Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr9 | 21187439 | . | C | A | CCDS6498.1:NM_021068.2:c.92aGc>aTc_NP_066546.1:p.31S>I | Homo sapiens interferon alpha 4 (IFNA4), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 3ux9 | 1 | P01562 | 81.07 | 1e-100 |
X-RAY |
2012-02-29 | SER | A:11 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | C:11 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2lms | 1 | P01563 | 82.53 | 1e-99 |
NMR |
2012-12-05 | SER | A:9 | A:8 | 17.0 | 0.148 | T | -85.8 | -65.3 | 17.0 | 0.148 | 0.0 | ||||||
| 2lag | 2 | P01563 | 82.53 | 2e-99 |
NMR |
2011-08-17 | SER | B:8 | A:8 | 74.0 | 0.643 | -149.8 | 130.0 | 70.0 | 0.609 | 0.034 |
A:P48551:0.035 |
||||||
| 4z5r | 1 | P01563 | 82.53 | 2e-99 |
X-RAY |
2015-07-08 | SER | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | D:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | G:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | J:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | M:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | P:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | S:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | V:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6jhd | 1 | P32881 | 83.13 | 5e-99 |
NMR |
2020-02-19 | SER | A:8 | A:8 | 84.0 | 0.73 | -121.9 | 161.7 | 84.0 | 0.73 | 0.0 | |||||||
| 3se3 | 2 | Q86UP4 | 81.33 | 9e-98 |
X-RAY |
2011-08-31 | SER | B:9 | B:8 | 122.0 | NA | 360.0 | -111.3 | 120.0 | NA | NA |
C:P48551:NA |
||||||
| 4ypg | 3 | P01563 | 83.23 | 1e-97 |
X-RAY |
2015-05-06 | SER | C:10 | C:8 | 11.0 | 0.096 | T | -84.6 | 0.9 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
NI HOH |
8.748 3.168 |
N OG |
NI O |
||
| SER | D:10 | D:8 | 1.0 | 0.009 | H | -80.6 | -21.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3s9d | 1 | P01563 | 81.33 | 4e-97 |
X-RAY |
2011-08-31 | SER | A:11 | A:8 | 109.0 | NA | 360.0 | -113.2 | 109.0 | NA | NA |
HOH |
4.915 |
N |
O |
|||
| SER | C:11 | C:8 | 110.0 | 0.957 | 360.0 | 134.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p05014-f1 | 1 | P05014 | 100.0 | 1e-141 | SER | A:31 | A:31 | 33.0 | 0.287 | H | -70.1 | -32.2 | |
| af-p01571-f1 | 1 | P01571 | 95.77 | 9e-135 | SER | A:31 | A:31 | 26.0 | 0.226 | H | -61.9 | -29.9 | |
| af-p01566-f1 | 1 | P01566 | 95.77 | 1e-134 | SER | A:31 | A:31 | 23.0 | 0.2 | H | -67.1 | -31.8 | |
| af-p01567-f1 | 1 | P01567 | 93.65 | 6e-130 | SER | A:31 | A:31 | 75.0 | 0.652 | H | -69.3 | -37.1 | |
| af-p01568-f1 | 1 | P01568 | 92.06 | 9e-129 | SER | A:31 | A:31 | 38.0 | 0.33 | H | -61.3 | -34.2 | |
| af-p05015-f1 | 1 | P05015 | 88.89 | 1e-125 | SER | A:31 | A:31 | 32.0 | 0.278 | H | -65.4 | -31.7 | |
| af-p01569-f1 | 1 | P01569 | 83.6 | 4e-120 | SER | A:31 | A:31 | 31.0 | 0.27 | H | -66.5 | -36.6 | |
| af-p01570-f1 | 1 | P01570 | 84.13 | 2e-119 | SER | A:31 | A:31 | 38.0 | 0.33 | H | -70.9 | -29.3 | |
| af-p05013-f1 | 1 | P05013 | 81.48 | 3e-112 | SER | A:31 | A:31 | 24.0 | 0.209 | H | -70.9 | -29.2 | |
| af-p32881-f1 | 1 | P32881 | 81.48 | 3e-111 | SER | A:31 | A:31 | 27.0 | 0.235 | H | -70.0 | -24.8 | |
| af-p01563-f1 | 1 | P01563 | 80.95 | 3e-106 | SER | A:31 | A:31 | 33.0 | 0.287 | H | -68.9 | -36.1 | |