Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 52052552 | . | C | A | CCDS4937.1:NM_002190.2:c.179cCc>cAc_NP_002181.1:p.60P>H | Homo sapiens interleukin 17A (IL17A), mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5n7w | 3 | Q16552 | 100.0 | 2e-113 |
X-RAY |
2018-11-14 | PRO | E:60 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | F:60 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6wio | 3 | Q16552 | 100.0 | 3e-113 |
X-RAY |
2020-09-23 | PRO | C:60 | C:60 | 175.0 | 1.0 | 360.0 | 103.5 | 175.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.272 |
CA |
O |
|||
| 6wir | 3 | Q16552 | 100.0 | 3e-113 |
X-RAY |
2020-09-23 | PRO | C:60 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2vxs | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-99 |
X-RAY |
2009-07-14 | PRO | A:42 | A:37 | 54.0 | 0.372 | G | -67.6 | -8.5 | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:42 | B:37 | 59.0 | 0.407 | G | -56.8 | -22.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | C:42 | C:37 | 56.0 | 0.386 | G | -41.7 | -44.2 | 50.0 | 0.345 | 0.041 |
D:Q16552:0.041 |
HOH |
5.139 |
O |
O |
||||||||
| PRO | D:42 | D:37 | 60.0 | 0.414 | G | -48.8 | -51.3 | 58.0 | 0.4 | 0.014 |
C:Q16552:0.014 |
HOH |
5.755 |
O |
O |
||||||||
| 5hhx | 1 | Q16552 | 98.55 | 2e-99 |
X-RAY |
2016-06-01 | PRO | A:43 | A:37 | 55.0 | 0.379 | H | -76.5 | -17.3 | 55.0 | 0.379 | 0.0 | ||||||
| PRO | B:43 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5hi3 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | PRO | A:37 | A:37 | 49.0 | 0.338 | T | -77.0 | -16.2 | 49.0 | 0.338 | 0.0 |
63O HOH |
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CG O |
C22 O |
||
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63O HOH |
8.117 5.231 |
CG CG |
C22 O |
|||||||||
| 5hi4 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | PRO | A:37 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:37 | B:37 | 50.0 | 0.345 | T | -74.0 | -12.4 | 50.0 | 0.345 | 0.0 |
63P HOH |
9.139 3.748 |
CG CB |
H37 O |
|||||||||
| 5hi5 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2016-08-31 | PRO | A:37 | A:37 | 49.0 | 0.338 | G | -73.0 | -20.6 | 49.0 | 0.338 | 0.0 |
63Q HOH |
9.163 4.849 |
CG O |
H31 O |
||
| PRO | B:37 | B:37 | 48.0 | 0.331 | G | -73.4 | -20.3 | 46.0 | 0.317 | 0.014 |
A:Q16552:0.014 |
63Q HOH |
3.480 4.726 |
CG O |
H3 O |
||||||||
| 5n92 | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2017-09-06 | PRO | A:37 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5nan | 1 | Q16552 | 100.0 | 1e-96 |
X-RAY |
2017-09-06 | PRO | A:37 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | D:37 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4qhu | 3 | Q16552 | 98.48 | 2e-95 |
X-RAY |
2015-08-05 | PRO | E:37 | C:37 | 63.0 | 0.434 | T | -62.2 | -29.5 | 15.0 | 0.103 | 0.331 |
F:Q16552:0.331 |
SO4 HOH |
3.242 2.678 |
CD O |
O2 O |
|
| PRO | F:37 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5hhv | 1 | Q16552 | 98.36 | 5e-87 |
X-RAY |
2016-06-01 | PRO | A:28 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:28 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4hr9 | 1 | Q16552 | 98.36 | 6e-87 |
X-RAY |
2013-05-22 | PRO | A:27 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:27 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4hsa | 1 | Q16552 | 98.36 | 6e-87 |
X-RAY |
2013-05-22 | PRO | A:27 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:27 | B:37 | 75.0 | 0.517 | S | -75.2 | 144.8 | 62.0 | 0.428 | 0.089 |
C:Q96F46:0.09 |
||||||||||||
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| PRO | E:27 | E:37 | 72.0 | 0.497 | S | -75.5 | 142.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5vb9 | 1 | Q16552 | 98.31 | 6e-84 |
X-RAY |
2018-02-14 | PRO | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q16552-f1 | 1 | Q16552 | 100.0 | 6e-114 | PRO | A:60 | A:60 | 117.0 | 0.807 | S | -71.0 | 23.5 | |