Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr8 | 11695928 | . | C | A | CCDS5985.1:NM_004462.3:c.1064tCt>tAt_NP_004453.3:p.355S>Y | Homo sapiens farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 (FDFT1), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3asx | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:325 | A:355 | 3.0 | 0.026 | T | -102.6 | 7.4 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
2.606 |
OG |
O |
||
3lee | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-12-08 | SER | A:325 | A:355 | 1.0 | 0.009 | T | -122.3 | 36.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
4.774 |
CB |
O |
||
SER | B:325 | B:355 | 16.0 | 0.139 | T | -116.5 | 35.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:325 | C:355 | 17.0 | 0.148 | T | -103.6 | -3.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:325 | D:355 | 12.0 | 0.104 | T | -88.3 | 34.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:325 | E:355 | 1.0 | 0.009 | T | -111.2 | 6.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:325 | F:355 | 52.0 | 0.452 | T | -110.6 | 18.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3q2z | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:325 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -98.9 | 1.8 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.594 |
OG |
O |
||
3q30 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:325 | A:355 | 4.0 | 0.035 | T | -109.0 | 8.2 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.710 |
OG |
O |
||
3v66 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-12-19 | SER | A:325 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -99.5 | 8.2 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.719 |
OG |
O |
||
3vj8 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:328 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -99.3 | 3.2 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.670 |
OG |
O |
||
3vj9 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:328 | A:355 | 14.0 | 0.122 | T | -96.6 | 3.7 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.630 |
OG |
O |
||
3vja | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:328 | A:355 | 16.0 | 0.139 | T | -96.5 | 6.3 | 16.0 | 0.139 | 0.0 |
HOH |
2.716 |
OG |
O |
||
SER | B:328 | B:355 | 14.0 | 0.122 | T | -91.9 | -2.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3vjb | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:328 | A:355 | 15.0 | 0.13 | T | -99.2 | 4.7 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
2.686 |
OG |
O |
||
SER | B:328 | B:355 | 4.0 | 0.035 | T | -92.0 | 3.5 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.512 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:328 | C:355 | 14.0 | 0.122 | T | -105.5 | 4.2 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.818 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:328 | D:355 | 3.0 | 0.026 | T | -113.2 | 10.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:328 | E:355 | 13.0 | 0.113 | T | -102.0 | 2.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:328 | F:355 | 11.0 | 0.096 | T | -111.6 | -14.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3vjc | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:328 | A:355 | 7.0 | 0.061 | T | -97.7 | 5.6 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
HOH |
2.662 |
OG |
O |
||
SER | B:328 | B:355 | 6.0 | 0.052 | T | -95.1 | 4.9 | 6.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
2.802 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:328 | C:355 | 4.0 | 0.035 | T | -97.1 | 2.8 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.642 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:328 | D:355 | 2.0 | 0.017 | T | -104.3 | 3.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:328 | E:355 | 13.0 | 0.113 | T | -98.0 | -1.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:328 | F:355 | 2.0 | 0.017 | T | -92.4 | 2.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3wef | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 5.0 | 0.043 | T | -100.7 | 9.3 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.822 |
OG |
O |
||
SER | B:328 | B:355 | 5.0 | 0.043 | T | -96.4 | 8.1 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
9.025 |
C |
O |
|||||||||
SER | C:328 | C:355 | 3.0 | 0.026 | T | -104.4 | -0.1 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
3.551 |
CB |
O |
|||||||||
SER | D:328 | D:355 | 2.0 | 0.017 | T | -105.0 | 7.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:328 | E:355 | 22.0 | 0.191 | T | -151.1 | -4.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:328 | F:355 | 15.0 | 0.13 | T | -107.0 | 5.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3weg | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 13.0 | 0.113 | T | -97.9 | 3.7 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
2.743 |
OG |
O |
||
3weh | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 10.0 | 0.087 | T | -101.7 | 4.1 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
2.570 |
OG |
O |
||
3wek | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 15.0 | 0.13 | T | -102.0 | 7.9 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
2.315 |
OG |
O |
||
3wei | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 12.0 | 0.104 | T | -98.8 | 1.2 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.658 |
OG |
O |
||
3wej | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:328 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -95.3 | -1.9 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.878 |
OG |
O |
||
1ezf | 1 | P37268 | 99.12 | 0.0 |
X-RAY |
2000-10-18 | SER | A:325 | A:355 | 0.0 | 0.0 | T | -102.4 | 0.9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
2.807 |
OG |
O |
||
SER | B:325 | B:355 | 0.0 | 0.0 | T | -103.0 | -13.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:325 | C:355 | 5.0 | 0.043 | T | -106.6 | 1.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3wc9 | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 5.0 | 0.043 | T | -110.2 | 11.4 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
5.259 |
CB |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 1.0 | 0.009 | T | -117.6 | 8.0 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
6.390 |
CB |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 4.0 | 0.035 | T | -93.6 | 14.4 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
5.266 |
CB |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 1.0 | 0.009 | T | -95.4 | -11.5 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
9.598 |
CB |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 0.0 | 0.0 | T | -102.0 | 6.9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
8.850 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 0.0 | 0.0 | T | -104.7 | -4.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.964 |
OG |
O |
|||||||||
3wcd | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 9.0 | 0.078 | T | -113.8 | 14.6 | 9.0 | 0.078 | 0.0 |
HOH |
3.720 |
C |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 3.0 | 0.026 | T | -107.7 | 4.6 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
9.150 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 7.0 | 0.061 | T | -98.8 | -10.5 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
HOH |
5.862 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 2.0 | 0.017 | S | -90.2 | -7.8 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
9.829 |
O |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 1.0 | 0.009 | T | -97.9 | -8.0 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
5.824 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 1.0 | 0.009 | T | -73.1 | -0.5 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
5.567 |
N |
O |
|||||||||
3wcf | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -111.3 | 3.3 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.675 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 3.0 | 0.026 | T | -102.2 | -13.4 | 3.0 | 0.026 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:345 | C:355 | 2.0 | 0.017 | T | -106.9 | -4.0 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.575 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 1.0 | 0.009 | T | -94.6 | -12.8 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
4.779 |
OG |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 2.0 | 0.017 | T | -108.5 | 2.6 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
5.005 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 1.0 | 0.009 | S | -113.3 | -16.4 | 1.0 | 0.009 | 0.0 | |||||||||||||
3wch | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 1.0 | 0.009 | T | -121.5 | 0.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
2.903 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 1.0 | 0.009 | T | -110.3 | -16.5 | 1.0 | 0.009 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:345 | C:355 | 2.0 | 0.017 | T | -98.4 | -5.1 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
5.573 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 0.0 | 0.0 | T | -98.6 | 10.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |||||||||||||
SER | E:345 | E:355 | 0.0 | 0.0 | T | -118.9 | 3.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
5.347 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 5.0 | 0.043 | T | -98.9 | -19.6 | 5.0 | 0.043 | 0.0 | |||||||||||||
3wci | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 5.0 | 0.043 | T | -107.4 | 7.0 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.918 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 2.0 | 0.017 | T | -113.3 | -6.8 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
4.106 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 3.0 | 0.026 | T | -108.9 | -3.4 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
2.669 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 1.0 | 0.009 | T | -91.2 | -7.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
3.843 |
CB |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 2.0 | 0.017 | T | -104.4 | 0.3 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
4.683 |
C |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 1.0 | 0.009 | T | -120.0 | -4.6 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
8.627 |
N |
O |
|||||||||
3wcj | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 4.0 | 0.035 | T | -102.0 | -1.0 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.801 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 2.0 | 0.017 | T | -103.5 | -11.7 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
5.078 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 4.0 | 0.035 | T | -105.6 | 7.3 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.630 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 1.0 | 0.009 | T | -103.4 | -3.3 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
9.063 |
C |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 2.0 | 0.017 | T | -106.7 | -1.4 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.771 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 0.0 | 0.0 | S | -101.4 | -28.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
6.987 |
O |
O |
|||||||||
3wcl | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 2.0 | 0.017 | T | -106.1 | 7.8 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
2.719 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 2.0 | 0.017 | T | -101.1 | -14.1 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
3.685 |
CB |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 4.0 | 0.035 | T | -95.6 | -2.0 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.584 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 0.0 | 0.0 | T | -96.2 | 0.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
3.469 |
C |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 6.0 | 0.052 | T | -105.6 | 2.2 | 6.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
2.610 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 1.0 | 0.009 | T | -116.8 | -8.6 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
4.892 |
OG |
O |
|||||||||
3wcm | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:345 | A:355 | 4.0 | 0.035 | T | -105.9 | -3.5 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.676 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 2.0 | 0.017 | T | -105.3 | -0.6 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
HOH |
3.539 |
CB |
O |
|||||||||
SER | C:345 | C:355 | 4.0 | 0.035 | T | -100.7 | 1.6 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.799 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 1.0 | 0.009 | T | -104.8 | -2.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
7.028 |
OG |
O |
|||||||||
SER | E:345 | E:355 | 1.0 | 0.009 | T | -110.8 | 1.0 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
2.810 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:345 | F:355 | 0.0 | 0.0 | T | -109.2 | -15.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
HOH |
3.725 |
CB |
O |
|||||||||
3wsa | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-01 | SER | A:345 | A:355 | 8.0 | 0.07 | T | -126.3 | -5.4 | 8.0 | 0.07 | 0.0 |
HOH |
4.287 |
OG |
O |
||
SER | B:345 | B:355 | 2.0 | 0.017 | T | -100.6 | -12.8 | 2.0 | 0.017 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:345 | C:355 | 1.0 | 0.009 | T | -92.1 | -14.6 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
8.484 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:345 | D:355 | 0.0 | 0.0 | T | -87.4 | -7.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | |||||||||||||
SER | E:345 | E:355 | 1.0 | 0.009 | T | -104.6 | 18.5 | 1.0 | 0.009 | 0.0 | |||||||||||||
SER | F:345 | F:355 | 1.0 | 0.009 | T | -123.7 | -7.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p37268-f1 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 | SER | A:355 | A:355 | 9.0 | 0.078 | T | -87.7 | -10.0 |