Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chrX 133620505 . C A CCDS14641.1:NM_000194.2:c.329tCa>tAa_NP_000185.1:p.110S>* Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1bzy 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 1999-06-22 SER A:109 A:109 15.0 0.13 E -87.8 120.3 15.0 0.13 0.0 MG
IMU
POP
HOH
 9.388
4.323
7.304
2.729
 CA
CB
CA
OG
 MG
O3P
O6
O
SER B:109 B:109 31.0 0.27 E -82.5 138.0 31.0 0.27 0.0 MG
MG
IMU
POP
HOH
 9.874
9.249
4.405
7.081
2.690
 CB
CA
CB
CA
OG
 MG
MG
O3P
O6
O
SER C:109 C:109 22.0 0.191 E -76.4 147.4 22.0 0.191 0.0 MG
IMU
POP
HOH
 9.348
4.776
7.392
3.003
 CA
CB
CA
OG
 MG
O3P
O6
O
SER D:109 D:109 14.0 0.122 E -81.0 132.1 14.0 0.122 0.0 MG
IMU
POP
HOH
 9.250
4.364
7.206
2.679
 CA
CB
CA
OG
 MG
O1P
O6
O
1hmp 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 1995-06-03 SER A:109 A:109 103.0 0.896 132.2 152.3 103.0 0.896 0.0
SER B:109 B:109 94.0 NA 360.0 -176.2 94.0 NA NA
1z7g 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2005-08-02 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3gep 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2009-08-18 SER A:109 A:109 87.0 0.757 S -131.9 50.2 87.0 0.757 0.0 24H
HOH
 6.900
3.096
 C
C
 OAC
O
SER B:109 B:109 100.0 0.87 S 46.6 -96.7 100.0 0.87 0.0 HOH
 5.010
 C
 O
3ggc 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2009-08-18 SER A:109 A:109 57.0 0.496 -135.3 79.7 57.0 0.496 0.0 H26
HOH
 6.840
2.801
 C
C
 OAE
O
SER B:109 B:109 100.0 0.87 S 47.5 -74.9 100.0 0.87 0.0 HOH
 2.491
 OG
 O
3ggj 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2009-08-18 SER A:109 A:109 57.0 0.496 -148.9 77.7 57.0 0.496 0.0 25H
HOH
 6.893
2.710
 C
CA
 OAE
O
SER B:109 B:109 128.0 1.0 40.3 360.0 128.0 1.0 0.0 HOH
 2.981
 OG
 O
4rab 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rac 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rad 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER E:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER F:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER G:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER H:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ran 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4rao 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4raq 1 P00492 100.0 3e-161 X-RAY
 2015-01-07 SER A:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:109 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ijq 1 P00492 100.0 4e-161 X-RAY
 2013-03-27 SER A:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:115 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4kn6 1 P00492 100.0 1e-160 X-RAY
 2013-08-14 SER A:108 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6bnj 1 P00492 99.08 6e-160 X-RAY
 2017-12-06 SER A:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5hia 1 P00492 99.08 8e-160 X-RAY
 2017-01-18 SER A:116 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:116 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:116 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:116 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5brn 1 P00492 98.62 3e-159 X-RAY
 2015-10-14 SER A:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5bsk 1 P00492 98.62 3e-159 X-RAY
 2015-09-23 SER A:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:110 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5w8v 1 P00492 100.0 7e-159 X-RAY
 2017-08-30 SER A:107 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:107 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER C:107 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER D:107 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1d6n 1 P00492 99.07 6e-157 X-RAY
 1999-12-30 SER A:106 A:109 122.0 1.0 -82.3 143.2 122.0 1.0 0.0 PRP
 8.836
 O
 O1P
SER B:106 B:109 87.0 0.757 -72.1 162.4 87.0 0.757 0.0 PPO
PRP
HOH
 8.983
8.429
4.223
 C
C
O
 N3
O1P
O
2vfa 1 P20035,P00492 80.48 3e-122 X-RAY
 2008-06-17 SER A:118 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:118 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p00492-f1 1 P00492 100.0 2e-162 SER A:110 A:110 110.0 0.957 -64.3 93.9