Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 42975001 | . | A | C | CCDS4878.1:NM_006245.3:c.590gAg>gCg_NP_006236.1:p.197E>A | Homo sapiens protein phosphatase 2 regulatory subunit B'delta (PPP2R5D), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2npp | 2 | Q13362 | 87.89 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:121 | B:111 | 118.0 | 0.621 | G | -63.5 | -23.3 | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | E:121 | E:111 | 117.0 | 0.616 | G | -59.7 | -23.7 | 117.0 | 0.616 | 0.0 | |||||||||||||
| 2iae | 2 | Q13362 | 88.21 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-26 | GLU | B:92 | B:121 | 142.0 | 0.747 | S | -54.6 | 47.0 | 92.0 | 0.484 | 0.263 |
G:NOR00109:0.237 C:P67775:0.095 |
|||||
| GLU | E:92 | E:121 | 145.0 | 0.763 | S | -53.7 | 17.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3fga | 2 | Q13362 | 88.83 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-22 | GLU | B:88 | B:111 | 103.0 | 0.542 | G | -65.8 | -30.4 | 103.0 | 0.542 | 0.0 |
HOH |
6.501 |
C |
O |
||
| 2nyl | 2 | Q13362 | 90.93 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:84 | B:111 | 117.0 | 0.616 | G | -59.2 | -27.0 | 117.0 | 0.616 | 0.0 | ||||||
| GLU | E:84 | E:111 | 117.0 | 0.616 | G | -53.2 | -30.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2nym | 2 | Q13362 | 90.93 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:84 | B:111 | 119.0 | 0.626 | G | -66.2 | -8.6 | 119.0 | 0.626 | 0.0 | ||||||
| GLU | E:84 | E:111 | 120.0 | 0.632 | G | -75.9 | -10.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5jja | 1 | Q13362 | 88.64 | 0.0 |
X-RAY |
2016-07-13 | GLU | A:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6toq | 2 | Q13362 | 88.89 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-21 | GLU | B:111 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2jak | 1 | Q13362 | 88.89 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-04 | GLU | A:133 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5k6s | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-12-07 | GLU | A:96 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5sw9 | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-11-30 | GLU | A:96 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5swf | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-11-30 | GLU | A:96 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6oyl | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-25 | GLU | A:96 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6vro | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-25 | GLU | A:96 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ouf | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7oug | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7ouh | 2 | ? | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7pel | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-25 | GLU | C:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:438 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6voy | 2 | Q13362 | 89.21 | 0.0 |
EM |
2020-07-01 | GLU | E:92 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | F:92 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q14738-f1 | 1 | Q14738 | 100.0 | 0.0 | GLU | A:197 | A:197 | 117.0 | 0.616 | T | -74.1 | -17.4 | |
| af-q13362-f1 | 1 | Q13362 | 81.45 | 0.0 | GLU | A:121 | A:121 | 114.0 | 0.6 | G | -70.1 | -20.0 | |