Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 52052549 | . | A | C | CCDS4937.1:NM_002190.2:c.176aAt>aCt_NP_002181.1:p.59N>T | Homo sapiens interleukin 17A (IL17A), mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5n7w | 3 | Q16552 | 100.0 | 2e-113 |
X-RAY |
2018-11-14 | ASN | E:59 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | F:59 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6wio | 3 | Q16552 | 100.0 | 3e-113 |
X-RAY |
2020-09-23 | ASN | C:59 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6wir | 3 | Q16552 | 100.0 | 3e-113 |
X-RAY |
2020-09-23 | ASN | C:59 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2vxs | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-99 |
X-RAY |
2009-07-14 | ASN | A:41 | A:36 | 16.0 | 0.1 | -47.3 | 117.5 | NA | NA | NA | |||||||
ASN | B:41 | B:36 | 61.0 | 0.381 | 360.0 | 116.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ASN | C:41 | C:36 | 51.0 | NA | 360.0 | 87.4 | 51.0 | NA | NA |
HOH |
8.451 |
O |
O |
||||||||||
ASN | D:41 | D:36 | 74.0 | 0.463 | 360.0 | 112.7 | 74.0 | 0.463 | 0.0 |
HOH |
8.843 |
O |
O |
||||||||||
5hhx | 1 | Q16552 | 98.55 | 2e-99 |
X-RAY |
2016-06-01 | ASN | A:42 | A:36 | 83.0 | 0.519 | 360.0 | 110.0 | 83.0 | 0.519 | 0.0 | |||||||
ASN | B:42 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5hi3 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | ASN | A:36 | A:36 | 90.0 | 0.562 | 360.0 | 127.2 | 90.0 | 0.562 | 0.0 |
63O |
7.307 |
N |
C23 |
|||
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63O HOH |
7.524 5.858 |
N N |
C23 O |
||||||||||
5hi4 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | ASN | A:36 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | B:36 | B:36 | 85.0 | 0.531 | 360.0 | 120.9 | 85.0 | 0.531 | 0.0 |
HOH |
7.119 |
C |
O |
||||||||||
5hi5 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | ASN | A:36 | A:36 | 86.0 | 0.537 | 360.0 | 124.6 | 86.0 | 0.537 | 0.0 |
HOH |
8.512 |
C |
O |
|||
ASN | B:36 | B:36 | 86.0 | 0.537 | 360.0 | 125.3 | 86.0 | 0.537 | 0.0 |
63Q HOH |
3.362 8.374 |
N C |
H4 O |
||||||||||
5n92 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2017-09-06 | ASN | A:36 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5nan | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2017-09-06 | ASN | A:36 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | D:36 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4qhu | 3 | Q16552 | 98.48 | 2e-95 |
X-RAY |
2015-08-05 | ASN | E:36 | C:36 | 86.0 | 0.537 | S | 48.3 | 58.0 | 13.0 | 0.081 | 0.456 |
F:Q16552:0.019 A:None:0.444 |
SO4 HOH |
3.127 2.914 |
C N |
O3 O |
|
ASN | F:36 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5hhv | 1 | Q16552 | 98.36 | 5e-87 |
X-RAY |
2016-06-01 | ASN | A:27 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | B:27 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4hr9 | 1 | Q16552 | 98.36 | 6e-87 |
X-RAY |
2013-05-22 | ASN | A:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | B:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4hsa | 1 | Q16552 | 98.36 | 6e-87 |
X-RAY |
2013-05-22 | ASN | A:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | B:26 | B:36 | 127.0 | 0.794 | -36.9 | -65.2 | 127.0 | 0.794 | 0.0 | ||||||||||||||
ASN | D:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | E:26 | E:36 | 124.0 | 0.775 | -36.9 | -65.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
5vb9 | 1 | Q16552 | 98.31 | 6e-84 |
X-RAY |
2018-02-14 | ASN | A:23 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASN | B:23 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q16552-f1 | 1 | Q16552 | 100.0 | 6e-114 | ASN | A:59 | A:59 | 128.0 | 0.8 | -43.8 | 113.7 |