Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 52849377 | . | A | C | CCDS4948.1:NM_001512.3:c.299cTg>cGg_NP_001503.1:p.100L>R | Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 4 (GSTA4), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1gul | 1 | O15217 | 100.0 | 2e-164 |
X-RAY |
1999-01-27 | LEU | A:100 | A:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.3 | -28.3 | 13.0 | 0.076 | 0.0 |
HOH |
4.410 |
CB |
O |
||
LEU | C:100 | B:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.4 | -28.2 | 13.0 | 0.076 | 0.0 |
HOH |
4.409 |
CB |
O |
|||||||||
LEU | E:100 | C:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.3 | -28.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | G:100 | D:100 | 12.0 | 0.071 | H | -57.2 | -28.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | I:100 | E:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.3 | -28.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | K:100 | F:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.2 | -28.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | M:100 | G:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.3 | -28.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | O:100 | H:100 | 12.0 | 0.071 | H | -57.3 | -28.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1gum | 1 | O15217 | 100.0 | 2e-164 |
X-RAY |
1999-01-27 | LEU | A:100 | A:100 | 10.0 | 0.059 | H | -54.3 | -33.6 | 10.0 | 0.059 | 0.0 |
HOH |
4.036 |
CB |
O |
||
LEU | B:100 | B:100 | 10.0 | 0.059 | H | -54.4 | -33.6 | 10.0 | 0.059 | 0.0 |
HOH |
4.036 |
CB |
O |
|||||||||
LEU | C:100 | C:100 | 11.0 | 0.065 | H | -54.4 | -33.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:100 | D:100 | 10.0 | 0.059 | H | -54.3 | -33.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | E:100 | E:100 | 12.0 | 0.071 | H | -54.4 | -33.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | F:100 | F:100 | 10.0 | 0.059 | H | -54.4 | -33.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | G:100 | G:100 | 10.0 | 0.059 | H | -54.3 | -33.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | H:100 | H:100 | 11.0 | 0.065 | H | -54.4 | -33.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3ik7 | 1 | O15217 | 100.0 | 2e-164 |
X-RAY |
2010-06-23 | LEU | A:100 | A:100 | 11.0 | 0.065 | H | -63.2 | -31.7 | 11.0 | 0.065 | 0.0 |
BOB BOB HOH |
7.886 7.529 2.820 |
CD1 C O |
O11 N1 O |
||
LEU | B:100 | B:100 | 10.0 | 0.059 | H | -66.6 | -29.4 | 10.0 | 0.059 | 0.0 |
BOB BOB HOH |
7.743 7.903 2.934 |
C CD1 O |
N1 O11 O |
|||||||||
LEU | C:100 | C:100 | 9.0 | 0.053 | H | -65.3 | -30.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:100 | D:100 | 13.0 | 0.076 | H | -57.4 | -36.0 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-o15217-f1 | 1 | O15217 | 100.0 | 8e-165 | LEU | A:100 | A:100 | 21.0 | 0.124 | H | -64.5 | -34.6 |