Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr9 131860574 . T A CCDS6919.1:NM_000755.3:c.1282Agc>Tgc_NP_000746.2:p.428S>C Homo sapiens carnitine O-acetyltransferase (CRAT), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1nm8 1 P43155 98.35 0.0 X-RAY
 2003-03-11 SER A:407 A:407 28.0 0.243 -66.5 123.8 28.0 0.243 0.0 HOH
 2.578
 OG
 O
1s5o 1 P43155 98.35 0.0 X-RAY
 2004-02-03 SER A:407 A:407 37.0 0.322 -60.3 122.7 37.0 0.322 0.0 HOH
 2.592
 OG
 O
1ndb 1 P47934 91.28 0.0 X-RAY
 2003-01-28 SER A:399 A:428 41.0 0.357 -60.5 124.0 41.0 0.357 0.0 HOH
 2.624
 OG
 O
SER B:399 B:428 35.0 0.304 -67.0 124.0 NA NA NA
1ndf 1 P47934 91.28 0.0 X-RAY
 2003-01-28 SER A:399 A:428 37.0 0.322 -63.9 123.2 37.0 0.322 0.0 HOH
 2.523
 OG
 O
SER B:399 B:428 32.0 0.278 -66.3 124.7 NA NA NA
1ndi 1 P47934 91.28 0.0 X-RAY
 2003-01-28 SER A:399 A:428 34.0 0.296 -64.0 129.1 34.0 0.296 0.0 COA
HOH
 2.989
2.552
 OG
OG
 O1A
O
SER B:399 B:428 23.0 0.2 -58.6 126.3 NA NA NA
2h3p 1 Q3V1Y3 91.28 0.0 X-RAY
 2006-08-01 SER A:402 A:428 20.0 0.174 -67.7 123.1 20.0 0.174 0.0 COA
HOH
 2.680
2.775
 OG
N
 O2A
O
SER B:402 B:428 19.0 0.165 -64.3 122.7 NA NA NA
2h3u 1 Q3V1Y3 91.28 0.0 X-RAY
 2006-08-01 SER A:402 A:428 21.0 0.183 -67.5 124.2 21.0 0.183 0.0 COA
HOH
 2.631
2.982
 OG
OG
 O2A
O
SER B:402 B:428 23.0 0.2 -64.2 125.6 NA NA NA
1t7q 1 P47934 91.12 0.0 X-RAY
 2004-06-22 SER A:420 A:428 21.0 0.183 -66.6 123.5 21.0 0.183 0.0 COA
HOH
 2.948
2.797
 OG
OG
 O1A
O
SER B:420 B:428 21.0 0.183 -62.9 125.4 NA NA NA
1t7n 1 P47934 91.12 0.0 X-RAY
 2004-06-22 SER A:420 A:428 34.0 0.296 -66.8 125.2 34.0 0.296 0.0 HOH
 2.644
 OG
 O
1t7o 1 P47934 91.12 0.0 X-RAY
 2004-06-22 SER A:420 A:428 33.0 0.287 -69.7 128.9 33.0 0.287 0.0 HOH
 2.734
 OG
 O
2h3w 1 Q3V1Y3 90.94 0.0 X-RAY
 2006-08-01 SER A:402 A:428 20.0 0.174 -67.2 122.5 20.0 0.174 0.0 COA
HOH
 2.695
2.687
 OG
OG
 O2A
O
SER B:402 B:428 20.0 0.174 -66.4 122.0 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p43155-f1 1 P43155 99.84 0.0 SER A:428 A:428 24.0 0.209 -68.6 122.9