Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chrX | 133620522 | . | G | A | CCDS14641.1:NM_000194.2:c.346Gta>Ata_NP_000185.1:p.116V>I | Homo sapiens hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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N O |
O6 O |
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POP HOH |
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N C |
O6 O |
|||||||||
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POP HOH |
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N N |
O6 O |
||||||||||
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POP HOH |
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N CG2 |
O6 O |
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X-RAY |
1995-06-03 | VAL | A:115 | A:115 | 76.0 | NA | S | -72.8 | -37.9 | 76.0 | NA | NA | ||||||
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HOH |
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CB |
O |
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X-RAY |
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HOH |
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O |
O |
||
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HOH |
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CA |
O |
||||||||||
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X-RAY |
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HOH |
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CG1 |
O |
||
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HOH |
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O |
O |
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X-RAY |
2009-08-18 | VAL | A:115 | A:115 | 51.0 | 0.329 | B | -67.6 | 137.7 | 51.0 | 0.329 | 0.0 |
HOH |
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N |
O |
||
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HOH |
7.272 |
CG1 |
O |
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X-RAY |
2009-08-18 | VAL | A:115 | A:115 | 50.0 | 0.323 | E | -76.0 | 133.3 | 50.0 | 0.323 | 0.0 |
HOH |
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N |
O |
||
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HOH |
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O |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2015-01-07 | VAL | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
4.712 |
O |
O |
|||||||||
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HOH |
2.451 |
N |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2015-01-07 | VAL | A:115 | A:115 | 50.0 | 0.323 | E | -102.0 | 123.6 | 50.0 | 0.323 | 0.0 |
HOH |
2.530 |
O |
O |
||
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HOH |
5.976 |
CG1 |
O |
|||||||||
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HOH |
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O |
O |
|||||||||
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HOH |
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C |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2015-01-07 | VAL | A:115 | A:115 | 88.0 | 0.568 | 360.0 | 102.5 | 88.0 | 0.568 | 0.0 |
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HA O |
H6 O |
|||
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3L5 HOH |
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HA O |
H3 O |
|||||||||
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3L5 HOH |
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HA O |
H4 O |
|||||||||
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3L5 HOH |
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HA HG11 |
H3 O |
||||||||||
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X-RAY |
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N |
NAA |
|||
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CA |
NAA |
||||||||||
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3L6 |
8.727 |
N |
NAA |
||||||||||
| 4rao | 1 | P00492 | 100.0 | 3e-161 |
X-RAY |
2015-01-07 | VAL | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
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CG2 |
O |
||||||||||
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HOH |
8.074 |
CA |
O |
|||||||||
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HOH |
6.906 |
CB |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2015-01-07 | VAL | A:115 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
4.889 |
CG1 |
O |
||||||||||
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X-RAY |
2013-03-27 | VAL | A:121 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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HOH |
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N |
O |
|||||||||
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N |
O |
|||||||||
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O |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2013-08-14 | VAL | A:114 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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X-RAY |
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HOH |
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CA |
O |
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HOH |
4.320 |
O |
O |
||||||||||
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HOH |
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CG2 |
O |
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X-RAY |
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CG1 |
O |
|||
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HOH |
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O |
O |
|||||||||
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HOH |
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O |
O |
|||||||||
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HOH |
3.574 |
CG1 |
O |
|||||||||
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X-RAY |
2015-10-14 | VAL | A:116 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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| 5bsk | 1 | P00492 | 98.62 | 3e-159 |
X-RAY |
2015-09-23 | VAL | A:116 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | B:116 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | C:116 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | D:116 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
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X-RAY |
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C |
O |
||
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HOH |
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N |
O |
|||||||||
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HOH |
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N |
O |
|||||||||
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HOH |
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CG1 |
O |
|||||||||
| 1d6n | 1 | P00492 | 99.07 | 6e-157 |
X-RAY |
1999-12-30 | VAL | A:112 | A:115 | 66.0 | 0.426 | -57.4 | 122.3 | 66.0 | 0.426 | 0.0 |
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O |
O |
|||
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O3 O |
||||||||||
| 2vfa | 1 | P20035,P00492 | 80.48 | 3e-122 |
X-RAY |
2008-06-17 | VAL | A:124 | A:124 | 14.0 | 0.09 | B | -103.0 | 135.0 | 14.0 | 0.09 | 0.0 |
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||
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7.359 |
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O |
|||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p00492-f1 | 1 | P00492 | 100.0 | 2e-162 | VAL | A:116 | A:116 | 37.0 | 0.239 | E | -78.7 | 129.2 | |