Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 52656661 | . | A | C | CCDS4945.1:NM_145740.3:c.664Ttt>Gtt_NP_665683.1:p.222F>V | Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 1 (GSTA1), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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N3 O |
|||
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GSH HOH |
6.677 4.454 |
CD2 CD2 |
N3 O |
||||||||||
| 1pkz | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-163 |
X-RAY |
2004-06-22 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
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C2' O |
|||
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ABY HOH |
4.172 3.787 |
CE1 CD1 |
C1' O |
||||||||||
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X-RAY |
2020-08-26 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
2008-08-19 | PHE | A:222 | A:222 | 136.0 | NA | -146.8 | 360.0 | 136.0 | NA | NA |
GTX HOH |
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CZ O |
C5S O |
|||
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GTX HOH |
4.214 4.526 |
CE1 CD1 |
C2S O |
||||||||||
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X-RAY |
2012-12-19 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3u6v | 1 | P08263 | 99.55 | 2e-162 |
X-RAY |
2011-10-26 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1gsd | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
1995-09-15 | PHE | A:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PHE | C:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PHE | D:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1gsf | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
1995-09-15 | PHE | A:221 | A:222 | 127.0 | NA | -162.2 | 360.0 | 127.0 | NA | NA |
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3.775 7.514 |
CE1 CD2 |
C9 O |
|||
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EAA HOH |
3.776 7.514 |
CE1 CD2 |
C9 O |
||||||||||
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| 1guh | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
1993-10-31 | PHE | A:221 | A:222 | 127.0 | NA | -96.5 | 360.0 | 127.0 | NA | NA |
GSB |
3.786 |
CE2 |
C2' |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 130.0 | NA | -96.5 | 360.0 | 130.0 | NA | NA |
GSB |
3.785 |
CE2 |
C2' |
||||||||||
| PHE | C:221 | C:222 | 129.0 | NA | -96.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PHE | D:221 | D:222 | 126.0 | NA | -96.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 1k3l | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2002-10-23 | PHE | A:221 | A:222 | 137.0 | NA | -132.6 | 360.0 | 137.0 | NA | NA |
GTX HOH |
3.436 4.360 |
CZ CE1 |
C5S O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 132.0 | NA | -137.6 | 360.0 | 132.0 | NA | NA |
GTX HOH |
4.455 4.408 |
CZ CD1 |
C5S O |
||||||||||
| 1k3o | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2002-10-30 | PHE | A:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1k3y | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2002-10-30 | PHE | A:221 | A:222 | 138.0 | NA | -133.2 | 360.0 | 138.0 | NA | NA |
GTX HOH |
3.900 4.075 |
CZ CB |
C5S O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 135.0 | NA | -142.9 | 360.0 | 135.0 | NA | NA |
GTX HOH |
4.393 4.223 |
CE1 CB |
C2S O |
||||||||||
| 6ato | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2018-09-12 | PHE | A:221 | A:222 | 116.0 | NA | -144.3 | 360.0 | 116.0 | NA | NA |
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CD1 CZ CD1 |
N3 H31 O |
|||
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| 6atp | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2018-09-12 | PHE | A:221 | A:222 | 126.0 | NA | -133.1 | 360.0 | 126.0 | NA | NA |
HOH |
3.992 |
CE2 |
O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 133.0 | NA | -146.3 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6atq | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2018-09-12 | PHE | A:221 | A:222 | 132.0 | NA | -155.4 | 360.0 | 132.0 | NA | NA |
MPD MES HOH |
2.769 2.787 7.647 |
CZ CD2 CZ |
H4 H52 O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 133.0 | NA | -129.8 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6atr | 1 | P08263 | 100.0 | 3e-162 |
X-RAY |
2018-09-12 | PHE | A:221 | A:222 | 133.0 | NA | -145.5 | 360.0 | 133.0 | NA | NA |
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NAQ NAN H12 O |
|||
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| 3zfb | 1 | P08263 | 99.55 | 3e-162 |
X-RAY |
2012-12-19 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1ydk | 1 | P08263 | 99.55 | 3e-162 |
X-RAY |
2005-06-07 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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A:P08263:NA |
GTX HOH |
3.743 4.175 |
CZ CE2 |
O31 O |
|||||||||
| 1pl2 | 1 | P08263 | 99.55 | 4e-162 |
X-RAY |
2004-06-22 | PHE | A:222 | A:222 | 129.0 | NA | -137.0 | 360.0 | 129.0 | NA | NA |
ABY HOH |
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CE2 CD2 |
C2' O |
|||
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ABY HOH |
4.453 3.847 |
CE1 CB |
C1' O |
||||||||||
| 2r3x | 1 | P08263 | 99.55 | 5e-162 |
X-RAY |
2007-12-18 | PHE | A:222 | A:222 | 148.0 | NA | -138.7 | 360.0 | 148.0 | NA | NA |
GTX HOH |
4.073 3.265 |
CZ O |
C5S O |
|||
| PHE | B:222 | B:222 | 138.0 | NA | -143.6 | 360.0 | 138.0 | NA | NA |
GTX HOH |
4.654 2.595 |
CZ O |
C4S O |
||||||||||
| 1gse | 1 | P08263 | 99.55 | 1e-161 |
X-RAY |
1995-09-15 | PHE | A:221 | A:222 | 111.0 | NA | -151.7 | 360.0 | 111.0 | NA | NA |
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CB2 CL2 O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 115.0 | NA | -165.1 | 360.0 | 115.0 | NA | NA |
GSH EAA HOH |
5.941 3.724 4.518 |
CE1 CD2 CB |
CB2 C9 O |
||||||||||
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X-RAY |
2011-01-12 | PHE | A:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3ktl | 1 | P08263 | 99.55 | 2e-161 |
X-RAY |
2009-12-22 | PHE | A:221 | A:222 | 135.0 | NA | -139.2 | 360.0 | 135.0 | NA | NA |
GTX HOH |
3.948 2.968 |
CZ OXT |
C5S O |
|||
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GTX HOH |
4.120 3.015 |
CE1 OXT |
C2S O |
||||||||||
| 1usb | 1 | P08263 | 99.55 | 2e-161 |
X-RAY |
2004-09-01 | PHE | A:225 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:225 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
2010-01-12 | PHE | A:222 | A:222 | 141.0 | NA | -130.3 | 360.0 | 141.0 | NA | NA |
GTX HOH |
3.981 3.481 |
CZ CE2 |
C6S O |
|||
| PHE | B:222 | B:222 | 137.0 | NA | -126.7 | 360.0 | 137.0 | NA | NA |
GTX HOH |
4.305 3.874 |
CE2 CE1 |
C2S O |
||||||||||
| 1xwg | 1 | P08263 | 99.55 | 4e-161 |
X-RAY |
2005-11-01 | PHE | A:221 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:221 | B:222 | 129.0 | 0.614 | -147.1 | 360.0 | 129.0 | 0.614 | 0.0 |
HOH |
8.061 |
CD1 |
O |
||||||||||
| 5jcu | 1 | P08263 | 99.55 | 1e-160 |
X-RAY |
2016-10-12 | PHE | A:221 | A:222 | 133.0 | NA | -134.4 | 360.0 | 133.0 | NA | NA |
GVX HOH |
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CE2 CD2 |
S22 O |
|||
| PHE | B:221 | B:222 | 128.0 | NA | -130.9 | 360.0 | 128.0 | NA | NA |
GVX HOH |
3.741 3.479 |
CZ CB |
C27 O |
||||||||||
| PHE | C:221 | C:222 | 133.0 | NA | -126.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PHE | D:221 | D:222 | 151.0 | NA | -113.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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X-RAY |
2008-10-28 | PHE | A:222 | A:222 | 141.0 | NA | -143.2 | 360.0 | 141.0 | NA | NA |
ASD HOH |
3.184 3.726 |
CE2 CD1 |
C7 O |
|||
| PHE | B:222 | B:222 | 134.0 | NA | -148.0 | 360.0 | 134.0 | NA | NA |
ASD HOH |
3.296 3.431 |
CE2 CD2 |
C7 O |
||||||||||
| PHE | C:222 | C:222 | 165.0 | NA | -115.9 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| 2wju | 1 | P09210 | 95.05 | 3e-154 |
X-RAY |
2009-06-09 | PHE | A:222 | A:222 | 173.0 | NA | -123.5 | 360.0 | 173.0 | NA | NA |
GSH HOH |
6.256 6.371 |
CD2 CB |
N3 O |
|||
| PHE | B:222 | B:222 | 141.0 | NA | -144.5 | 360.0 | 141.0 | NA | NA |
GSH HOH |
6.547 4.148 |
CD2 CD2 |
N3 O |
||||||||||
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| 1tdi | 1 | Q16772 | 90.54 | 6e-146 |
X-RAY |
2005-01-18 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PHE | B:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2vcv | 1 | Q16772 | 90.54 | 6e-146 |
X-RAY |
2008-10-28 | PHE | A:222 | A:222 | 118.0 | NA | -102.5 | 360.0 | 118.0 | NA | NA |
GSH ASD HOH |
6.558 3.814 7.523 |
CD2 CZ CE2 |
N3 C9 O |
|||
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GSH ASD HOH |
6.156 3.858 5.977 |
CD2 CD2 CE1 |
N3 C4 O |
||||||||||
| PHE | C:222 | C:222 | 121.0 | NA | -156.7 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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X-RAY |
2020-11-18 | PHE | A:222 | A:222 | 112.0 | NA | -125.5 | 360.0 | 112.0 | NA | NA |
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5.314 3.536 |
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N3 O |
|||
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X-RAY |
2020-11-18 | PHE | A:222 | B:222 | 102.0 | NA | -155.5 | 360.0 | 102.0 | NA | NA |
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CD2 CE2 CE1 CE1 |
N3 C01 C5 O |
|||
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GSH QLT MPD HOH |
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CB CZ CZ CB |
N3 C01 O4 O |
||||||||||
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2016-09-21 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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2016-09-21 | PHE | A:222 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
AlphaFold DB
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