Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chrX | 135741344 | . | C | A | CCDS14659.1:NM_000074.2:c.556Caa>Aaa_NP_000065.1:p.186Q>K | Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1aly | 1 | P29965 | 100.0 | 9e-107 |
X-RAY |
1997-09-17 | GLN | A:71 | A:186 | 118.0 | 0.656 | S | -124.0 | -21.1 | 118.0 | 0.656 | 0.0 |
HOH |
2.395 |
HE22 |
H2 |
||
| 1i9r | 1 | P29965 | 100.0 | 9e-107 |
X-RAY |
2002-03-20 | GLN | A:71 | A:186 | 115.0 | 0.639 | S | 37.3 | -130.9 | 115.0 | 0.639 | 0.0 | ||||||
| GLN | B:71 | B:186 | 114.0 | 0.633 | S | 36.2 | -133.5 | 114.0 | 0.633 | 0.0 | |||||||||||||
| GLN | C:71 | C:186 | 116.0 | 0.644 | S | 36.3 | -132.6 | 116.0 | 0.644 | 0.0 | |||||||||||||
| 6w9g | 1 | P29965 | 100.0 | 9e-107 |
X-RAY |
2020-12-23 | GLN | A:71 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:71 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | C:71 | C:186 | 130.0 | 0.722 | 360.0 | 132.4 | 101.0 | 0.561 | 0.161 |
B:P29965:0.161 |
TRS TMO HOH |
5.623 5.710 4.118 |
NE2 O N |
O2 CAA O |
|||||||||
| 7sgm | 1 | P29965 | 100.0 | 9e-107 |
X-RAY |
2022-02-02 | GLN | A:71 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:71 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | C:71 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3qd6 | 1 | P29965 | 100.0 | 1e-106 |
X-RAY |
2011-02-02 | GLN | A:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | C:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | D:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | E:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | F:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6brb | 1 | P29965 | 100.0 | 5e-103 |
X-RAY |
2018-12-05 | GLN | A:67 | A:186 | 202.0 | 1.0 | S | -66.8 | 78.6 | 170.0 | 0.944 | 0.056 |
B:None:0.178 |
HOH |
3.770 |
N |
O |
|
| 3lkj | 1 | P29965 | 100.0 | 6e-102 |
X-RAY |
2011-02-02 | GLN | A:66 | A:186 | 190.0 | 1.0 | -118.7 | 38.6 | 190.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
5.790 |
C |
O |
|||
| GLN | B:66 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLN | C:66 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p29965-f1 | 1 | P29965 | 100.0 | 0.0 | GLN | A:186 | A:186 | 185.0 | 1.0 | S | -66.3 | -11.0 | |