Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 31544961 | . | G | A | CCDS4702.1:NM_000594.3:c.349Gtg>Atg_NP_000585.2:p.117V>M | Homo sapiens tumor necrosis factor (TNF), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6op0 | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2019-12-25 | VAL | A:42 | A:41 | 6.0 | 0.039 | -72.5 | 128.6 | 6.0 | 0.039 | 0.0 |
HOH |
4.952 |
O |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -66.5 | 136.5 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
4.864 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 30.0 | 0.194 | -95.7 | 130.6 | 30.0 | 0.194 | 0.0 |
HOH |
8.343 |
CG2 |
O |
||||||||||
| 7kp9 | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -67.8 | 136.2 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
3.229 |
O |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 9.0 | 0.058 | -68.4 | 134.8 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
3.792 |
CA |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -75.8 | 134.6 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
8.272 |
CG2 |
O |
||||||||||
| 7kpa | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -72.5 | 133.7 | 7.0 | 0.045 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:42 | B:41 | 8.0 | 0.052 | -74.6 | 132.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
3.545 |
CA |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 11.0 | 0.071 | -77.6 | 137.6 | 11.0 | 0.071 | 0.0 |
HOH |
8.647 |
CG2 |
O |
||||||||||
| 7kpb | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -68.6 | 140.5 | 7.0 | 0.045 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:42 | B:41 | 8.0 | 0.052 | -72.4 | 141.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 8.0 | 0.052 | -70.9 | 115.2 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | ||||||||||||||
| 5mu8 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2017-03-29 | VAL | A:43 | A:41 | 6.0 | 0.039 | -59.6 | 136.6 | 6.0 | 0.039 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:43 | B:41 | 3.0 | 0.019 | -79.2 | 85.4 | 3.0 | 0.019 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:43 | C:41 | 6.0 | 0.039 | -67.2 | 119.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | D:43 | D:41 | 6.0 | 0.039 | -80.7 | 112.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:43 | F:41 | 9.0 | 0.058 | -61.7 | 144.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:43 | G:41 | 6.0 | 0.039 | -79.8 | 102.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | G:43 | H:41 | 8.0 | 0.052 | -72.0 | 113.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | H:43 | I:41 | 9.0 | 0.058 | -71.1 | 141.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | I:43 | J:41 | 8.0 | 0.052 | -82.3 | 132.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | J:43 | K:41 | 8.0 | 0.052 | -82.8 | 115.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | K:43 | L:41 | 7.0 | 0.045 | -77.9 | 111.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | L:43 | M:41 | 8.0 | 0.052 | -79.9 | 125.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | M:43 | N:41 | 8.0 | 0.052 | -73.6 | 127.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | N:43 | O:41 | 6.0 | 0.039 | -69.9 | 113.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | O:43 | P:41 | 8.0 | 0.052 | -71.7 | 119.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | P:43 | Q:41 | 6.0 | 0.039 | -76.2 | 136.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | Q:43 | R:41 | 5.0 | 0.032 | -73.0 | 103.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | R:43 | S:41 | 10.0 | 0.065 | -71.6 | 139.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | S:43 | T:41 | 9.0 | 0.058 | -80.1 | 141.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | T:43 | U:41 | 9.0 | 0.058 | -77.7 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | U:43 | V:41 | 5.0 | 0.032 | -69.3 | 100.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | V:43 | W:41 | 7.0 | 0.045 | -70.7 | 144.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | W:43 | X:41 | 8.0 | 0.052 | -74.2 | 126.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | X:43 | Y:41 | 5.0 | 0.032 | -66.8 | 134.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | Y:43 | Z:41 | 8.0 | 0.052 | -81.4 | 146.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | Z:43 | a:41 | 4.0 | 0.026 | -78.0 | 108.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | AA:43 | b:41 | 7.0 | 0.045 | -71.5 | 138.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | BA:43 | c:41 | 5.0 | 0.032 | -69.0 | 118.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | CA:43 | d:41 | 6.0 | 0.039 | -89.6 | 141.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | DA:43 | e:41 | 5.0 | 0.032 | -70.0 | 139.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | EA:43 | f:41 | 3.0 | 0.019 | -92.7 | 94.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | FA:43 | g:41 | 5.0 | 0.032 | -70.4 | 129.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | GA:43 | h:41 | 7.0 | 0.045 | -80.0 | 129.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | HA:43 | i:41 | 5.0 | 0.032 | -74.1 | 125.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | IA:43 | j:41 | 7.0 | 0.045 | -81.3 | 121.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | JA:43 | k:41 | 5.0 | 0.032 | -77.9 | 114.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | KA:43 | l:41 | 6.0 | 0.039 | -78.2 | 138.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | LA:43 | m:41 | 5.0 | 0.032 | -76.7 | 101.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | MA:43 | n:41 | 13.0 | 0.084 | -75.9 | 147.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | NA:43 | o:41 | 5.0 | 0.032 | -79.7 | 125.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | OA:43 | p:41 | 8.0 | 0.052 | -71.3 | 147.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | PA:43 | q:41 | 4.0 | 0.026 | -78.5 | 108.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | QA:43 | r:41 | 4.0 | 0.026 | -75.3 | 94.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | RA:43 | s:41 | 7.0 | 0.045 | -72.3 | 124.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | SA:43 | t:41 | 7.0 | 0.045 | -120.1 | 137.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | TA:43 | u:41 | 6.0 | 0.039 | -63.4 | 116.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | UA:43 | v:41 | 7.0 | 0.045 | -77.8 | 103.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | VA:43 | w:41 | 1.0 | 0.006 | -74.0 | 129.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x81 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -71.1 | 132.3 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
6.846 |
N |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -71.7 | 130.6 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
3.152 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -73.0 | 134.0 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
3.566 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | D:42 | D:41 | 8.0 | 0.052 | -70.7 | 128.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:42 | E:41 | 12.0 | 0.077 | -109.4 | 136.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:42 | F:41 | 8.0 | 0.052 | -70.7 | 130.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x82 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -73.7 | 125.2 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.826 |
O |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 3.0 | 0.019 | -74.1 | 112.7 | 3.0 | 0.019 | 0.0 |
HOH |
6.655 |
N |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 8.0 | 0.052 | -74.1 | 126.3 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
6.038 |
N |
O |
||||||||||
| VAL | D:42 | D:41 | 4.0 | 0.026 | -72.4 | 128.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:42 | E:41 | 7.0 | 0.045 | -82.8 | 134.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:42 | F:41 | 8.0 | 0.052 | -74.8 | 131.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x83 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -68.2 | 141.6 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
3.537 |
O |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 1.0 | 0.006 | -73.4 | 93.5 | 1.0 | 0.006 | 0.0 |
HOH |
5.694 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -69.0 | 128.7 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
4.603 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | D:42 | D:41 | 6.0 | 0.039 | -68.1 | 128.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:42 | E:41 | 3.0 | 0.019 | -69.2 | 129.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:42 | F:41 | 4.0 | 0.026 | -68.6 | 137.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x85 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -80.5 | 134.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:42 | B:41 | 18.0 | 0.116 | -84.9 | 93.8 | 18.0 | 0.116 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 10.0 | 0.065 | -79.2 | 136.2 | 10.0 | 0.065 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | D:42 | D:41 | 7.0 | 0.045 | -81.3 | 126.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:42 | E:41 | 8.0 | 0.052 | -81.2 | 128.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:42 | F:41 | 10.0 | 0.065 | -79.1 | 128.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x86 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | VAL | A:42 | A:41 | 10.0 | 0.065 | -70.7 | 136.5 | 10.0 | 0.065 | 0.0 |
HOH |
2.908 |
O |
O |
|||
| VAL | B:42 | B:41 | 5.0 | 0.032 | -88.1 | 139.9 | 5.0 | 0.032 | 0.0 |
HOH |
7.579 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:42 | C:41 | 10.0 | 0.065 | -69.0 | 138.0 | 10.0 | 0.065 | 0.0 |
HOH |
9.468 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | D:42 | D:41 | 4.0 | 0.026 | -70.3 | 141.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:42 | E:41 | 8.0 | 0.052 | -70.8 | 134.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:42 | F:41 | 9.0 | 0.058 | -68.8 | 135.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5yoy | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2018-05-09 | VAL | A:49 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -66.7 | 125.5 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:49 | B:41 | 8.0 | 0.052 | -66.0 | 124.9 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:49 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -66.0 | 126.7 | 9.0 | 0.058 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | J:49 | J:41 | 9.0 | 0.058 | -66.1 | 126.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | K:49 | K:41 | 7.0 | 0.045 | -67.7 | 123.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | L:49 | L:41 | 8.0 | 0.052 | -66.5 | 126.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7jra | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2020-12-09 | VAL | A:44 | A:117 | 8.0 | 0.052 | -68.9 | 134.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.316 |
CA |
O |
|||
| VAL | B:44 | B:117 | 8.0 | 0.052 | -69.3 | 134.9 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
3.287 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:44 | C:117 | 8.0 | 0.052 | -70.4 | 133.9 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
2.835 |
O |
O |
||||||||||
| 4g3y | 3 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2013-03-27 | VAL | C:41 | C:41 | 8.0 | 0.052 | -76.1 | 132.0 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
3.138 |
O |
O |
|||
| 4twt | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2015-02-04 | VAL | A:41 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -81.2 | 141.3 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
2.905 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 5.0 | 0.032 | -84.6 | 136.9 | 5.0 | 0.032 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | E:41 | C:41 | 0.0 | 0.0 | -80.9 | 139.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:41 | D:41 | 27.0 | 0.174 | -125.9 | 145.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5m2i | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | VAL | A:41 | A:41 | 6.0 | 0.039 | -64.7 | 129.3 | 6.0 | 0.039 | 0.0 |
HOH |
3.024 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 5.0 | 0.032 | -60.1 | 126.2 | 5.0 | 0.032 | 0.0 |
HOH |
3.214 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 6.0 | 0.039 | -65.4 | 130.5 | 6.0 | 0.039 | 0.0 |
HOH |
2.979 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | D:41 | D:41 | 6.0 | 0.039 | -64.9 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:41 | E:41 | 6.0 | 0.039 | -56.6 | 126.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:41 | F:41 | 8.0 | 0.052 | -65.7 | 131.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5m2j | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | VAL | A:41 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -68.5 | 132.7 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
2.742 |
O |
O |
|||
| 5m2m | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | VAL | A:41 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -63.9 | 133.3 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.970 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 8.0 | 0.052 | -62.3 | 133.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
2.715 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 7.0 | 0.045 | -63.0 | 133.6 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
4.844 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | G:41 | G:41 | 8.0 | 0.052 | -63.5 | 133.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | I:41 | I:41 | 8.0 | 0.052 | -63.4 | 132.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | K:41 | M:41 | 7.0 | 0.045 | -63.2 | 133.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5wux | 3 | C1K3N5 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-06-07 | VAL | G:41 | E:41 | 0.0 | 0.0 | -89.9 | 107.5 | NA | NA | NA | |||||||
| VAL | H:41 | F:41 | 8.0 | 0.052 | -64.2 | 124.6 | 8.0 | 0.052 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | I:41 | G:41 | 3.0 | 0.019 | -73.6 | 128.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6ooy | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2019-12-25 | VAL | A:41 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -85.7 | 134.4 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
4.338 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 8.0 | 0.052 | -62.0 | 135.6 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.293 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 2.0 | 0.013 | -83.3 | 96.5 | 2.0 | 0.013 | 0.0 |
HOH |
8.182 |
CG2 |
O |
||||||||||
| 6ooz | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2019-12-25 | VAL | A:41 | A:41 | 9.0 | 0.058 | -73.3 | 140.3 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
3.026 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 9.0 | 0.058 | -80.8 | 128.4 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
3.476 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 18.0 | 0.116 | -99.7 | 119.9 | 18.0 | 0.116 | 0.0 | ||||||||||||||
| 6rmj | 1 | P01375 | 99.37 | 3e-114 |
X-RAY |
2019-10-09 | VAL | A:47 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -66.9 | 134.6 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
7.439 |
HB |
O |
|||
| VAL | B:47 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -67.7 | 135.5 | 7.0 | 0.045 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:47 | C:41 | 6.0 | 0.039 | -66.8 | 134.4 | 6.0 | 0.039 | 0.0 | ||||||||||||||
| 5uui | 1 | P01375 | 98.73 | 1e-113 |
X-RAY |
2017-08-02 | VAL | A:42 | A:41 | 9.0 | 0.058 | -66.3 | 139.0 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
2.561 |
O |
O |
|||
| 1a8m | 1 | P01375 | 99.36 | 1e-113 |
X-RAY |
1998-06-17 | VAL | A:41 | A:41 | 5.0 | 0.032 | -78.5 | 154.6 | 5.0 | 0.032 | 0.0 |
HOH |
2.982 |
CG2 |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -47.7 | 143.2 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
3.597 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 3.0 | 0.019 | -110.3 | 62.8 | 3.0 | 0.019 | 0.0 |
HOH |
3.105 |
CG2 |
O |
||||||||||
| 3wd5 | 1 | P01375 | 99.36 | 1e-113 |
X-RAY |
2013-08-14 | VAL | A:41 | A:41 | 1.0 | 0.006 | -65.5 | 139.7 | 1.0 | 0.006 | 0.0 | |||||||
| 1tnf | 1 | P01375 | 99.36 | 5e-113 |
X-RAY |
1990-01-15 | VAL | A:41 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -81.6 | 128.9 | 7.0 | 0.045 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:41 | B:41 | 10.0 | 0.065 | -75.0 | 150.2 | 10.0 | 0.065 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 6.0 | 0.039 | -72.4 | 148.3 | 6.0 | 0.039 | 0.0 | ||||||||||||||
| 2tun | 1 | P01375 | 98.73 | 2e-112 |
X-RAY |
1994-01-31 | VAL | A:41 | A:41 | 13.0 | 0.084 | -74.4 | 122.7 | 13.0 | 0.084 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:41 | B:41 | 1.0 | 0.006 | -67.7 | 123.4 | 1.0 | 0.006 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 2.0 | 0.013 | -57.1 | 125.5 | 2.0 | 0.013 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | D:41 | D:41 | 0.0 | 0.0 | -74.4 | 118.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | E:41 | E:41 | 11.0 | 0.071 | -47.2 | 128.8 | 11.0 | 0.071 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | F:41 | F:41 | 15.0 | 0.097 | -71.3 | 158.5 | 15.0 | 0.097 | 0.0 | ||||||||||||||
| 3it8 | 1 | P01375 | 99.34 | 1e-109 |
X-RAY |
2009-10-20 | VAL | A:45 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -69.6 | 137.6 | 0.0 | 0.0 | 0.052 |
D:Q9DHW0:0.052 |
HOH |
2.575 |
O |
O |
||
| VAL | B:45 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -68.4 | 139.6 | 0.0 | 0.0 | 0.045 |
E:Q9DHW0:0.045 |
HOH |
2.948 |
O |
O |
|||||||||
| VAL | C:45 | C:41 | 7.0 | 0.045 | -67.5 | 138.4 | 0.0 | 0.0 | 0.045 |
F:Q9DHW0:0.045 |
HOH |
2.508 |
O |
O |
|||||||||
| VAL | G:45 | G:41 | 7.0 | 0.045 | -67.4 | 139.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | H:45 | H:41 | 8.0 | 0.052 | -69.0 | 139.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | I:45 | I:41 | 7.0 | 0.045 | -68.5 | 137.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3alq | 1 | P01375 | 96.18 | 2e-109 |
X-RAY |
2010-11-17 | VAL | A:41 | A:41 | 4.0 | 0.026 | -72.7 | 125.3 | 4.0 | 0.026 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:41 | B:41 | 4.0 | 0.026 | -66.2 | 123.2 | 4.0 | 0.026 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 4.0 | 0.026 | -66.4 | 125.3 | 4.0 | 0.026 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | D:41 | D:41 | 6.0 | 0.039 | -69.4 | 128.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:41 | E:41 | 3.0 | 0.019 | -64.0 | 129.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:41 | F:41 | 9.0 | 0.058 | -78.9 | 130.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3l9j | 2 | P01375 | 100.0 | 1e-108 |
X-RAY |
2010-02-23 | VAL | B:33 | T:41 | 0.0 | 0.0 | -67.4 | 138.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
2.631 |
O |
O |
|||
| 2az5 | 1 | P01375 | 100.0 | 6e-108 |
X-RAY |
2005-11-29 | VAL | A:32 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -69.6 | 135.1 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
7.987 |
CG2 |
O |
|||
| VAL | B:32 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -66.4 | 135.7 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
2.915 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:32 | C:41 | 6.0 | 0.039 | -68.1 | 131.9 | 6.0 | 0.039 | 0.0 |
HOH |
7.095 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | D:32 | D:41 | 8.0 | 0.052 | -68.1 | 134.9 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.704 |
O |
O |
||||||||||
| 4tsv | 1 | P01375 | 98.0 | 6e-107 |
X-RAY |
1998-12-30 | VAL | A:34 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -67.7 | 131.3 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
3.122 |
O |
O |
|||
| 5tsw | 1 | P01375 | 98.0 | 6e-107 |
X-RAY |
1999-05-07 | VAL | A:34 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -71.4 | 128.6 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.175 |
O |
H1 |
|||
| VAL | B:34 | B:41 | 7.0 | 0.045 | -64.0 | 146.4 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
2.308 |
O |
H2 |
||||||||||
| VAL | C:34 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -67.0 | 128.4 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
2.058 |
O |
H2 |
||||||||||
| VAL | D:34 | D:41 | 9.0 | 0.058 | -63.2 | 134.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | E:34 | E:41 | 7.0 | 0.045 | -73.6 | 133.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| VAL | F:34 | F:41 | 10.0 | 0.065 | -65.1 | 131.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2e7a | 1 | P01375 | 92.36 | 9e-106 |
X-RAY |
2007-11-13 | VAL | A:41 | A:41 | 8.0 | 0.052 | -74.2 | 141.7 | 8.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
2.832 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 5.0 | 0.032 | -68.0 | 138.7 | 5.0 | 0.032 | 0.0 |
HOH |
4.736 |
O |
O |
||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 9.0 | 0.058 | -72.7 | 138.4 | 9.0 | 0.058 | 0.0 |
HOH |
2.855 |
O |
O |
||||||||||
| 2zjc | 1 | P01375 | 92.99 | 3e-105 |
X-RAY |
2009-01-20 | VAL | A:41 | A:41 | 7.0 | 0.045 | -62.0 | 138.6 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
3.811 |
O |
O |
|||
| VAL | B:41 | B:41 | 6.0 | 0.039 | -52.5 | 132.6 | 6.0 | 0.039 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 7.0 | 0.045 | -77.4 | 133.0 | 7.0 | 0.045 | 0.0 |
HOH |
5.381 |
N |
O |
||||||||||
| 2zpx | 1 | P01375 | 92.36 | 3e-104 |
X-RAY |
2009-03-24 | VAL | A:41 | A:41 | 4.0 | 0.026 | -64.1 | 132.5 | 4.0 | 0.026 | 0.0 | |||||||
| VAL | B:41 | B:41 | 3.0 | 0.019 | -64.0 | 132.8 | 3.0 | 0.019 | 0.0 | ||||||||||||||
| VAL | C:41 | C:41 | 4.0 | 0.026 | -64.8 | 132.2 | 4.0 | 0.026 | 0.0 | ||||||||||||||
| 7kp7 | 1 | P06804 | 80.54 | 4e-88 |
X-RAY |
2021-01-13 | MET | A:33 | B:42 | 6.0 | 0.032 | -60.9 | 139.9 | 6.0 | 0.032 | 0.0 |
HOH |
3.311 |
O |
O |
|||
| MET | B:33 | A:42 | 10.0 | 0.054 | -59.2 | 137.3 | 10.0 | 0.054 | 0.0 |
HOH |
2.768 |
O |
O |
||||||||||
| MET | C:33 | C:42 | 5.0 | 0.027 | -61.3 | 140.3 | 5.0 | 0.027 | 0.0 |
HOH |
2.922 |
O |
O |
||||||||||
| 7kp8 | 1 | P06804 | 80.41 | 1e-87 |
X-RAY |
2021-01-13 | MET | A:32 | A:41 | 10.0 | 0.054 | -58.3 | 134.7 | 10.0 | 0.054 | 0.0 | |||||||
| MET | B:32 | B:41 | 9.0 | 0.049 | -58.7 | 135.6 | 9.0 | 0.049 | 0.0 | ||||||||||||||
| MET | C:32 | C:41 | 9.0 | 0.049 | -58.7 | 133.6 | 9.0 | 0.049 | 0.0 | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p01375-f1 | 1 | P01375 | 100.0 | 2e-174 | VAL | A:117 | A:117 | 7.0 | 0.045 | -65.6 | 130.6 | ||