Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr9 | 33113851 | . | A | C | CCDS6535.1:NM_001497.3:c.985Tct>Gct_NP_001488.2:p.329S>A | Homo sapiens beta-1,4-galactosyltransferase 1 (B4GALT1), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6fwt | 1 | P15291 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-10-10 | SER | A:208 | A:329 | 34.0 | 0.296 | B | -97.5 | 147.8 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
GOL HOH |
9.698 3.190 |
O HB2 |
HO3 O |
||
| 6fwu | 1 | P15291 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-10-10 | SER | A:204 | A:329 | 30.0 | 0.261 | B | -103.4 | 150.6 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
HOH |
5.739 |
HB3 |
O |
||
| SER | B:204 | B:329 | 30.0 | 0.261 | B | -103.5 | 152.6 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
HOH |
5.619 |
HG |
O |
|||||||||
| 4l41 | 2 | P15291 | 99.27 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-02 | SER | B:218 | C:329 | 29.0 | 0.252 | B | -102.8 | 134.8 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
HOH |
3.414 |
N |
O |
||
| 2ae7 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | SER | A:218 | A:329 | 32.0 | 0.278 | B | -98.3 | 142.0 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.421 3.427 |
OG N |
O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 30.0 | 0.261 | B | -96.5 | 140.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 31.0 | 0.27 | B | -96.8 | 139.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2aec | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -99.6 | 139.9 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.321 3.456 |
OG CA |
O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -97.4 | 139.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 30.0 | 0.261 | B | -94.6 | 140.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2aes | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | SER | A:218 | A:329 | 31.0 | 0.27 | B | -97.4 | 140.3 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.421 3.541 |
OG CA |
O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 30.0 | 0.261 | B | -98.1 | 139.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 32.0 | 0.278 | B | -93.9 | 140.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2agd | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | SER | A:218 | A:329 | 32.0 | 0.278 | B | -98.8 | 140.5 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.176 3.516 |
OG CA |
O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -98.5 | 140.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 33.0 | 0.287 | B | -94.6 | 141.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2ah9 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -99.5 | 140.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.357 3.432 |
OG N |
O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 31.0 | 0.27 | B | -96.7 | 140.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 33.0 | 0.287 | B | -95.4 | 142.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2fy7 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-14 | SER | A:218 | A:329 | 25.0 | 0.217 | B | -94.7 | 140.4 | 25.0 | 0.217 | 0.0 |
PGE HOH |
8.351 3.011 |
OG OG |
C6 O |
||
| 2fya | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-14 | SER | A:218 | A:329 | 25.0 | 0.217 | B | -99.8 | 141.3 | 25.0 | 0.217 | 0.0 |
PGE HOH |
8.415 2.895 |
OG OG |
C6 O |
||
| 2fyb | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-14 | SER | A:218 | A:329 | 25.0 | 0.217 | B | -94.6 | 140.2 | 25.0 | 0.217 | 0.0 |
HOH |
2.890 |
OG |
O |
||
| 3ee5 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2009-01-06 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -93.1 | 140.2 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.188 3.478 |
OG OG |
O4 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -97.7 | 137.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 33.0 | 0.287 | B | -92.6 | 141.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ee3 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 34.0 | 0.296 | B | -85.0 | 141.0 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
SO4 SO4 SO4 HOH |
4.196 4.608 6.293 3.256 |
OG OG N N |
O3 O4 O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 30.0 | 0.261 | B | -96.5 | 136.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 34.0 | 0.296 | B | -94.5 | 142.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ee4 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -95.3 | 145.4 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 SO4 HOH |
4.409 6.414 3.450 |
OG N CA |
O2 O1 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -90.1 | 141.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 33.0 | 0.287 | B | -92.1 | 141.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ee5 | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 34.0 | 0.296 | B | -95.2 | 144.2 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.395 3.103 |
OG N |
O2 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 34.0 | 0.296 | B | -87.5 | 135.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 32.0 | 0.278 | B | -87.9 | 140.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4eea | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -97.4 | 144.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 SO4 HOH |
4.337 6.381 3.484 |
OG N CA |
O2 O4 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -92.4 | 139.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 31.0 | 0.27 | B | -95.8 | 142.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4eeg | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -89.5 | 144.7 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.613 3.576 |
OG CA |
O2 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 33.0 | 0.287 | B | -87.2 | 136.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 34.0 | 0.296 | B | -89.3 | 142.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4eem | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 33.0 | 0.287 | B | -91.4 | 141.1 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.519 3.705 |
OG CA |
O3 O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -91.2 | 135.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 31.0 | 0.27 | B | -88.6 | 144.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4eeo | 1 | P15291 | 98.9 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-04 | SER | A:218 | A:329 | 32.0 | 0.278 | B | -88.6 | 143.1 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
HOH |
3.689 |
CA |
O |
||
| SER | B:218 | B:329 | 32.0 | 0.278 | B | -84.3 | 134.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:218 | C:329 | 35.0 | 0.304 | B | -84.4 | 140.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1fr8 | 1 | P08037 | 89.24 | 0.0 |
X-RAY |
2000-09-20 | SER | A:219 | A:333 | 28.0 | 0.243 | B | -97.0 | 135.4 | 28.0 | 0.243 | 0.0 |
GDU HOH |
9.724 6.767 |
N OG |
O4 O |
||
| SER | B:219 | B:333 | 32.0 | 0.278 | B | -108.9 | 136.4 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
HOH |
6.141 |
N |
O |
|||||||||
| 1fgx | 1 | P08037 | 88.89 | 0.0 |
X-RAY |
2000-08-16 | SER | A:219 | A:333 | 30.0 | 0.261 | B | -94.5 | 144.6 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
HOH |
3.420 |
OG |
O |
||
| SER | B:219 | B:333 | 31.0 | 0.27 | B | -101.0 | 141.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nf5 | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2002-12-25 | SER | B:217 | B:333 | 32.0 | 0.278 | B | -93.0 | 141.4 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
PG4 HOH |
9.339 2.814 |
OG OG |
C3 O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 30.0 | 0.261 | B | -98.9 | 142.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nhe | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-07 | SER | B:217 | B:333 | 29.0 | 0.252 | B | -87.5 | 151.4 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
HOH |
5.353 |
N |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 26.0 | 0.226 | B | -90.4 | 143.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nkh | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-14 | SER | B:217 | B:333 | 29.0 | 0.252 | B | -100.9 | 145.1 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
HOH |
3.222 |
CB |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 30.0 | 0.261 | B | -97.8 | 140.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nqi | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-02-04 | SER | B:217 | B:333 | 35.0 | 0.304 | B | -94.0 | 144.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
3.542 |
N |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 29.0 | 0.252 | B | -99.1 | 145.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nwg | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-02-18 | SER | B:217 | B:333 | 34.0 | 0.296 | B | -105.9 | 146.0 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
3.203 |
OG |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 26.0 | 0.226 | B | -122.7 | 128.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1o23 | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-02-25 | SER | B:217 | B:333 | 30.0 | 0.261 | B | -97.8 | 144.2 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
HOH |
3.103 |
OG |
O |
||
| SER | D:217 | D:735 | 29.0 | 0.252 | B | -91.4 | 139.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1oqm | 2 | P08037 | 90.48 | 0.0 |
X-RAY |
2003-03-18 | SER | B:217 | B:333 | 35.0 | 0.304 | B | -89.3 | 138.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
3.724 |
N |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 30.0 | 0.261 | B | -94.2 | 145.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1nmm | 2 | P08037 | 90.11 | 0.0 |
X-RAY |
2003-01-21 | SER | B:217 | B:333 | 35.0 | 0.304 | B | -92.5 | 138.7 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
2.584 |
OG |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 30.0 | 0.261 | B | -99.2 | 145.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1o0r | 1 | P08037 | 90.11 | 0.0 |
X-RAY |
2003-03-04 | SER | A:217 | A:333 | 31.0 | 0.27 | B | -94.7 | 142.3 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
SO4 HOH |
5.878 3.409 |
OG OG |
O3 O |
||
| SER | B:217 | B:333 | 28.0 | 0.243 | B | -97.9 | 138.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1yro | 2 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2005-03-22 | SER | B:217 | B:333 | 31.0 | 0.27 | B | -89.9 | 140.9 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
HOH |
2.807 |
OG |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 29.0 | 0.252 | B | -100.1 | 139.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1tvy | 1 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2004-12-14 | SER | A:217 | A:333 | 31.0 | 0.27 | B | -93.8 | 143.1 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
SO4 HOH |
5.803 3.592 |
OG CB |
O4 O |
||
| SER | B:217 | B:333 | 33.0 | 0.287 | B | -95.6 | 142.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1tw1 | 1 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2004-12-14 | SER | A:217 | A:333 | 30.0 | 0.261 | B | -96.7 | 146.3 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
SO4 HOH |
5.461 2.776 |
OG OG |
O1 O |
||
| SER | B:217 | B:333 | 34.0 | 0.296 | B | -94.0 | 138.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1tw5 | 1 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2004-12-14 | SER | A:217 | A:333 | 29.0 | 0.252 | B | -97.5 | 141.9 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
SO4 HOH |
5.880 3.216 |
OG OG |
O2 O |
||
| SER | B:217 | B:333 | 33.0 | 0.287 | B | -93.3 | 135.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2fyc | 2 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-14 | SER | B:217 | B:333 | 31.0 | 0.27 | B | -89.6 | 139.0 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
HOH |
3.575 |
CA |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 30.0 | 0.261 | B | -97.8 | 145.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4krv | 1 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2013-08-28 | SER | A:217 | A:333 | 32.0 | 0.278 | B | -92.6 | 135.2 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
SO4 SO4 HOH |
4.769 5.787 3.697 |
OG OG CA |
O4 O4 O |
||
| SER | B:217 | B:333 | 30.0 | 0.261 | B | -94.0 | 141.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1pzt | 1 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2003-09-16 | SER | A:217 | A:333 | 33.0 | 0.287 | B | -99.0 | 139.9 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
SO4 HOH |
5.907 5.999 |
OG N |
O2 O |
||
| 1pzy | 2 | P08037 | 89.74 | 0.0 |
X-RAY |
2003-09-02 | SER | B:217 | B:333 | 29.0 | 0.252 | B | -89.4 | 147.3 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
HOH |
3.969 |
CA |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 29.0 | 0.252 | B | -92.0 | 146.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2fyd | 2 | 21450879 | 89.38 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-14 | SER | B:217 | B:333 | 32.0 | 0.278 | B | -94.5 | 139.5 | 32.0 | 0.278 | 0.0 |
HOH |
3.454 |
OG |
O |
||
| SER | D:217 | D:333 | 29.0 | 0.252 | B | -96.7 | 138.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p15291-f1 | 1 | P15291 | 100.0 | 0.0 | SER | A:329 | A:329 | 26.0 | 0.226 | B | -72.1 | 140.7 | |