Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chrX 135736589 . G A CCDS14659.1:NM_000074.2:c.346Ggt>Agt_NP_000065.1:p.116G>S Homo sapiens CD40 ligand (CD40LG), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1aly 1 P29965 100.0 9e-107 X-RAY
 1997-09-17 GLY A:1 A:116 84.0 1.0 360.0 131.9 84.0 1.0 0.0 HOH
 4.634
 H3
 H1
1i9r 1 P29965 100.0 9e-107 X-RAY
 2002-03-20 GLY A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6w9g 1 P29965 100.0 9e-107 X-RAY
 2020-12-23 GLY A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7sgm 1 P29965 100.0 9e-107 X-RAY
 2022-02-02 GLY A:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:1 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3qd6 1 P29965 100.0 1e-106 X-RAY
 2011-02-02 GLY A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY B:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY C:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY D:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY E:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
GLY F:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p29965-f1 1 P29965 100.0 0.0 GLY A:116 A:116 61.0 0.813 -53.1 125.1