3 O4' C4' OP1 N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' C2 O2 N3 N2 C4' C5' OP1 O
							ARG	F:2	B:3	263.0	1.0		-60.8	-32.8	263.0	1.0	0.0		DG DC DT DA DT DT DA DT DT DA DG DC DT DG DC DT DA DA DT DA DA DT DA DG DC DT HOH	6.999 4.509 2.823 2.979 3.378 4.923 9.080 7.877 4.875 3.090 3.382 3.771 6.207 6.822 4.423 2.815 2.920 3.411 4.959 9.010 7.371 4.911 3.082 3.312 4.416 5.625 2.819	NH2 NH2 NE CZ O C N N N N CB NH1 NH2 NH2 NH2 NE CZ O O N N N N CB NH1 NH1 NH2	N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' O2 O2 N3 O4' C4' C5' N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' C2 O2 N3 O4' C4' OP1 O
							ARG	G:2	C:3	260.0	1.0		-61.4	-32.1	NA	NA	NA
							ARG	H:2	D:3	260.0	1.0		-60.6	-34.4	NA	NA	NA
3mu6	1	Q02078	97.18	2e-43	X-RAY	2011-11-02	ARG	A:2	A:3	244.0	1.0		-57.7	-35.5	244.0	1.0	0.0		DA DT DT DA DG DC DT DG DC DT DA DA DT DA	9.969 7.927 4.808 3.245 3.347 4.082 6.011 6.860 4.483 2.662 2.802 3.339 5.011 9.092	N N N N CB NH1 NH2 NH2 NH2 NE NE O O N	N1 O2 O2 N3 O4' C4' C5' N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5'
							ARG	B:2	B:3	244.0	1.0		-57.8	-35.1	244.0	1.0	0.0		DG DC DT DA DT DT DA DA DA DT DA DG DC DT	6.894 4.488 2.747 2.824 3.459 5.001 9.106 9.963 7.352 4.818 3.342 3.365 3.970 5.981	NH2 NH2 NE NE O O N N N N N CB NH1 NH2	N2 O2 O2 O4' C4' C5' C5' N1 C2 O2 N3 O4' C4' C5'
							ARG	E:2	C:3	242.0	1.0		-58.5	-35.2	NA	NA	NA
							ARG	F:2	D:3	242.0	1.0		-58.6	-35.1	NA	NA	NA

AlphaFold DB

Entity					Residue			Monomer					View
ID	Entity	Uniprot	Identity	Evalue	Name	Label	Auth	ASA	rASA	SS	φ	ψ	View
af-q06413-f1	1	Q06413	100.0	0.0	ARG	A:3	A:3	257.0	1.0		-71.9	135.5

wupsivus
	HOME ABOUT EXAMPLE HELP