Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chrX | 133620501 | . | C | A | CCDS14641.1:NM_000194.2:c.325Cag>Aag_NP_000185.1:p.109Q>K | Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1bzy | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
1999-06-22 | GLN | A:108 | A:108 | 118.0 | 0.656 | E | -118.6 | 139.0 | 118.0 | 0.656 | 0.0 |
MG IMU POP HOH |
8.220 7.208 6.870 5.934 |
O C O N |
MG O3P O6 O |
||
GLN | B:108 | B:108 | 116.0 | 0.644 | E | -135.1 | 151.6 | 116.0 | 0.644 | 0.0 |
MG IMU POP HOH |
8.268 7.042 6.971 4.834 |
O C O N |
MG O3P O6 O |
|||||||||
GLN | C:108 | C:108 | 115.0 | 0.639 | E | -135.4 | 155.7 | 115.0 | 0.639 | 0.0 |
MG IMU POP HOH |
8.449 7.186 7.150 5.972 |
O C O N |
MG O3P O4 O |
|||||||||
GLN | D:108 | D:108 | 133.0 | 0.739 | E | -133.1 | 149.0 | 133.0 | 0.739 | 0.0 |
MG IMU POP HOH |
8.322 6.978 7.128 4.596 |
O C O CA |
MG O1P O6 O |
|||||||||
1hmp | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
1995-06-03 | GLN | A:108 | A:108 | 147.0 | 0.817 | 49.4 | 176.3 | 147.0 | 0.817 | 0.0 | |||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1z7g | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2005-08-02 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3gep | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2009-08-18 | GLN | A:108 | A:108 | 86.0 | NA | -134.5 | -13.4 | 86.0 | NA | NA |
24H HOH |
7.311 4.433 |
N O |
OAF O |
|||
GLN | B:108 | B:108 | 65.0 | NA | S | -117.9 | -176.0 | 65.0 | NA | NA |
HOH |
3.752 |
O |
O |
|||||||||
3ggc | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2009-08-18 | GLN | A:108 | A:108 | 117.0 | NA | 360.0 | -39.7 | 117.0 | NA | NA |
H26 HOH |
7.867 4.445 |
N O |
OAD O |
|||
GLN | B:108 | B:108 | 144.0 | 0.8 | S | -91.1 | -159.2 | 144.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
3.395 |
O |
O |
|||||||||
3ggj | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2009-08-18 | GLN | A:108 | A:108 | 82.0 | NA | S | -86.9 | -14.3 | 82.0 | NA | NA |
25H HOH |
8.482 4.538 |
N O |
OAD O |
||
GLN | B:108 | B:108 | 110.0 | NA | 360.0 | 165.1 | 110.0 | NA | NA |
HOH |
3.204 |
O |
O |
||||||||||
4rab | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4rac | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4rad | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | E:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | F:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | G:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | H:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ran | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4rao | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4raq | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | GLN | A:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:108 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4ijq | 1 | P00492 | 100.0 | 4e-161 |
X-RAY |
2013-03-27 | GLN | A:114 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:114 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:114 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:114 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4kn6 | 1 | P00492 | 100.0 | 1e-160 |
X-RAY |
2013-08-14 | GLN | A:107 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6bnj | 1 | P00492 | 99.08 | 6e-160 |
X-RAY |
2017-12-06 | GLN | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5hia | 1 | P00492 | 99.08 | 8e-160 |
X-RAY |
2017-01-18 | GLN | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5brn | 1 | P00492 | 98.62 | 3e-159 |
X-RAY |
2015-10-14 | GLN | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5bsk | 1 | P00492 | 98.62 | 3e-159 |
X-RAY |
2015-09-23 | GLN | A:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:109 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5w8v | 1 | P00492 | 100.0 | 7e-159 |
X-RAY |
2017-08-30 | GLN | A:106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | C:106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
GLN | D:106 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1d6n | 1 | P00492 | 99.07 | 6e-157 |
X-RAY |
1999-12-30 | GLN | A:105 | A:108 | 157.0 | 0.872 | S | 73.0 | -147.9 | 157.0 | 0.872 | 0.0 |
PPO PRP |
9.127 8.204 |
O O |
N8 O1P |
||
GLN | B:105 | B:108 | 128.0 | 0.711 | S | -68.9 | 172.7 | 128.0 | 0.711 | 0.0 |
PPO PRP HOH |
7.208 9.141 6.427 |
O O O |
N3 O1P O |
|||||||||
2vfa | 1 | P20035,P00492 | 80.48 | 3e-122 |
X-RAY |
2008-06-17 | GLN | A:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
GLN | B:117 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p00492-f1 | 1 | P00492 | 100.0 | 2e-162 | GLN | A:109 | A:109 | 159.0 | 0.883 | S | -135.0 | 120.6 |