Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr8 | 11667244 | . | G | A | CCDS5985.1:NM_004462.3:c.266aGt>aAt_NP_004453.3:p.89S>N | Homo sapiens farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 (FDFT1), mRNA. |
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PDB
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O |
|||
SER | B:79 | B:89 | 63.0 | 0.548 | -57.0 | 158.5 | 63.0 | 0.548 | 0.0 |
HOH |
4.004 |
N |
O |
||||||||||
SER | C:79 | C:89 | 55.0 | 0.478 | -63.8 | 145.4 | 55.0 | 0.478 | 0.0 |
HOH |
3.903 |
CA |
O |
||||||||||
SER | D:79 | D:89 | 79.0 | 0.687 | -54.3 | 129.1 | 79.0 | 0.687 | 0.0 |
HOH |
6.856 |
O |
O |
||||||||||
SER | E:79 | E:89 | 50.0 | 0.435 | -69.9 | 155.3 | 50.0 | 0.435 | 0.0 |
HOH |
9.757 |
OG |
O |
||||||||||
SER | F:79 | F:89 | 45.0 | 0.391 | -102.8 | 153.4 | 45.0 | 0.391 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p37268-f1 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 | SER | A:89 | A:89 | 61.0 | 0.53 | -63.1 | 151.0 |