Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr9 | 131857788 | . | G | A | CCDS6919.1:NM_000755.3:c.1769tCg>tTg_NP_000746.2:p.590S>L | Homo sapiens carnitine O-acetyltransferase (CRAT), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1nm8 | 1 | P43155 | 98.35 | 0.0 |
X-RAY |
2003-03-11 | SER | A:569 | A:569 | 1.0 | 0.009 | E | -125.5 | 156.9 | 1.0 | 0.009 | 0.0 |
HOH |
3.933 |
OG |
O |
||
1s5o | 1 | P43155 | 98.35 | 0.0 |
X-RAY |
2004-02-03 | SER | A:569 | A:569 | 2.0 | 0.017 | E | -124.6 | 153.5 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
152 HOH |
8.752 4.012 |
OG OG |
C5A O |
||
1ndb | 1 | P47934 | 91.28 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-28 | SER | A:561 | A:590 | 3.0 | 0.026 | E | -119.6 | 156.7 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
3.948 |
OG |
O |
||
SER | B:561 | B:590 | 4.0 | 0.035 | E | -120.1 | 153.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ndf | 1 | P47934 | 91.28 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-28 | SER | A:561 | A:590 | 4.0 | 0.035 | E | -119.6 | 152.3 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
152 HOH |
9.024 3.911 |
OG OG |
C5B O |
||
SER | B:561 | B:590 | 3.0 | 0.026 | E | -123.4 | 155.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ndi | 1 | P47934 | 91.28 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-28 | SER | A:561 | A:590 | 4.0 | 0.035 | E | -117.4 | 159.1 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
4.146 |
OG |
O |
||
SER | B:561 | B:590 | 5.0 | 0.043 | E | -118.5 | 152.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2h3p | 1 | Q3V1Y3 | 91.28 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-01 | SER | A:564 | A:590 | 3.0 | 0.026 | E | -119.6 | 157.2 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
152 HOH |
8.640 3.899 |
OG OG |
C5B O |
||
SER | B:564 | B:590 | 4.0 | 0.035 | E | -124.4 | 155.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2h3u | 1 | Q3V1Y3 | 91.28 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-01 | SER | A:564 | A:590 | 3.0 | 0.026 | E | -118.1 | 156.8 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
152 HOH |
8.792 3.979 |
OG OG |
C5B O |
||
SER | B:564 | B:590 | 4.0 | 0.035 | E | -118.1 | 159.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1t7q | 1 | P47934 | 91.12 | 0.0 |
X-RAY |
2004-06-22 | SER | A:582 | A:590 | 4.0 | 0.035 | E | -123.3 | 155.8 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
152 HOH |
8.993 3.900 |
OG OG |
C5B O |
||
SER | B:582 | B:590 | 3.0 | 0.026 | E | -120.3 | 153.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1t7n | 1 | P47934 | 91.12 | 0.0 |
X-RAY |
2004-06-22 | SER | A:582 | A:590 | 3.0 | 0.026 | E | -119.3 | 154.8 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
HOH |
3.763 |
OG |
O |
||
1t7o | 1 | P47934 | 91.12 | 0.0 |
X-RAY |
2004-06-22 | SER | A:582 | A:590 | 2.0 | 0.017 | E | -127.0 | 149.3 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
152 HOH |
8.955 3.682 |
OG OG |
C5B O |
||
2h3w | 1 | Q3V1Y3 | 90.94 | 0.0 |
X-RAY |
2006-08-01 | SER | A:564 | A:590 | 4.0 | 0.035 | E | -118.3 | 156.3 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HC5 HOH |
8.629 4.033 |
OG OG |
CAJ O |
||
SER | B:564 | B:590 | 5.0 | 0.043 | E | -119.4 | 156.9 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p43155-f1 | 1 | P43155 | 99.84 | 0.0 | SER | A:590 | A:590 | 0.0 | 0.0 | E | -123.7 | 151.9 |