Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr9 140707548 . G A CCDS7050.2:NM_024757.4:c.2958tgG>tgA_NP_079033.4:p.986W>* Homo sapiens euchromatic histone lysine methyltransferase 1 (EHMT1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6by9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2018-01-31 TRP A:315 A:986 95.0 0.373 H -56.3 -49.4 95.0 0.373 0.0
2igq 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2006-10-24 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2rfi 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2007-10-23 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo0 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo2 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP C:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP D:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo5 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2010-06-30 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP C:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP D:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sw9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2011-12-07 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP C:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3swc 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2011-11-30 TRP A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP C:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hna 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2009-06-09 TRP A:7 A:955 164.0 0.643 H -55.8 -46.7 164.0 0.643 0.0 HOH
 5.070
 N
 O
TRP B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ttg 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2017-02-01 TRP A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5v9j 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
 2018-03-21 TRP A:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP B:7 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4i51 1 Q9H9B1 99.65 0.0 X-RAY
 2012-12-19 TRP A:6 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
TRP C:6 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3b7b 1 Q9H9B1 100.0 1e-166 X-RAY
 2008-02-12 TRP A:224 A:955 56.0 0.22 H -66.3 -45.9 56.0 0.22 0.0
TRP B:224 B:955 67.0 0.263 H -49.0 -43.5 NA NA NA
3b95 1 Q5VT56 100.0 1e-166 X-RAY
 2008-02-12 TRP A:224 A:955 58.0 0.227 H -55.0 -46.0 58.0 0.227 0.0
TRP B:224 B:955 68.0 0.267 H -50.4 -44.2 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9h9b1-f1 1 Q9H9B1 100.0 0.0 TRP A:986 A:986 52.0 0.204 H -62.8 -42.8