wupsivus

Variant

Genome	Chromosome	Position	VCF ID	Ref	Alt	mRNA Change	mRNA Info
GRCh37	chr6	170873641	.	T	A	CCDS5315.1:NM_003194.4:c.506gTa>gAa_NP_003185.1:p.169V>E	Homo sapiens TATA-box binding protein (TBP), transcript variant 1, mRNA.

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PDB

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							VAL	T:12	R:169	39.0	0.252	E	-122.3	121.8	NA	NA	NA
1cdw	3	P20226	99.44	3e-131	X-RAY	1996-12-23	VAL	C:11	A:165	33.0	0.213	E	-115.4	123.1	33.0	0.213	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT HOH	6.494 3.494 3.646 7.433 9.390 5.880 3.634 6.787 4.481	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 N	C2 N3 N3 C2 O2 O2 O2 O2 O
1vto	3	P28147	80.21	8e-111	X-RAY	2011-07-13	VAL	E:19	A:29	30.0	0.194	E	-119.6	124.5	30.0	0.194	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT HOH	6.703 3.745 3.761 7.514 8.571 5.887 3.732 6.785 3.711	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2 N	C2 N3 N3 C2 H3 O2 O2 O2 H2
1vto	3	P28147	80.21	8e-111	X-RAY	2011-07-13	VAL	F:19	B:1029	31.0	0.2	E	-113.6	130.4	NA	NA	NA
1vtl	3	P28147	83.24	1e-110	X-RAY	2011-07-13	VAL	E:17	E:29	28.0	0.181	E	-118.3	126.9	28.0	0.181	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT	6.773 3.680 3.798 7.689 8.692 5.742 3.677 6.785	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	C2 C2 N3 C2 H3 O2 O2 O2
1vtl	3	P28147	83.24	1e-110	X-RAY	2011-07-13	VAL	F:17	F:29	32.0	0.206	E	-107.4	132.3	NA	NA	NA
6tb4	1	?	80.22	2e-110	EM	2020-01-29	VAL	A:74	M:71	22.0	0.142	E	-103.8	110.7	22.0	0.142	0.0
4v1n	15	P13393	81.01	2e-109	EM	2015-02-04	VAL	O:12	O:71	30.0	0.194	E	-111.8	128.4	30.0	0.194	0.0		DA DT DA DA DT DT DA DT DA	6.621 3.393 3.563 7.888 9.228 5.487 3.244 6.170 9.792	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	N3 O2 N3 C2 O2 O2 C2 O2 N1
4v1o	15	P13393	81.01	2e-109	EM	2015-02-04	VAL	O:12	O:71	30.0	0.194	E	-111.8	128.4	30.0	0.194	0.0		DA DT DA DA DT DT DA DT DA	6.621 3.393 3.564 7.888 9.229 5.488 3.245 6.170 9.793	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	N3 O2 N3 C2 O2 O2 C2 O2 N1
1ngm	3	P13393	81.01	3e-109	X-RAY	2003-03-25	VAL	I:11	A:71	29.0	0.187	E	-96.6	140.7	29.0	0.187	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT	7.001 3.444 4.436 8.313 9.851 5.602 3.935 7.432	CG2 CG2 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2 CG2	C2 N3 N3 C2 O2 O2 O2 O2
							VAL	K:11	E:71	33.0	0.213	E	-111.2	123.0	NA	NA	NA
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1nh2	3	P13393	81.01	3e-109	X-RAY	2003-10-21	VAL	C:11	A:71	30.0	0.194	E	-113.8	132.8	30.0	0.194	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT HOH	6.771 3.704 3.865 7.519 9.237 5.735 3.626 6.776 4.032	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CA	C2 C2 N3 C2 O2 O2 O2 O2 O
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1ytb	2	P13393	81.01	3e-109	X-RAY	1995-01-26	VAL	D:11	B:71	31.0	0.2	E	-110.5	127.3	NA	NA	NA
1ytf	3	P13393	81.01	3e-109	X-RAY	1996-06-20	VAL	C:11	A:71	32.0	0.206	E	-111.7	137.4	32.0	0.206	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT	6.805 3.502 3.814 7.527 9.141 5.833 3.972 6.773	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2	C2 C2 N3 C2 O2 O2 O2 O2
5fmf	19	P13393	81.01	3e-109	EM	2015-11-25	VAL	S:11	Q:71	31.0	0.2	E	-106.1	126.7	31.0	0.2	0.0		DA DA DA DA DT DT DT DT	6.825 3.770 4.265 8.796 9.935 5.653 3.803 8.360	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	N3 N3 N3 C2 O2 O2 O2 O4
1tbp	1	P13393	80.9	1e-108	X-RAY	1994-01-31	VAL	A:11	A:71	23.0	0.148	E	-103.8	110.8	21.0	0.135	0.013	B:P13393:0.013
1tbp	1	P13393	80.9	1e-108	X-RAY	1994-01-31	VAL	B:11	B:71	22.0	0.142	E	-119.5	129.3	4.0	0.026	0.116	A:P13393:0.116
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4b0a	1	P46677,P13393	80.79	3e-106	X-RAY	2013-07-03	VAL	A:109	A:171	0.0	0.0	E	-108.6	126.4	0.0	0.0	0.0		GOL GOL GOL HOH	7.999 8.671 6.190 3.465	CG1 CG2 CG2 CG2	C3 O3 C1 O
6cnb	18	P29056,P13393	81.01	1e-104	EM	2018-08-22	VAL	R:397	R:397	22.0	0.142	E	-131.2	141.6	22.0	0.142	0.0		DT DA DG DA DC DT DA	5.959 3.461 5.175 8.964 5.610 3.853 6.587	CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG1 CG1	O2 C2 N2 C2 O2 O2 C2
6cnc	18	P29056,P13393	81.01	1e-104	EM	2018-08-22	VAL	R:397	R:397	29.0	0.187	E	-106.3	135.8	29.0	0.187	0.0		DT DT DA DG DT DA DC DT DA	8.710 5.001 3.704 4.931 7.903 8.698 6.510 4.616 5.419	CG2 CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	O2 O2 C2 N3 O2 N1 O2 O2 C2
6cnd	18	P29056,P13393	81.01	1e-104	EM	2018-08-22	VAL	R:397	R:397	31.0	0.2	E	-95.9	114.1	31.0	0.2	0.0		DT DT DA DG DT DA DC DT DA	8.176 4.670 3.678 5.667 9.474 9.448 7.070 4.797 6.264	CG2 CG2 CG2 CG1 CG1 CG1 CG2 CG2 CG2	O2 O2 N3 N3 O2 C2 O2 O2 C2
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