Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr9 140707540 . C A CCDS7050.2:NM_024757.4:c.2950Cag>Aag_NP_079033.4:p.984Q>K Homo sapiens euchromatic histone lysine methyltransferase 1 (EHMT1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6by9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2018-01-31 GLN A:313 A:984 85.0 NA H -60.4 -39.1 85.0 NA NA
2igq 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2006-10-24 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2rfi 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2007-10-23 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo0 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo2 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo5 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sw9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2011-12-07 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3swc 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2011-11-30 GLN A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hna 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2009-06-09 GLN A:5 A:953 94.0 0.522 H -81.2 -24.6 94.0 0.522 0.0 HOH
 2.797
 N
 O
GLN B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ttg 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2017-02-01 GLN A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5v9j 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2018-03-21 GLN A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4i51 1 Q9H9B1 99.65 0.0 X-RAY
 2012-12-19 GLN A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3b7b 1 Q9H9B1 100.0 1e-166 X-RAY
 2008-02-12 GLN A:222 A:953 126.0 0.7 H -63.2 -44.2 126.0 0.7 0.0 SO4
 6.736
 CB
 O3
GLN B:222 B:953 134.0 0.744 H -74.6 -33.1 NA NA NA
3b95 1 Q5VT56 100.0 1e-166 X-RAY
 2008-02-12 GLN A:222 A:953 130.0 0.722 H -50.9 -44.1 130.0 0.722 0.0 SO4
HOH
 6.997
9.087
 CB
CB
 O4
O
GLN B:222 B:953 137.0 0.761 H -62.2 -37.0 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9h9b1-f1 1 Q9H9B1 100.0 0.0 GLN A:984 A:984 136.0 0.756 H -56.0 -38.0