Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chrX 133620501 . C A CCDS14641.1:NM_000194.2:c.325Cag>Aag_NP_000185.1:p.109Q>K Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1bzy 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
1999-06-22 GLN A:108 A:108 118.0 0.656 E -118.6 139.0 118.0 0.656 0.0 MG
IMU
POP
HOH
8.220
7.208
6.870
5.934
O
C
O
N
MG
O3P
O6
O
GLN B:108 B:108 116.0 0.644 E -135.1 151.6 116.0 0.644 0.0 MG
IMU
POP
HOH
8.268
7.042
6.971
4.834
O
C
O
N
MG
O3P
O6
O
GLN C:108 C:108 115.0 0.639 E -135.4 155.7 115.0 0.639 0.0 MG
IMU
POP
HOH
8.449
7.186
7.150
5.972
O
C
O
N
MG
O3P
O4
O
GLN D:108 D:108 133.0 0.739 E -133.1 149.0 133.0 0.739 0.0 MG
IMU
POP
HOH
8.322
6.978
7.128
4.596
O
C
O
CA
MG
O1P
O6
O
1hmp 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
1995-06-03 GLN A:108 A:108 147.0 0.817 49.4 176.3 147.0 0.817 0.0
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1z7g 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2005-08-02 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3gep 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2009-08-18 GLN A:108 A:108 86.0 NA -134.5 -13.4 86.0 NA NA 24H
HOH
7.311
4.433
N
O
OAF
O
GLN B:108 B:108 65.0 NA S -117.9 -176.0 65.0 NA NA HOH
3.752
O
O
3ggc 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2009-08-18 GLN A:108 A:108 117.0 NA 360.0 -39.7 117.0 NA NA H26
HOH
7.867
4.445
N
O
OAD
O
GLN B:108 B:108 144.0 0.8 S -91.1 -159.2 144.0 0.8 0.0 HOH
3.395
O
O
3ggj 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2009-08-18 GLN A:108 A:108 82.0 NA S -86.9 -14.3 82.0 NA NA 25H
HOH
8.482
4.538
N
O
OAD
O
GLN B:108 B:108 110.0 NA 360.0 165.1 110.0 NA NA HOH
3.204
O
O
4rab 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rac 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rad 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN E:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN F:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN G:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN H:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ran 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rao 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4raq 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
2015-01-07 GLN A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ijq 1 P00492 100.0 4e-161 X-RAY
2013-03-27 GLN A:114 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:114 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:114 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:114 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4kn6 1 P00492 100.0 1e-160 X-RAY
2013-08-14 GLN A:107 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6bnj 1 P00492 99.08 6e-160 X-RAY
2017-12-06 GLN A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5hia 1 P00492 99.08 8e-160 X-RAY
2017-01-18 GLN A:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5brn 1 P00492 98.62 3e-159 X-RAY
2015-10-14 GLN A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5bsk 1 P00492 98.62 3e-159 X-RAY
2015-09-23 GLN A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5w8v 1 P00492 100.0 7e-159 X-RAY
2017-08-30 GLN A:106 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:106 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN C:106 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN D:106 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1d6n 1 P00492 99.07 6e-157 X-RAY
1999-12-30 GLN A:105 A:108 157.0 0.872 S 73.0 -147.9 157.0 0.872 0.0 PPO
PRP
9.127
8.204
O
O
N8
O1P
GLN B:105 B:108 128.0 0.711 S -68.9 172.7 128.0 0.711 0.0 PPO
PRP
HOH
7.208
9.141
6.427
O
O
O
N3
O1P
O
2vfa 1 P20035,P00492 80.48 3e-122 X-RAY
2008-06-17 GLN A:117 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLN B:117 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p00492-f1 1 P00492 100.0 2e-162 GLN A:109 A:109 159.0 0.883 S -135.0 120.6