Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 31545148 | . | G | A | CCDS4702.1:NM_000594.3:c.536aGg>aAg_NP_000585.2:p.179R>K | Homo sapiens tumor necrosis factor (TNF), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6op0 | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2019-12-25 | ARG | A:104 | A:103 | 73.0 | NA | S | -126.5 | 171.3 | 73.0 | NA | NA | ||||||
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7kp9 | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7kpa | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 75.0 | NA | S | -140.9 | 155.2 | 75.0 | NA | NA |
HOH |
4.744 |
C |
O |
||
| ARG | B:104 | B:103 | 77.0 | NA | S | -115.2 | 140.7 | 66.0 | NA | NA |
A:P01375:NA |
HOH |
8.102 |
N |
O |
||||||||
| ARG | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7kpb | 1 | P01375 | 99.37 | 6e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 65.0 | NA | S | -155.5 | 159.2 | 65.0 | NA | NA | ||||||
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5mu8 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2017-03-29 | ARG | A:105 | A:103 | 221.0 | 0.982 | S | -109.7 | 140.4 | 151.0 | 0.671 | 0.311 |
B:P01375:0.311 |
|||||
| ARG | B:105 | B:103 | 207.0 | 0.92 | S | -163.8 | 136.9 | 170.0 | 0.756 | 0.164 |
A:P01375:0.164 |
||||||||||||
| ARG | C:105 | C:103 | 187.0 | 0.831 | S | -106.6 | 162.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | D:105 | D:103 | 219.0 | 0.973 | S | -132.6 | 163.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | E:105 | F:103 | 190.0 | 0.844 | S | -152.4 | 159.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:105 | G:103 | 195.0 | 0.867 | S | -129.7 | 156.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | G:105 | H:103 | 129.0 | 0.573 | S | -149.3 | 141.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | H:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:105 | J:103 | 191.0 | 0.849 | S | -145.4 | 144.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | J:105 | K:103 | 208.0 | 0.924 | S | -127.9 | 163.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | K:105 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | L:105 | M:103 | 229.0 | 1.0 | S | -110.3 | 142.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | M:105 | N:103 | 227.0 | 1.0 | S | -155.4 | 146.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | N:105 | O:103 | 208.0 | 0.924 | S | -150.2 | 161.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | O:105 | P:103 | 189.0 | 0.84 | -156.5 | -160.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | P:105 | Q:103 | 217.0 | 0.964 | S | -132.9 | 170.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | Q:105 | R:103 | 203.0 | 0.902 | S | -153.0 | 137.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | R:105 | S:103 | 216.0 | 0.96 | S | -150.5 | 154.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | S:105 | T:103 | 189.0 | 0.84 | S | -130.9 | 138.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | T:105 | U:103 | 216.0 | 0.96 | S | -131.2 | 149.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | U:105 | V:103 | 213.0 | 0.947 | S | -156.5 | 132.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | V:105 | W:103 | 211.0 | 0.938 | S | -159.0 | 159.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | W:105 | X:103 | 151.0 | 0.671 | S | -172.9 | 142.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | X:105 | Y:103 | 221.0 | 0.982 | S | -113.2 | 143.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | Y:105 | Z:103 | 208.0 | 0.924 | S | -147.3 | 172.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | Z:105 | a:103 | 222.0 | 0.987 | S | -133.1 | 139.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | AA:105 | b:103 | 210.0 | 0.933 | S | -148.9 | 140.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | BA:105 | c:103 | 227.0 | 1.0 | S | -119.0 | 150.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | CA:105 | d:103 | 203.0 | 0.902 | S | -159.7 | 165.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | DA:105 | e:103 | 224.0 | 0.996 | S | -116.1 | 137.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | EA:105 | f:103 | 175.0 | 0.778 | -160.4 | 143.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | FA:105 | g:103 | 215.0 | 0.956 | -121.3 | 170.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | GA:105 | h:103 | 195.0 | 0.867 | S | -157.7 | -168.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | HA:105 | i:103 | 216.0 | 0.96 | S | -159.5 | 153.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | IA:105 | j:103 | 204.0 | 0.907 | S | -154.1 | 149.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | JA:105 | k:103 | 220.0 | 0.978 | -162.5 | 172.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | KA:105 | l:103 | 195.0 | 0.867 | S | -106.4 | 139.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | LA:105 | m:103 | 191.0 | 0.849 | S | -139.0 | 161.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | MA:105 | n:103 | 188.0 | 0.836 | S | -156.5 | 134.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | NA:105 | o:103 | 219.0 | 0.973 | S | -119.1 | 163.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | OA:105 | p:103 | 191.0 | 0.849 | S | -158.1 | 154.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | PA:105 | q:103 | 173.0 | 0.769 | S | -137.4 | 157.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | QA:105 | r:103 | 199.0 | 0.884 | S | -120.7 | -161.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | RA:105 | s:103 | 210.0 | 0.933 | S | -140.4 | 142.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | SA:105 | t:103 | 211.0 | 0.938 | S | -144.8 | 153.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | TA:105 | u:103 | 197.0 | 0.876 | S | -129.0 | 156.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | UA:105 | v:103 | 206.0 | 0.916 | -168.6 | 132.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | VA:105 | w:103 | 216.0 | 0.96 | S | -131.1 | 157.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6x81 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 199.0 | 0.884 | S | 40.7 | 51.2 | 199.0 | 0.884 | 0.0 | ||||||
| ARG | B:104 | B:103 | 211.0 | 0.938 | 68.5 | -129.6 | 163.0 | 0.724 | 0.214 |
C:P01375:0.213 |
HOH |
5.025 |
N |
O |
|||||||||
| ARG | C:104 | C:103 | 286.0 | 1.0 | 60.2 | 360.0 | 200.0 | 0.889 | 0.111 |
A:P01375:0.204 B:P01375:0.178 |
HOH |
9.864 |
N |
O |
|||||||||
| ARG | D:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | E:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:104 | F:103 | 254.0 | 1.0 | 64.2 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x82 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 144.0 | 0.64 | 73.8 | 147.8 | 140.0 | 0.622 | 0.018 |
B:P01375:0.018 |
HOH |
6.810 |
N |
O |
||
| ARG | B:104 | B:103 | 221.0 | 0.982 | 77.2 | 146.2 | 126.0 | 0.56 | 0.422 |
C:P01375:0.204 A:P01375:0.253 |
HOH |
3.528 |
CA |
O |
|||||||||
| ARG | C:104 | C:103 | 226.0 | 1.0 | 62.8 | 360.0 | 168.0 | 0.747 | 0.253 |
A:P01375:0.173 B:P01375:0.084 |
HOH |
6.540 |
N |
O |
|||||||||
| ARG | D:104 | D:103 | 202.0 | 0.898 | 52.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | E:104 | E:103 | 196.0 | 0.871 | -158.4 | -160.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | F:104 | F:103 | 222.0 | 0.987 | 72.0 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x83 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | D:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | E:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:104 | F:103 | 223.0 | 0.991 | 60.8 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x85 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 192.0 | 0.853 | S | -142.1 | 94.9 | 192.0 | 0.853 | 0.0 | ||||||
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | C:103 | 184.0 | 0.818 | -140.3 | 138.3 | 142.0 | 0.631 | 0.187 |
A:P01375:0.187 |
|||||||||||||
| ARG | D:104 | D:103 | 235.0 | 1.0 | -157.4 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | E:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:104 | F:103 | 185.0 | 0.822 | -156.7 | -162.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6x86 | 1 | P01375 | 100.0 | 9e-115 |
X-RAY |
2021-01-13 | ARG | A:104 | A:103 | 170.0 | 0.756 | S | -155.5 | 105.7 | 166.0 | 0.738 | 0.018 |
C:P01375:0.018 |
HOH |
7.045 |
N |
O |
|
| ARG | B:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:104 | C:103 | 183.0 | 0.813 | -135.6 | -160.2 | 154.0 | 0.684 | 0.129 |
B:P01375:0.129 |
HOH |
3.246 |
O |
O |
|||||||||
| ARG | D:104 | D:103 | 195.0 | 0.867 | 179.1 | -153.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | E:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:104 | F:103 | 189.0 | 0.84 | -96.3 | 131.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5yoy | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2018-05-09 | ARG | A:111 | A:103 | 207.0 | 0.92 | S | -163.7 | 159.9 | 126.0 | 0.56 | 0.36 |
B:P01375:0.36 |
HOH |
8.407 |
CA |
O |
|
| ARG | B:111 | B:103 | 187.0 | 0.831 | S | -129.6 | 158.9 | 138.0 | 0.613 | 0.218 |
C:P01375:0.027 A:P01375:0.196 |
HOH |
9.218 |
O |
O |
||||||||
| ARG | C:111 | C:103 | 182.0 | 0.809 | S | -124.6 | 157.5 | 172.0 | 0.764 | 0.045 |
A:P01375:0.044 |
HOH |
7.600 |
NH2 |
O |
||||||||
| ARG | J:111 | J:103 | 189.0 | 0.84 | S | -152.4 | 160.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | K:111 | K:103 | 193.0 | 0.858 | S | -104.7 | 159.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | L:111 | L:103 | 209.0 | 0.929 | S | -108.3 | 166.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7jra | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2020-12-09 | ARG | A:106 | A:179 | 94.0 | NA | S | -113.2 | -9.8 | 85.0 | NA | NA |
B:P01375:NA |
HOH |
7.323 |
N |
O |
|
| ARG | B:106 | B:179 | 98.0 | NA | S | -113.0 | -8.6 | 88.0 | NA | NA |
A:P01375:NA |
HOH |
7.070 |
N |
O |
||||||||
| ARG | C:106 | C:179 | 105.0 | NA | -106.9 | -2.5 | 105.0 | NA | NA |
HOH |
8.674 |
N |
O |
||||||||||
| 4g3y | 3 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2013-03-27 | ARG | C:103 | C:103 | 108.0 | 0.48 | S | -126.2 | -161.8 | 64.0 | 0.284 | 0.196 |
C:P01375:0.031 C:P01375:0.16 |
HOH |
2.957 |
NH2 |
O |
|
| 4twt | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2015-02-04 | ARG | A:103 | A:103 | 181.0 | 0.804 | S | -153.0 | 135.4 | 152.0 | 0.676 | 0.128 |
B:P01375:0.129 |
HOH |
7.220 |
N |
O |
|
| ARG | B:103 | B:103 | 110.0 | NA | S | 48.2 | 62.6 | 45.0 | NA | NA |
A:P01375:NA |
||||||||||||
| ARG | E:103 | C:103 | 52.0 | NA | S | -142.1 | 155.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:103 | D:103 | 160.0 | 0.711 | 87.7 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5m2i | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | ARG | A:103 | A:103 | 78.0 | NA | S | -129.6 | 134.3 | 58.0 | NA | NA |
C:P01375:NA B:P01375:NA |
HOH |
4.068 |
O |
O |
|
| ARG | B:103 | B:103 | 73.0 | NA | S | 64.5 | -83.7 | 44.0 | NA | NA |
C:P01375:NA |
HOH |
3.465 |
O |
O |
||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 209.0 | 0.929 | S | -145.3 | 137.3 | 149.0 | 0.662 | 0.267 |
A:P01375:0.267 |
HOH |
4.378 |
CD |
O |
||||||||
| ARG | D:103 | D:103 | 112.0 | NA | S | 51.5 | 53.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | E:103 | E:103 | 81.0 | NA | S | 61.2 | -139.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:103 | F:103 | 212.0 | 0.942 | S | -142.5 | 136.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5m2j | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | ARG | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5m2m | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-08-30 | ARG | A:103 | A:103 | 74.0 | NA | S | -154.8 | 150.4 | 65.0 | NA | NA |
B:P01375:NA |
HOH |
3.481 |
N |
O |
|
| ARG | B:103 | B:103 | 73.0 | NA | S | -152.2 | 149.7 | 68.0 | NA | NA |
C:P01375:NA |
HOH |
4.329 |
CB |
O |
||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 75.0 | NA | S | -157.5 | 144.9 | 75.0 | NA | NA |
HOH |
3.724 |
CA |
O |
|||||||||
| ARG | G:103 | G:103 | 79.0 | NA | S | -151.3 | 145.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:103 | I:103 | 71.0 | NA | S | -152.4 | 147.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | K:103 | M:103 | 79.0 | NA | S | -144.8 | 153.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5wux | 3 | C1K3N5 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2017-06-07 | ARG | G:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | H:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6ooy | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2019-12-25 | ARG | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6ooz | 1 | P01375 | 100.0 | 1e-114 |
X-RAY |
2019-12-25 | ARG | A:103 | A:103 | 185.0 | 0.822 | S | -138.0 | 163.9 | 185.0 | 0.822 | 0.0 |
HOH |
4.717 |
O |
O |
||
| ARG | B:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 78.0 | NA | -143.1 | 169.4 | 78.0 | NA | NA | ||||||||||||||
| 6rmj | 1 | P01375 | 99.37 | 3e-114 |
X-RAY |
2019-10-09 | ARG | A:109 | A:103 | 204.0 | 0.907 | S | -133.9 | 149.4 | 91.0 | 0.404 | 0.503 |
B:P01375:0.453 C:P01375:0.093 |
|||||
| ARG | B:109 | B:103 | 212.0 | 0.942 | S | -139.6 | 153.2 | 77.0 | 0.342 | 0.6 |
A:P01375:0.222 C:P01375:0.391 |
||||||||||||
| ARG | C:109 | C:103 | 202.0 | 0.898 | S | -132.9 | 147.7 | 98.0 | 0.436 | 0.462 |
A:P01375:0.284 B:P01375:0.222 |
||||||||||||
| 5uui | 1 | P01375 | 98.73 | 1e-113 |
X-RAY |
2017-08-02 | ARG | A:104 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1a8m | 1 | P01375 | 99.36 | 1e-113 |
X-RAY |
1998-06-17 | ARG | A:103 | A:103 | 184.0 | 0.818 | S | 61.4 | -83.1 | 32.0 | 0.142 | 0.676 |
B:P01375:0.676 |
HOH |
8.102 |
O |
O |
|
| ARG | B:103 | B:103 | 185.0 | 0.822 | S | -31.0 | 161.8 | 63.0 | 0.28 | 0.542 |
A:P01375:0.502 C:P01375:0.04 |
HOH |
3.964 |
O |
O |
||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 123.0 | 0.547 | S | 34.2 | 107.0 | 88.0 | 0.391 | 0.156 |
A:P01375:0.156 |
HOH |
8.181 |
N |
O |
||||||||
| 3wd5 | 1 | P01375 | 99.36 | 1e-113 |
X-RAY |
2013-08-14 | ARG | A:103 | A:103 | 146.0 | 0.649 | S | 42.0 | -29.1 | 146.0 | 0.649 | 0.0 |
HOH |
5.798 |
NH1 |
O |
||
| 1tnf | 1 | P01375 | 99.36 | 5e-113 |
X-RAY |
1990-01-15 | ARG | A:103 | A:103 | 206.0 | 0.916 | S | 59.2 | 172.6 | 89.0 | 0.396 | 0.52 |
C:P01375:0.027 B:P01375:0.493 |
|||||
| ARG | B:103 | B:103 | 206.0 | 0.916 | S | 61.8 | 163.7 | 168.0 | 0.747 | 0.169 |
C:P01375:0.169 |
||||||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 215.0 | 0.956 | S | -55.3 | 119.8 | 145.0 | 0.644 | 0.312 |
A:P01375:0.311 |
||||||||||||
| 2tun | 1 | P01375 | 98.73 | 2e-112 |
X-RAY |
1994-01-31 | ARG | A:103 | A:103 | 190.0 | 0.844 | 55.6 | -101.1 | 119.0 | 0.529 | 0.315 |
B:P01375:0.316 |
||||||
| ARG | B:103 | B:103 | 236.0 | 1.0 | S | 93.4 | 147.8 | 160.0 | 0.711 | 0.289 |
A:P01375:0.044 C:P01375:0.293 |
||||||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 172.0 | 0.764 | S | -28.0 | 96.9 | 103.0 | 0.458 | 0.306 |
A:P01375:0.307 |
||||||||||||
| ARG | D:103 | D:103 | 207.0 | 0.92 | S | 74.1 | -96.5 | 111.0 | 0.493 | 0.427 |
E:P01375:0.427 |
||||||||||||
| ARG | E:103 | E:103 | 190.0 | 0.844 | S | -167.8 | 138.5 | 172.0 | 0.764 | 0.08 |
D:P01375:0.036 F:P01375:0.04 |
||||||||||||
| ARG | F:103 | F:103 | 224.0 | 0.996 | S | -132.7 | 73.2 | 170.0 | 0.756 | 0.24 |
D:P01375:0.24 |
||||||||||||
| 3it8 | 1 | P01375 | 99.34 | 1e-109 |
X-RAY |
2009-10-20 | ARG | A:107 | A:103 | 156.0 | 0.693 | S | 73.3 | -0.1 | 92.0 | 0.409 | 0.284 |
C:P01375:0.284 |
|||||
| ARG | B:107 | B:103 | 155.0 | 0.689 | S | 73.3 | -0.1 | 92.0 | 0.409 | 0.28 |
A:P01375:0.28 |
||||||||||||
| ARG | C:107 | C:103 | 153.0 | 0.68 | S | 73.3 | 0.1 | 85.0 | 0.378 | 0.302 |
B:P01375:0.302 |
||||||||||||
| ARG | G:107 | G:103 | 157.0 | 0.698 | S | 73.5 | -0.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | H:107 | H:103 | 153.0 | 0.68 | S | 73.4 | 0.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:107 | I:103 | 153.0 | 0.68 | S | 73.6 | -0.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3alq | 1 | P01375 | 96.18 | 2e-109 |
X-RAY |
2010-11-17 | ARG | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | D:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | E:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | F:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3l9j | 2 | P01375 | 100.0 | 1e-108 |
X-RAY |
2010-02-23 | ARG | B:95 | T:103 | 212.0 | 0.942 | S | -158.9 | 126.1 | 212.0 | 0.942 | 0.0 |
HOH |
2.708 |
O |
O |
||
| 2az5 | 1 | P01375 | 100.0 | 6e-108 |
X-RAY |
2005-11-29 | ARG | A:94 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:94 | B:103 | 101.0 | NA | -137.3 | 360.0 | 101.0 | NA | NA |
HOH |
3.070 |
O |
O |
||||||||||
| ARG | C:94 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | D:94 | D:103 | 99.0 | NA | -137.3 | 360.0 | 99.0 | NA | NA |
HOH |
2.813 |
CB |
O |
||||||||||
| 4tsv | 1 | P01375 | 98.0 | 6e-107 |
X-RAY |
1998-12-30 | ARG | A:96 | A:103 | 67.0 | NA | -157.1 | 169.7 | 66.0 | NA | NA |
A:P01375:NA |
HOH |
4.288 |
CB |
O |
||
| 5tsw | 1 | P01375 | 98.0 | 6e-107 |
X-RAY |
1999-05-07 | ARG | A:96 | A:103 | 70.0 | NA | -156.4 | 158.2 | 60.0 | NA | NA |
B:P01375:NA |
HOH |
6.400 |
H |
O |
||
| ARG | B:96 | B:103 | 60.0 | NA | -123.1 | -174.2 | 60.0 | NA | NA |
HOH |
6.377 |
O |
H2 |
||||||||||
| ARG | C:96 | C:103 | 57.0 | NA | -88.9 | -166.7 | 57.0 | NA | NA |
HOH |
6.302 |
C |
H1 |
||||||||||
| ARG | D:96 | D:103 | 69.0 | NA | -139.2 | 164.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | E:96 | E:103 | 51.0 | NA | -162.9 | 158.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ARG | F:96 | F:103 | 79.0 | NA | -79.1 | 161.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2e7a | 1 | P01375 | 92.36 | 9e-106 |
X-RAY |
2007-11-13 | ARG | A:103 | A:103 | 174.0 | 0.773 | S | -163.2 | 152.0 | 163.0 | 0.724 | 0.049 |
C:P01375:0.049 |
HOH |
2.577 |
O |
O |
|
| ARG | B:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:103 | C:103 | 206.0 | 0.916 | -115.3 | 360.0 | 192.0 | 0.853 | 0.063 |
B:P01375:0.062 |
HOH |
6.160 |
N |
O |
|||||||||
| 2zjc | 1 | P01375 | 92.99 | 3e-105 |
X-RAY |
2009-01-20 | ARG | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:103 | B:103 | 194.0 | 0.862 | S | -122.1 | 154.8 | 154.0 | 0.684 | 0.178 |
C:P01375:0.156 A:P01375:0.018 |
HOH |
9.555 |
O |
O |
||||||||
| ARG | C:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2zpx | 1 | P01375 | 92.36 | 3e-104 |
X-RAY |
2009-03-24 | ARG | A:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ARG | B:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:103 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7kp7 | 1 | P06804 | 80.54 | 4e-88 |
X-RAY |
2021-01-13 | LYS | A:94 | B:103 | 74.0 | NA | S | -114.8 | 143.3 | 72.0 | NA | NA |
B:P06804:NA |
SO4 HOH |
3.302 6.696 |
CA N |
O3 O |
|
| LYS | B:94 | A:103 | 74.0 | NA | S | -113.4 | 142.9 | 71.0 | NA | NA |
C:P06804:NA |
SO4 HOH |
3.303 3.309 |
C C |
O2 O |
||||||||
| LYS | C:94 | C:103 | 74.0 | NA | S | -115.2 | 142.6 | 71.0 | NA | NA |
A:P06804:NA |
SO4 HOH |
3.575 6.767 |
C N |
O2 O |
||||||||
| 7kp8 | 1 | P06804 | 80.41 | 1e-87 |
X-RAY |
2021-01-13 | LYS | A:93 | A:102 | 74.0 | NA | 61.1 | 27.1 | 74.0 | NA | NA | |||||||
| LYS | B:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | C:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p01375-f1 | 1 | P01375 | 100.0 | 2e-174 | ARG | A:179 | A:179 | 220.0 | 0.978 | S | -142.1 | 146.8 | |