Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr8 | 11695931 | . | C | A | CCDS5985.1:NM_004462.3:c.1067tCt>tAt_NP_004453.3:p.356S>Y | Homo sapiens farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 (FDFT1), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3asx | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:326 | A:356 | 17.0 | 0.148 | H | -56.2 | -45.5 | 17.0 | 0.148 | 0.0 |
HOH |
2.934 |
OG |
O |
||
3lee | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-12-08 | SER | A:326 | A:356 | 11.0 | 0.096 | H | -68.7 | -49.0 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
7.309 |
N |
O |
||
SER | B:326 | B:356 | 8.0 | 0.07 | H | -78.6 | -40.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:326 | C:356 | 17.0 | 0.148 | H | -36.7 | -57.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:326 | D:356 | 10.0 | 0.087 | H | -71.0 | -50.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:326 | E:356 | 13.0 | 0.113 | H | -34.1 | -49.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:326 | F:356 | 22.0 | 0.191 | H | -64.3 | -65.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3q2z | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:326 | A:356 | 15.0 | 0.13 | H | -53.4 | -48.7 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
3.607 |
CA |
O |
||
3q30 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-21 | SER | A:326 | A:356 | 16.0 | 0.139 | H | -64.5 | -37.0 | 16.0 | 0.139 | 0.0 |
HOH |
3.172 |
OG |
O |
||
3v66 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-12-19 | SER | A:326 | A:356 | 20.0 | 0.174 | H | -53.4 | -49.0 | 20.0 | 0.174 | 0.0 |
HOH |
2.546 |
OG |
O |
||
3vj8 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:329 | A:356 | 17.0 | 0.148 | H | -51.8 | -46.2 | 17.0 | 0.148 | 0.0 |
HOH |
3.114 |
OG |
O |
||
3vj9 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:329 | A:356 | 14.0 | 0.122 | H | -53.6 | -47.7 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.914 |
OG |
O |
||
3vja | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:329 | A:356 | 12.0 | 0.104 | H | -53.2 | -44.6 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.814 |
OG |
O |
||
SER | B:329 | B:356 | 12.0 | 0.104 | H | -55.5 | -44.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3vjb | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:329 | A:356 | 12.0 | 0.104 | H | -54.8 | -45.8 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.750 |
OG |
O |
||
SER | B:329 | B:356 | 11.0 | 0.096 | H | -59.7 | -39.0 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
2.332 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:329 | C:356 | 11.0 | 0.096 | H | -57.0 | -42.3 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
3.403 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:329 | D:356 | 15.0 | 0.13 | H | -53.2 | -44.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:329 | E:356 | 18.0 | 0.157 | H | -46.6 | -52.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:329 | F:356 | 14.0 | 0.122 | H | -38.1 | -50.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3vjc | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-11 | SER | A:329 | A:356 | 16.0 | 0.139 | H | -55.2 | -46.9 | 16.0 | 0.139 | 0.0 |
HOH |
2.998 |
OG |
O |
||
SER | B:329 | B:356 | 12.0 | 0.104 | H | -52.6 | -46.2 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.523 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:329 | C:356 | 14.0 | 0.122 | H | -57.9 | -44.3 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.927 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:329 | D:356 | 14.0 | 0.122 | H | -48.7 | -45.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:329 | E:356 | 15.0 | 0.13 | H | -43.7 | -47.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:329 | F:356 | 13.0 | 0.113 | H | -49.0 | -40.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3wef | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 15.0 | 0.13 | H | -54.4 | -52.5 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
3.755 |
N |
O |
||
SER | B:329 | B:356 | 11.0 | 0.096 | H | -62.6 | -45.2 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
5.525 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:329 | C:356 | 8.0 | 0.07 | H | -37.7 | -49.6 | 8.0 | 0.07 | 0.0 |
HOH |
3.702 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:329 | D:356 | 15.0 | 0.13 | H | -52.7 | -49.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:329 | E:356 | 12.0 | 0.104 | H | -42.2 | -43.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:329 | F:356 | 7.0 | 0.061 | H | -38.1 | -50.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3weg | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 11.0 | 0.096 | H | -55.3 | -43.0 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
2.843 |
OG |
O |
||
3weh | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -56.1 | -44.1 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
3.673 |
N |
O |
||
3wek | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -54.6 | -42.6 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
2.729 |
OG |
O |
||
3wei | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -53.1 | -45.6 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
2.966 |
OG |
O |
||
3wej | 1 | P37268 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-12 | SER | A:329 | A:356 | 19.0 | 0.165 | H | -50.2 | -48.7 | 19.0 | 0.165 | 0.0 |
HOH |
3.085 |
OG |
O |
||
1ezf | 1 | P37268 | 99.12 | 0.0 |
X-RAY |
2000-10-18 | SER | A:326 | A:356 | 3.0 | 0.026 | H | -36.9 | -54.0 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
3.842 |
N |
O |
||
SER | B:326 | B:356 | 15.0 | 0.13 | H | -31.0 | -40.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:326 | C:356 | 15.0 | 0.13 | H | -44.5 | -47.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3wc9 | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 10.0 | 0.087 | H | -41.7 | -66.3 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
3.154 |
CB |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 12.0 | 0.104 | H | -49.9 | -34.0 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
5.196 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 10.0 | 0.087 | H | -48.8 | -44.4 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
7.232 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 15.0 | 0.13 | H | -35.6 | -42.7 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
8.257 |
O |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 19.0 | 0.165 | H | -32.8 | -57.3 | 19.0 | 0.165 | 0.0 |
HOH |
9.486 |
N |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 10.0 | 0.087 | T | -58.9 | -166.6 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
8.689 |
OG |
O |
|||||||||
3wcd | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 12.0 | 0.104 | H | -48.2 | -44.9 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
3.889 |
N |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 13.0 | 0.113 | H | -46.4 | -37.7 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
7.511 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 10.0 | 0.087 | H | -31.3 | -44.3 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
7.165 |
O |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 11.0 | 0.096 | H | -40.3 | -30.1 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
6.706 |
O |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 13.0 | 0.113 | H | -39.5 | -37.8 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
7.648 |
O |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 13.0 | 0.113 | T | -61.8 | -175.5 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
3.437 |
OG |
O |
|||||||||
3wcf | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -44.2 | -52.4 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
3.777 |
N |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 16.0 | 0.139 | H | -30.8 | -48.2 | 16.0 | 0.139 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:346 | C:356 | 10.0 | 0.087 | H | -43.5 | -49.6 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
5.293 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 15.0 | 0.13 | H | -32.5 | -52.9 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
8.236 |
N |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 13.0 | 0.113 | H | -37.1 | -48.5 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
5.965 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 12.0 | 0.104 | H | -28.5 | -57.7 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
8.976 |
O |
O |
|||||||||
3wch | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 12.0 | 0.104 | H | -44.2 | -46.6 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
6.715 |
N |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 13.0 | 0.113 | H | -30.6 | -47.5 | 13.0 | 0.113 | 0.0 | |||||||||||||
SER | C:346 | C:356 | 10.0 | 0.087 | H | -40.5 | -45.2 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
9.026 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 13.0 | 0.113 | H | -48.4 | -45.1 | 13.0 | 0.113 | 0.0 | |||||||||||||
SER | E:346 | E:356 | 12.0 | 0.104 | H | -47.3 | -45.4 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
7.844 |
O |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 16.0 | 0.139 | H | -29.3 | -52.3 | 16.0 | 0.139 | 0.0 |
HOH |
8.250 |
O |
O |
|||||||||
3wci | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -43.7 | -47.5 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
2.687 |
OG |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 15.0 | 0.13 | H | -39.7 | -33.0 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
3.017 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 10.0 | 0.087 | H | -41.2 | -47.3 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
3.552 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 14.0 | 0.122 | H | -42.2 | -38.7 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
4.074 |
N |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 12.0 | 0.104 | H | -46.5 | -38.4 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.771 |
OG |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 10.0 | 0.087 | H | -39.3 | -51.6 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
9.235 |
O |
O |
|||||||||
3wcj | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 14.0 | 0.122 | H | -38.8 | -52.6 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.598 |
OG |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 11.0 | 0.096 | H | -31.1 | -47.9 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
7.725 |
O |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 7.0 | 0.061 | H | -45.9 | -49.2 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
HOH |
3.860 |
N |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 14.0 | 0.122 | H | -37.3 | -49.1 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
5.292 |
OG |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 15.0 | 0.13 | H | -41.9 | -49.2 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
5.411 |
N |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 7.0 | 0.061 | H | -30.0 | -57.5 | 7.0 | 0.061 | 0.0 |
HOH |
4.699 |
O |
O |
|||||||||
3wcl | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 15.0 | 0.13 | H | -47.2 | -50.3 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
2.756 |
OG |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 12.0 | 0.104 | H | -30.9 | -46.0 | 12.0 | 0.104 | 0.0 |
HOH |
2.593 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 11.0 | 0.096 | H | -38.8 | -55.1 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
3.718 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 14.0 | 0.122 | H | -51.2 | -42.6 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
3.580 |
N |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 14.0 | 0.122 | H | -38.9 | -54.3 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
3.707 |
N |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 11.0 | 0.096 | H | -35.9 | -50.7 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
4.954 |
O |
O |
|||||||||
3wcm | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2014-06-18 | SER | A:346 | A:356 | 14.0 | 0.122 | H | -38.3 | -53.1 | 14.0 | 0.122 | 0.0 |
HOH |
2.773 |
OG |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 19.0 | 0.165 | H | -37.7 | -63.0 | 19.0 | 0.165 | 0.0 |
HOH |
3.586 |
N |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 8.0 | 0.07 | H | -44.0 | -51.1 | 8.0 | 0.07 | 0.0 |
HOH |
2.590 |
OG |
O |
|||||||||
SER | D:346 | D:356 | 18.0 | 0.157 | H | -33.9 | -54.5 | 18.0 | 0.157 | 0.0 |
HOH |
4.901 |
C |
O |
|||||||||
SER | E:346 | E:356 | 13.0 | 0.113 | H | -41.7 | -52.0 | 13.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
3.992 |
N |
O |
|||||||||
SER | F:346 | F:356 | 15.0 | 0.13 | H | -29.1 | -52.7 | 15.0 | 0.13 | 0.0 |
HOH |
3.868 |
N |
O |
|||||||||
3wsa | 1 | P37268 | 98.82 | 0.0 |
X-RAY |
2015-04-01 | SER | A:346 | A:356 | 8.0 | 0.07 | H | -41.4 | -46.5 | 8.0 | 0.07 | 0.0 |
HOH |
6.860 |
O |
O |
||
SER | B:346 | B:356 | 10.0 | 0.087 | H | -28.3 | -74.8 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
HOH |
8.237 |
OG |
O |
|||||||||
SER | C:346 | C:356 | 9.0 | 0.078 | H | -35.0 | -50.8 | 9.0 | 0.078 | 0.0 | |||||||||||||
SER | D:346 | D:356 | 14.0 | 0.122 | H | -38.7 | -46.4 | 14.0 | 0.122 | 0.0 | |||||||||||||
SER | E:346 | E:356 | 11.0 | 0.096 | H | -68.4 | -42.1 | 11.0 | 0.096 | 0.0 | |||||||||||||
SER | F:346 | F:356 | 17.0 | 0.148 | H | -40.9 | -48.8 | 17.0 | 0.148 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p37268-f1 | 1 | P37268 | 100.0 | 0.0 | SER | A:356 | A:356 | 13.0 | 0.113 | H | -46.8 | -49.1 |