Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr9 | 21367865 | . | A | C | CCDS6505.2:NM_006900.3:c.145Tct>Gct_NP_008831.3:p.49S>A | Homo sapiens interferon alpha 13 (IFNA13), mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 3ux9 | 1 | P01562 | 98.82 | 3e-124 |
X-RAY |
2012-02-29 | SER | A:28 | A:25 | 57.0 | 0.496 | -90.1 | 130.8 | 45.0 | 0.391 | 0.105 |
B:None:0.104 |
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| SER | C:28 | C:25 | 57.0 | 0.496 | -88.3 | 132.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2lag | 2 | P01563 | 82.53 | 1e-96 |
NMR |
2011-08-17 | SER | B:25 | A:25 | 70.0 | 0.609 | -88.3 | 150.0 | 13.0 | 0.113 | 0.496 |
A:P48551:0.496 |
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| 4z5r | 1 | P01563 | 82.53 | 1e-96 |
X-RAY |
2015-07-08 | SER | A:25 | D:25 | 49.0 | 0.426 | -80.1 | 139.9 | 43.0 | 0.374 | 0.052 |
B:None:0.052 |
||||||
| SER | D:25 | E:25 | 48.0 | 0.417 | -80.1 | 140.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | G:25 | F:25 | 49.0 | 0.426 | -80.6 | 140.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | J:25 | G:25 | 48.0 | 0.417 | -79.9 | 140.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | M:25 | H:25 | 48.0 | 0.417 | -81.3 | 142.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | P:25 | I:25 | 48.0 | 0.417 | -81.0 | 141.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | S:25 | X:25 | 48.0 | 0.417 | -79.4 | 141.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | V:25 | N:25 | 48.0 | 0.417 | -80.6 | 141.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2lms | 1 | P01563 | 82.53 | 1e-96 |
NMR |
2012-12-05 | SER | A:26 | A:25 | 68.0 | 0.591 | -103.8 | 123.8 | 68.0 | 0.591 | 0.0 | |||||||
| 3se3 | 2 | Q86UP4 | 81.33 | 1e-94 |
X-RAY |
2011-08-31 | SER | B:26 | B:25 | 56.0 | 0.487 | -60.3 | 133.5 | 39.0 | 0.339 | 0.148 |
C:P48551:0.148 |
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| 4ypg | 3 | P01563 | 82.61 | 4e-94 |
X-RAY |
2015-05-06 | SER | C:27 | C:25 | 49.0 | 0.426 | -66.5 | -176.6 | 49.0 | 0.426 | 0.0 | |||||||
| SER | D:27 | D:25 | 51.0 | 0.443 | -76.1 | 138.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3s9d | 1 | P01563 | 81.33 | 1e-93 |
X-RAY |
2011-08-31 | SER | A:28 | A:25 | 62.0 | 0.539 | -64.0 | 131.5 | 44.0 | 0.383 | 0.156 |
B:P48551:0.157 |
HOH |
2.638 |
OG |
O |
||
| SER | C:28 | C:25 | 62.0 | 0.539 | -47.8 | 140.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p01562-f1 | 1 | P01562 | 99.47 | 7e-141 | SER | A:48 | A:48 | 66.0 | 0.574 | -73.2 | 128.6 | ||
| af-p01569-f1 | 1 | P01569 | 84.66 | 3e-119 | SER | A:48 | A:48 | 57.0 | 0.496 | -65.1 | 129.9 | ||
| af-p01570-f1 | 1 | P01570 | 82.54 | 2e-115 | SER | A:48 | A:48 | 56.0 | 0.487 | -67.6 | 130.2 | ||
| af-p05013-f1 | 1 | P05013 | 85.19 | 2e-115 | SER | A:48 | A:48 | 55.0 | 0.478 | -67.4 | 134.5 | ||
| af-p01568-f1 | 1 | P01568 | 81.48 | 2e-112 | SER | A:48 | A:48 | 58.0 | 0.504 | -63.3 | 129.0 | ||
| af-p05014-f1 | 1 | P05014 | 80.42 | 6e-112 | SER | A:48 | A:48 | 66.0 | 0.574 | -64.4 | 130.9 | ||
| af-p01563-f1 | 1 | P01563 | 82.01 | 3e-104 | SER | A:48 | A:48 | 56.0 | 0.487 | -67.9 | 134.8 | ||