Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr9 140707560 . G A CCDS7050.2:NM_024757.4:c.2970caG>caA_NP_079033.4:p.990Q>Q Homo sapiens euchromatic histone lysine methyltransferase 1 (EHMT1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
6by9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2018-01-31 GLN A:319 A:990 57.0 NA H -69.8 -25.3 57.0 NA NA
2igq 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2006-10-24 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2rfi 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2007-10-23 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo0 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2010-06-30 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo2 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2010-06-30 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3mo5 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2010-06-30 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3sw9 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2011-12-07 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3swc 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2011-11-30 GLN A:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:9 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3hna 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2009-06-09 GLN A:11 A:959 85.0 0.472 H -74.4 -37.0 85.0 0.472 0.0 HOH
4.685
N
O
GLN B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ttg 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2017-02-01 GLN A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5v9j 1 Q9H9B1 100.0 0.0 X-RAY
2018-03-21 GLN A:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4i51 1 Q9H9B1 99.65 0.0 X-RAY
2012-12-19 GLN A:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3b7b 1 Q9H9B1 100.0 1e-166 X-RAY
2008-02-12 GLN A:228 A:959 88.0 0.489 H -80.8 -47.3 88.0 0.489 0.0
GLN B:228 B:959 72.0 0.4 H -53.4 -58.7 NA NA NA
3b95 1 Q5VT56 100.0 1e-166 X-RAY
2008-02-12 GLN A:228 A:959 86.0 0.478 H -88.0 -45.8 86.0 0.478 0.0
GLN B:228 B:959 74.0 0.411 H -49.1 -59.1 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9h9b1-f1 1 Q9H9B1 100.0 0.0 GLN A:990 A:990 95.0 0.528 H -66.8 -43.6