Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 52656679 | . | C | A | CCDS4945.1:NM_145740.3:c.646Gca>Tca_NP_665683.1:p.216A>S | Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 1 (GSTA1), mRNA. |
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PDB
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3i6a | 1 | P08263 | 94.12 | 7e-152 |
X-RAY |
2009-09-01 | VAL | A:216 | A:216 | 15.0 | 0.097 | H | -52.3 | -39.9 | 15.0 | 0.097 | 0.0 |
GSH |
6.523 |
CG1 |
SG2 |
||
VAL | B:216 | B:216 | 15.0 | 0.097 | H | -57.5 | -50.6 | 15.0 | 0.097 | 0.0 |
GSH HOH |
6.350 4.393 |
CG1 CG2 |
SG2 O |
|||||||||
VAL | C:216 | C:216 | 17.0 | 0.11 | H | -65.7 | -37.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | D:216 | D:216 | 8.0 | 0.052 | H | -69.6 | -41.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | E:216 | E:216 | 11.0 | 0.071 | H | -69.8 | -46.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | F:216 | F:216 | 12.0 | 0.077 | H | -67.7 | -43.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | G:216 | G:216 | 8.0 | 0.052 | H | -67.2 | -42.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | H:216 | H:216 | 10.0 | 0.065 | H | -64.4 | -56.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3ik9 | 1 | P08263 | 94.12 | 7e-152 |
X-RAY |
2010-06-23 | VAL | A:216 | A:216 | 10.0 | 0.065 | H | -57.0 | -43.1 | 10.0 | 0.065 | 0.0 |
BOB |
4.260 |
CG1 |
C54 |
||
VAL | B:216 | B:216 | 13.0 | 0.084 | H | -71.4 | -46.1 | 13.0 | 0.084 | 0.0 |
BOB |
3.811 |
CG1 |
C45 |
|||||||||
VAL | C:216 | C:216 | 11.0 | 0.071 | H | -68.6 | -38.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | D:216 | D:216 | 10.0 | 0.065 | H | -74.5 | -29.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | E:216 | E:216 | 9.0 | 0.058 | H | -71.0 | -46.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
VAL | F:216 | F:216 | 30.0 | 0.194 | H | -67.3 | -30.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
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VAL | H:216 | H:216 | 8.0 | 0.052 | H | -62.1 | -55.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4acs | 1 | P09210 | 93.67 | 8e-150 |
X-RAY |
2011-12-28 | SER | A:216 | A:216 | 2.0 | 0.017 | H | -61.5 | -51.2 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
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O CB |
CB2 O |
||
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GSH HOH |
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O OG |
CB2 O |
|||||||||
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X-RAY |
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O N |
CB2 O |
||
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CB2 O |
|||||||||
2vcv | 1 | Q16772 | 90.54 | 6e-146 |
X-RAY |
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||
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O CB N |
N3 C15 O |
|||||||||
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X-RAY |
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||
6zjc | 1 | M9ZT87 | 80.18 | 2e-132 |
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||
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